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Institut de Biologie StructuraleGrenoble / France

Contacts relatifs à cet article / WEIK Martin

Présentation

Responsable : Martin Weik

Présentation

Les protéines sont les moteurs moléculaires de la vie. La diversité de leurs fonctions biologiques est bien reflétée par la grande variabilité de leurs caractéristiques structurales et dynamiques. Alors que notre connaissance de la structure des protéines n’a cessé de croître ces dernières décennies, notre compréhension de leur dynamique est beaucoup plus restreinte. Pourtant, seule la compréhension croisée de la « dynamique structurale », c’est-à-dire de l’interrelation entre structure et dynamique, nous permettra de comprendre la diversité des fonctions biologiques des macromolécules au sein de la cellule.

Dans le groupe DYNAMOP, trois équipes de recherche indépendantes développent d’une manière synergique une large palette de méthodes expérimentales et computationnelles afin de mieux comprendre la relation structure-fonction des macromolécules biologiques, en introduisant une dimension dynamique, à la fois in vitro et dans le contexte cellulaire.

Trois équipes de recherche

- PIXEL (Chef d’équipe : Dominique Bourgeois)
- Dynamo ( Modelisation & simulation ; Chef d’équipe : Martin Field)
- Dynamique structurale des protéines ; Chef d’équipe : Martin Weik)

Sujets de recherche

- Photophysique des protéines fluorescentes ; Microscopie super résolution : PALM/TIRF ; Dynamique des protéines photoactives
- Cristallographie ultrarésolue en temps des protéines fluorescentes par lasers X à électrons libres (XFEL).
- Modélisation de la structure et de la fonction des protéines ; Développement d’algorithme de simulation ; Simulations des mécanismes de réactions enzymatiques
- Influence de l’hydratation sur la dynamique de protéines
- Dynamique structurale de protéines d’intérêt médical solubles, membranaires ou intrinsèquement désordonnées : acétylcholinestérase, tau, porines

Mots-clés

Dynamique des protéines ; protéines fluorescentes ; photoactivation et photoblanchiment ; microscopie de fluorescence super-résolution ; microscopie TIRF, microscopie de molécules uniques ; microspectrophotométrie ; cristallographie cinétique ; dynamique structurale ; photophysique ; modélisation moléculaire ; simulations moléculaires ; mécanisme de réactions enzymatiques ; diffusion des neutrons ; acétylcholinestérase ; dynamique structurale des protéines ; maladies neurodégénératives ; protéine Tau ; médicaments anti Alzheimer ; réactivateurs des cholinestérase ; porines ; résistance aux antibiotiques ;

Techniques

- Cristallographie aux rayons X
- Cristallographie cinétique
- Lasers X à électrons libres (XFEL)
- Microspectrophotométrie
- Diffusion incohérente des neutrons
- Etudes haute pression
- Modélisation moléculaire
- Dynamique moléculaire
- Chimie quantique
- Microscopie super-résolution : PhotoActivated Localization Microscopy (PALM)
- Biologie moléculaire et cellulaire : Fluorescent protein fusion constructs

Services disponibles

• Microscopie super résolution (D. Bourgeois)

Publications

La liste des publications du groupe est disponible ici.