Institut de Biologie StructuraleGrenoble / France

2005

La diffraction neutronique dévoile les bases dynamiques de l’adaptation des protéines aux hautes températures

Neutron scattering reveals the dynamic basis of protein adaptation to extreme temperature.
J Biol Chem. 2005 Dec 9 ;280(49):40974-9.
Tehei M, Madern D, Franzetti B, Zaccai G

Tetraploidy and tumor development

Tetreploidy and tumor development

Cancer Cell, Voulme 8, Isuue 5, Novembre 2005, Pages 353-354

Margolis Robert L.

12 au 16 Octobre 2005 : "Fête de la Science" à l’IBS

L’IBS a ouvert ses portes au grand public (adultes et lycéens), du 12 au 16 octobre, sur le thème de : l’imagerie des molécules du vivant.

En Isère, la Fête de la Science a débuté le 7 octobre, avec 5 villages des Sciences, et notamment à Grenoble, "Place aux sciences", organisé par le CCSTI. Pour plus de détails, consultez :
- le programme de la Fête de la Science 2005 en Isère

13/10/05 : Conférence au CRDP

Eva Pebay-Peyroula, directrice de l’Institut de Biologie Structurale et membre de l’Académie des Sciences sera le jeudi 13 octobre 2005 à 18h30 au CRDP, 11 avenue du Général Champon, Grenoble pour une conférence intitulée "Au cœur des molécules biologiques : la clé de notre santé !"

Analyse structurale de l’enzyme PDF pour la conception de nouveaux antibiotiques

Une équipe du laboratoire de cristallographie et de cristallogenèse des protéines (Institut de Biologie Structurale, Grenoble) est parvenue à réaliser l’analyse structurale d’une enzyme végétale, la peptide déformylase mitochondriale (PDF). L’enzyme PDF, dont un homologue existe chez l’homme, est une enzyme indispensable aux processus de maturation N-terminale des protéines. La caractérisation des différences structurales entre les PDFs végétales, proches de la forme humaine, et bactériennes permet d’envisager la conception rationnelle d’antibiotiques capables d’inhiber spécifiquement les enzymes PDFs bactériennes sans affecter la PDF humaine, et donc éviter des effets secondaires lors d’un traitement thérapeutique.

The crystal structure of mitochondrial (type 1A) peptide deformylase provides clear guidelines for the design of inhibitors specific for the bacterial forms.
J Biol Chem. 2005 Sep 28
Fieulaine S, Juillan-Binard C, Serero A, Dardel F, Giglione C, Meinnel T, Ferrer JL.

Une protéase des neutrophiles clive une protéine régulatrice du cycle cellulaire

Il a été récemment établi qu’une protéase des neutrophiles, la protéinase 3, dont le rôle était classiquement restreint au pouvoir toxique et microbicide, avait la capacité de cliver une protéine régulatrice du cycle cellulaire, la p21/waf1. Ainsi, le couple proteinase 3 et p21 apparait crucial pour moduler la différenciation et la prolifération des cellules myéloides, avec potentiellement une implication dans les leucémies.

Cleavage of p21/WAF1/CIP1 by proteinase 3 modulates differentiation of a monocytic cell line. Molecular analysis of the cleavage site
J Biol Chem. 2005 Aug 26 ;280(34):30242-53.
Dublet B, Ruello A, Pederzoli M, Hajjar E, Courbebaisse M, Canteloup S, Reuter N, Witko-Sarsat

Mouvements collectifs dans les protéines : de la dynamique à la fonction

Une équipe du laboratoire de RMN, en collaboration avec l’Université de Basle (Suisse) et le Florida State University (EU) vient, pour la première fois, de mettre en évidence expérimentalement l’existence de mouvements collectifs au sein des feuillets ß permettant de propager les changements de conformations d’un coté de la molécule à l’autre à travers un réseau de liaisons hydrogènes . Ces résultats obtenus par combinaison de mesures sensibles à des mouvements lents apportent des données essentielles quant à la compréhension des mécanismes de transmission de signal au sein des protéines.

Notons que ces résultats ont été souligné comme d’intérêt exceptionnel dans un article paru dans « Current Opinion in Structural Biology » et mis en avant dans « Science » à sa rubrique "Highlight of the Recent Literature".

PNAS,(2005) 102:13885-13890

Nouvelles données structurales dans la famille des metallo-betalactamases

La bactérie Streptococcus pneumoniae est un pathogène majeur de l’homme dont les mécanismes moléculaires déployés au cours de la virulence sont mal connus. La détermination de structures tridimensionnelles de protéines de surface du pneumocoque impliquées dans les interactions avec l’organisme hôte permet de mieux comprendre les processus pathogéniques.

Crystal structure of phosphorylcholine esterase domain of the virulence factor choline-binding protein e from streptococcus pneumoniae : new structural features among the metallo-beta-lactamase superfamily.
Biol Chem. 2005 Aug 5 ;280(31):28591-600.
Garau G, Lemaire D, Vernet T, Dideberg O, Di Guilmi AM.

Structure de l’enzyme SPP, enzyme clé de la photosynthèse

The structure of a cyanobacterial sucrose-phosphatase reveals the sugar tongs that release free sucrose in the cell.
Plant Cell. 2005 Jul ;17(7):2049-58.
Fieulaine S, Lunn JE, Borel F, Ferrer JL.

