2019

  • Décrire la dynamique des protéines intrinsèquement désordonnées jusqu’à dans la cellule

    2019

    Les scientifiques estiment qu’un tiers des protéines humaines sont intrinsèquement désordonnées (PIDs), c’est à dire sans structure tridimensionnelle stable. Très flexibles, elles peuvent s’adapter à plusieurs partenaires physiologiques et adoptent une multitude de conformations. Leur fonctionnement reste peu compris même si elles jouent des rôles essentiels dans toutes les organismes vivants. Les chercheurs du groupe FDP de l’IBS font appel à la spectroscopie RMN (résonance magnétique nucléaire) pour (...)
  • Un candidat pour le développement de vaccins contre le VIH-1

    2019

    La clef du développement d’un vaccin contre le VIH est l’induction d’anticorps neutralisants à large spectre (bnAb). Les classes de bnAb actuellement connues sont dirigées contre six régions fonctionnelles de la protéine d’enveloppe du VIH. Plusieurs bnAb puissants qui ciblent un épitope très conservé situé sur gp41 ont été identifiés. Des candidats pour le développement d’un vaccin basé sur des peptides mimant cet épitope ont été testés sans succès. Quelle est la raison de ces échecs ? Dans cette étude, les (...)
  • Sigrid Milles (IBS/FDP) prix Paoletti 2019

    2019

    Sigrid Milles a reçu, le 30 octobre 2019 au siège du CNRS, le Prix Paoletti 2019 pour son travail sur les protéines intrinsèquement désordonnées par fluorescence à molécules unique et résonance magnétique nucléaire (RMN). Détails. Ce prix prestigieux, crée en mémoire de Claude Paoletti, ancien directeur scientifique du département des sciences de la vie du CNRS, récompense un jeune chercheur en biologie, toutes disciplines (...)
  • Inauguration départementale de la fête la science 2019 sur le Campus EPN

    2019

    Pour l’inauguration départementale de la fête de la science 2019, le Campus EPN a ouvert ses portes le 03 octobre matin avec des visites des plateformes Résonance Magnétique Nucléaire (RMN) et de microscopie électronique de l’IBS, du tunnel de l’ESRF, de la plateforme partenariale EMBL-IBS de cristallographie à haut-débit de protéines, du bâtiment des Sciences et de deux laboratoires communs ILL-ESRF. La cérémonie de lancement a eu lieu à l’IBS en présence de Madame Chloé Lombard, représentant Monsieur (...)
  • Des pseudo-adénovirus chimériques pour combattre les virus émergents

    2019

    Les maladies infectieuses continuent de décimer les populations dans le monde entier. Parmi les moyens dont nous disposons pour contrer ces menaces, la vaccination s’est avérée exceptionnellement puissante. La variole a été éradiquée, la rougeole et la poliomyélite sont contrôlés par la vaccination. Cependant, de graves menaces pèsent toujours comme en témoignent les épidémies causées par les virus Ebola ou Zika. Un autre exemple récent est le virus Chikungunya, un pathogène viral transmis par la piqûre du (...)
  • Détermination de la structure à résolution atomique d’un complexe enzymatique en combinant RMN et cryo-ME

    2019

    Compte-tenu de leur complexité, la détermination de la structure des machineries biologiques de haut poids moléculaire reste souvent un défi pour chacune des méthodes expérimentales à la disposition des structuralistes. Les chercheurs des groupes MEM, NMR et DYNAMOP de l’IBS, en collaboration avec l’université de Francfort et du NIH, ont mis en place une approche intégrée permettant la détermination de la structure d’assemblages de protéines de haut poids moléculaire. Le protocole de calcul mis en place (...)
  • La dynamique des résidus aromatiques d’une protéine de 0.5 MDa vue par RMN du solide

    2019

    Les résidus aromatiques jouent des rôles clés dans beaucoup de protéines, et sont impliqués notamment dans les interactions protéine-ligand et protéine-protéine. Présents également dans leur cœur hydrophobe, les résidus aromatiques sont cruciaux pour la stabilité des protéines. Pour ces raisons, l’étude de leur dynamique peut donner des informations riches sur les mécanismes réactionnels et le repliement. Bien que des approches de RMN du liquide se soient intéressées aux résidus aromatiques depuis des (...)
  • Mécanisme d’activation allostérique d’une enzyme par un inhibiteur

    2019

    La découverte qu’un inhibiteur active une enzyme semble contre-intuitive. Comment un inhibiteur, qui se lie au site actif, peut-il augmenter l’activité de l’enzyme ? Dans cette étude, des chercheurs de l’IBS (groupes RMN, MICA et PG), en collaboration avec des collègues de Nancy et de Saragosse, ont révélé comment la grande protéase ClpP de 300 kDa subit cette intrigante activation allostérique par un inhibiteur ainsi que par des substrats. Une approche multi-technique, impliquant la cristallographie (...)
  • Morphologie cellulaire et dynamique des nucléoïdes chez D. radiodurans

    2019

    Dans cet article, les chercheurs IBS de l’équipe Timmins (groupe VIC), en collaboration avec l’équipe Bourgeois (groupe DYNAMOP), ont mis en évidence l’organisation et la dynamique du nucléoïde de la bactérie radiorésistante, Deinococcus radiodurans, par des approches de microscopies de fluorescence conventionnelles et de super-résolution. Ces travaux ont révélé pour la première fois que les nucléoïdes bactériens sont des entités complexes qui changent de structure en fonction du cycle cellulaire et (...)
  • Structure de la nucléocapside du virus Hantaan révélée à 3.3 Å de résolution par cryo-ME

    2019

    Le virus Hantaan, qui appartient à la famille des Hantaviridae (ordre Bunyavirales) est transmis par les rongeurs. Il peut provoquer chez l’Homme des fièvres hémorragiques fatales contre lesquelles aucun traitement n’existe. Les segments génomiques de ce virus à ARN négatif sont entourés de multiples copies de la nucléoprotéine pour former des nucléocapsides hélicoïdales. Le groupe de Microscopie et Méthodes de l’IBS a utilisé les dernières avancées en cryo-microscopie électronique et a pu déterminer la (...)
  • Importance de la structure tertiaire d’un lncRNA dans des processus cellulaires importants

    2019

    Il existe plusieurs mécanismes cellulaires pour lutter contre le cancer. Un des acteurs majeurs est la protéine p53 qui, lorsqu’elle devient inactive, augmente fortement le risque de développement cancéreux. Maternally expressed 3 (MEG3), un ARN long non codant (lncRNA, > 500 kDa), est une autre molécule qui prévient le cancer de par son activité stimulatrice sur p53. Les résultats d’une étude sur la structure de MEG3, publiés dans Molecular Cell, pourraient aider à faire progresser le diagnostic et le (...)
  • Une stratégie pour réduire les intermittences de fluorescence en sptPALM

    2019

    La microscopie super-résolution permet d’observer la matière vivante à l’échelle nanoscopique, non seulement d’un point de vue structural mais aussi d’un point de vue dynamique. Dans ce dernier cas, il s’agit le plus souvent de suivre des molécules cibles individuelles lorsqu’elles diffusent dans une cellule : c’est la technique « sptPALM » (single-particle-tracking localization microscopy). Cependant, un important obstacle à cette technique concerne l’imperfection des marqueurs fluorescents utilisés (...)
  • Mécanisme d’assemblage de pores sur la surface bactérienne : une stratégie pour secréter des toxines

    2019

    Les bactéries ont développé différents systèmes de sécrétion qui leur permettent de secréter des toxines vers l’extérieur de la cellule. Ces machineries sont importantes pour les processus d’infection, colonisation et communication microbienne. Un élément important de plusieurs de ces machineries est la sécrétine, protéine membranaire qui forme un pore sur la surface bactérienne permettant la sortie des toxines. En utilisant les techniques de cryo-microscopie électronique, cristallographie, et génétique (...)
  • Un double étiquetage pour faciliter l’étude des Glycosaminoglycanes