La fixation du nickel par le transporteur periplasmic NikA depend d’une petite molécule

Crystallographic and spectroscopic evidence for high affinity binding of FeEDTA(H2O)- to the periplasmic nickel transporter NikA.

J Am Chem Soc. 2005 Jul 20 ;127(28):10075-82.

Cherrier MV, Martin L. Cavazza C., Jacquamet L., Lemaire D., Gaillard J., Fontecilla-Camps JC.

Protéine gp36 du virus d’immunodéficience félin

Structural characterization of the feline-immunodeficiency-virus envelope glycoprotein 36 ectodomain for the development of new antivirals.

Biochem J. 2005 Jul 15 ;389(Pt 2):559-67.

Desmaris F., Lemaire D., Ricard-Blum S., Chatrenet B. & Forest E.

Des sucres pour cibler la fixation du VIH à son corecepteur cellulaire

Heparan sulfate targets the HIV-1 envelope glycoprotein gp120 coreceptor binding site.

J Biol Chem. 2005 Jun 3 ;280(22):21353-7. Epub 2005 Mar 28.

Vives R., Imberty A., Sattentau OJ., Lortat-Jacob H.

JBC : paper of the week

L’article suivant a été sélectionné par le Journal of Biological Chemistry (JBC) comme papier de la semaine dans son édition du 8 avril (en ligne à compter du 1er avril) :

Effects of p47phoxC Terminus Phosphorylations on Binding Interactions with p40phoxand p67phox : STRUCTURAL AND FUNCTIONAL COMPARISON OF p40phoxand p67phoxSH3 DOMAINS
Claire Massenet, Sylvie Chenavas, Claudine Cohen-Addad, Marie-Claire Dagher, Gerard Brandolin, Eva Pebay-Peyroula, and Franck Fieschi
J. Biol. Chem. 2005 280 : 13752-13761

Molecular Cell

Comment un régulateur critique du cycle cellulaire est-il contrôlé pour exercer sa fonction.

Le Laboratoire des Protéines du Cytosquelette (IBS) a identifié une protéine, WISp39, capable de protéger de la dégradation la protéine p21 pour lui permettre d’exercer sa fonction de régulateur critique du cycle cellulaire. En effet, deux principes contrôlent la présence et l’activité de cette protéine : d’une part son expression, de l’autre sa dégradation. La nouvelle protéine identifiée recrute la protéine chaperon Hsp90 pour stabiliser p21 et empêcher ainsi sa dégradation. L’utilisation d’ARN interférents contre WISp39 empêchent à la fois l’accumulation de p21 et l’arrêt du cycle après irradiation. Ces résultats démontrent l’importance des phénomènes de stabilisation/dégradation dans la régulation de l’activité de la protéine p21. Ils confirment par ailleurs l’importance des phénomènes de régulation de cette protéine dont il avait été montré par cette même équipe que la dégradation était essentielle pour la réparation de l’ADN après une irradiation aux UV.

Regulation of p21(WAF1/CIP1) stability by WISp39, a Hsp90 binding TPR protein.

Jascur T, Brickner H, Salles-Passador I, Barbier V, El Khissiin A, Smith B, Fotedar R, Fotedar A
Mol Cell. 2005 Jan 21 ;17(2):237-49.

Un héparane sulfate de synthèse inhibe l’activité biologique de l’interféron-gamma (ou comment eteindre le feu avec du sucre)

Des chercheurs de l’Institut de Biologie Structurale en collaboration avec des chimistes de l’Université Paris Sud sont parvenus à synthétiser chimiquement le domaine d’interaction d’un ligand de l’interféron-gamma, une cytokine impliquée dans plusieurs pathologies inflammatoire ou auto-immune et intervenant également dans le rejet de greffe. Ce mime structural possède une très forte activité de liaison à l’interféron-gamma capable à la fois d’inhiber l’interaction de l’interféron-gamma avec les héparanes sulfate et avec son récepteur cellulaire. Cet inhibiteur se révèle bien plus puissant que toutes les molécules développées jusqu’à présents lesquelles n’agissent que sur la reconnaissance du récepteur (anticorps monoclonaux) ou que sur les héparanes sulfate (peptides) et sera prochainement testé pour son efficacité dans la perspective de cibler plusieurs pathologies liées à l’interféron-gamma.

Heparan sulfate mimicry : a synthetic glycoconjugate that recognizes the heparin binding domain of interferon-gamma inhibits the cytokine activity.
J Biol Chem. (2005) 280 : 37558-37564
Sarrazin S, Bonnaffe D, Lubineau A, Lortat-Jacob H.

Rôle fonctionnel de la charnière entre les modules CCP de la protéase C1s du complément

Functional role of the linker between the complement control protein modules of complement protease C1s.

Journal of Immunology,. 2005 Oct 1 ;175(7):4536-42.

Bally I, Thielens NM, Gaboriaud C, Arlaud GJ.

21/10/05 : Journée Scientifique de l’IBS

Le 21 octobre 2005, l’IBS a organisé sa Journée Scientifique au Domaine Saint Jean de Crépy, l’occasion de réfléchir aux thématiques à développer pour les années à venir.