    2019

    Les Héparanes sulfate (HS) sont des polysaccharides sulfatés de la famille des Glycosaminoglycanes qui participent à de nombreux processus cellulaires du fait de leur capacité à interagir et à moduler un large éventail de protéines de signalisation. Ces interactions font intervenir des motifs d’HS particuliers, définis par leur séquence saccharidique et leur profil de sulfatation. Cependant, les caractéristiques structurales de ces motifs fonctionnels demeurent la plupart du temps mal connues, du fait (...)
  • Cibler des protéines de l’hôte pour lutter contre la grippe

    2019

    De nouvelles stratégies thérapeutiques ciblant la grippe sont activement recherchées en raison des limites des médicaments actuellement disponibles, notamment les phénomènes de résistance spontanée. La thérapie dirigée contre l’hôte est un concept émergent visant à cibler certaines fonctions de l’hôte impliquées dans le cycle des pathogènes et/ou la pathogenèse, plutôt que cibler directement les composants propres de ces pathogènes. Dans cette optique, des chercheurs du groupe VRM, en collaboration avec (...)
  • Comment les virus se libèrent des cellules après les avoir infectées

    2019

    De nombreux processus cellulaire tels que le bourgeonnement des virus enveloppés et la cytokinèse nécessitent un remodelage important des membranes cellulaires. Ces modifications de la structure de la membrane sont catalysées par une machinerie appelée endosomal sorting complex required for transport (ESCRT). La famille de protéine ESCRT-III s’assemble en structures, observées in vivo et in vitro, en forme de spirales ou tubes situées sur la surface intérieure de la membrane. Les complexes ESCRT-III (...)
  • Martin Blackledge, lauréat d’une prestigieuse bourse européenne « ERC Advanced » 2019

    2019

    Le Conseil européen de la recherche (European Research Council , ERC) vient de décerner une bourse "Advanced Grant" à Martin Blackledge, chercheur de l’Institut de Biologie Structurale de Grenoble (IBS - unité mixte de recherche CEA/CNRS/UGA), dans le cadre d’un projet visant à étudier les assemblages moléculaires très dynamiques et leur role dans la replication des virus. Martin Blackledge est chef du groupe FDP et directeur adjoint de l’IBS. Son projet, intitulé « DynamicAssemblies » a reçu un (...)
  • La structure des nucléocapsides de la rougeole visualisée en haute résolution

    2019

    Le virus de la rougeole est un pathogène humain extrêmement contagieux. La maladie provoquée par ce virus connait actuellement une résurgence très forte dans beaucoup de pays du monde, dont la France. La réplication de ce virus nécessite l’encapsidation du génome à ARN par la nucléoprotéine virale dans des supra structures moléculaires nommées les nucléocapsides. Les chercheurs de l’IBS ont développé des méthodes expérimentales (1) pour encapsider un ARN particulier in vitro, permettant ainsi la (...)
  • Les secrets intimes de la photosymbiose dans le plancton marin

    2019

    La photosymbiose entre une cellule hôte et des microalgues intracellulaires est fréquente dans le plancton océanique. Cependant, le fonctionnement de cette interaction et les mécanismes subcellulaires impliqués restait énigmatiques. Grâce à une combinaison de techniques d’imagerie notamment développées à Grenoble, les chercheurs viennent de montrer que l’organisation structurelle, la physiologie et l’état trophique des microalgues (les haptophytes Phaeocystis) changent considérablement lorsqu´elles sont (...)
  • Décryptage moléculaire d’une étape clé du processus de maturation des héparanes sulfates

    2019

    Les héparanes sulfates appartiennent à la famille des glycosaminoglycanes, des polysaccharides chargés négativement, présents en grande quantité sur les surfaces cellulaires et dans les tissus interstitiels. Ils exercent leurs activités en interagissant avec de très nombreuses protéines dont ils contrôlent le mécanisme d’action, intervenant ainsi dans la plupart des grandes fonctions biologiques (morphogénèse, division, signalisation et migration cellulaire, inflammation et réponses immunitaires, (...)