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Institut de Biologie StructuraleGrenoble / France

Contacts relatifs à cet article / Vivès Romain

Activité scientifique de l’équipe SAGAG-Vivès...

Responsable : Romain Vivès

Activité scientifique de l’équipe SAGAG-Vivès

Notre équipe s’intéresse aux mécanismes post-synthétiques régulant la structure et l’activité des héparanes sulfate (HS), et notamment des sulfatases de la famille des Sulfs.
Les HS sont impliqués dans un très grand nombre de processus cellulaires, de par leur capacité à fixer et moduler l’activité d’un vaste répertoire de protéines. Les interactions HS/ligands impliquent des régions spécialisées (les domaines S) situées au sein de la chaine polysaccharidique, et caractérisées par leur séquence saccharidique et leur profil de sulfatation. L’expression de tels motifs est étroitement contrôlée lors de la biosynthèse des HS, mais également au niveau post-synthétique par l’action d’enzymes extracellulaires telles que les Sulfs. Les Sulfs constituent une famille de sulfatases récemment identifiée, qui ciblent spécifiquement les domaines S des HS et catalysent l’élimination sélective de groupements 6-O-sulfate impliqués dans la reconnaissance de nombreuses protéines. Bien que structuralement limitée, l’action de ces enzymes altère de manière radicale les capacités d’interaction et les propriétés biologiques des HS. De ce fait, Les Sulfs sont impliquées dans de nombreux processus physiopathologiques, tels que le développement embryonnaire, la régénération tissulaire ou le cancer.
Notre objectif est de d’étudier la structure de ces enzymes, leur mode d’action et leur spécificité de substrat, afin de mieux comprendre cet important mécanisme de régulation de l’activité des HS et d’établir les bases structurales pour le développement de nouvelles approches thérapeutiques ciblant les Sulfs.


SAGAG Vivès : Les Sulfs catalysent la 6-O-desulfatation des HS de manière processive et orientée
Les Sulfs catalysent la 6-O-desulfatation des HS de manière processive et orientée.
Analyse de la désulfatation d’un oligosaccharide d’héparine par HSulf2 en spectrométrie de masse, RMN, séquençage d’HS.

Actualités

SAGAG Vivès : 3èmes journées scientifiques du GDR GAG

Les 3èmes journées du GDR GAG auront lieu les 24 et 25 septembre prochains, à Lille. La journée du 25 est une journée scientifique ouverte à tous. L’inscription est gratuite, mais obligatoire.

Date limite d’inscription : 15 septembre 2018.

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Actualités (Archives)

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Membres de l’équipe

Membres actuels

  • Evelyne Gout (IE CNRS)
  • Mayssa Ghaddar (Master 2)
  • Rana El Masri (Doctorante)
  • Rubal Ravinder (collab. CERMAV, doctorante)
  • Romain Vivès (DR CNRS)

Anciens membres (depuis 2014)

  • Zahra al Oula Hassoun (Master 2), actuellement en thèse (Liège, Belgique).
  • Elisa Tournebize (Master 1), actuellement recrutée (SANOFI-Pasteur, Lyon).
  • Hugo Fumat (Licence 3)
  • Elodie Henriet (CDD ingénieur), actuellement en thèse (Orléans, France).
  • Adrien Laroche (Licence 3)
  • Amal Seffouh (thèse), actuellement en post-doc (Montréal, Canada).

Financements

ANR, UGA, Glyco@Alps...

Réseaux scientifiques

Collaborations scientifiques nationales

  • Dr. D. Bonnaffé, ICMMO, Orsay
  • Dr. Y. Bourne, AFMB, Marseille
  • Dr. R. Daniel, LAMBE, Université d’Evry-Val d’Essonne
  • Dr. O. Filhol-Cochet, CEA-BIG, Grenoble
  • Dr. S. Halila, CERMAV, Grenoble
  • Dr. B. Horvat, ENS, Lyon
  • Dr. B. Huard, IAB, Grenoble
  • Dr. C. le Narvor, ICMMO, Orsay

Collaborations scientifiques internationales

  • Dr. S. Ali, Newcastle University, UK
  • Dr. K. Dobra , University of Stockholm, Sweden
  • Dr. E. Schmidt, University of Colorado, USA
  • Dr. J. Van den Born, University of Groningen, the Netherlands
  • Dr. X. Yue, Louisiana State University, USA

Le GDR « Gagosciences »

Romain Vivès est coordinateur du GDR CNRS3739 « Gagosicences ». Ce GDR a été créé afin de fédérer des équipes de recherche françaises étudiant les GAGs au sein d’un réseau structuré, bâti autour de compétences diversifiées et d’approches complémentaires, et promouvant une démarche pluridisciplinaire pour la progression des connaissances en glycosciences. Les recherches conduites par les équipes membres s’articulent autour de 3 grands pôles de compétence (Biologie, Chimie et Développements méthodologiques), et l’ambition du GDR est de favoriser les échanges entre ces différentes disciplines.

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GDR GAG

Glyco@Alps

Romain Vivès est membre du comité exécutif du programme IDEX-UGA Glyco@Alps (responsable WP2). Le réseau Glyco@Alps explore la complexité et la diversité structurale fascinante des sucres, dont ceux issus de la biodiversité alpine, et se concentre sur leur exploitation dans les produits biopharmaceutiques, le diagnostic médical, la médecine personnalisée, les matériaux, la durabilité environnementale et les bio-industries innovantes. Il rassemble une centaine de chercheurs de la région grenobloise, issus de 17 laboratoires différents.

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Glyc@Alps


Publications récentes

Genetic and enzymatic characterization of 3-O-sulfotransferase SNPs associated with Plasmodium falciparum parasitaemia
Ngoc Thy Nguyen, Romain R Vivès, Magali Torres, Vincent Delauzun, Els Saesen, Veronique Roig-Zamboni, Hugues Lortat-Jacob, Pascal Rihet, Yves Bourne
Glycobiology, Oxford University Press (OUP), 2018, 〈10.1093/glycob/cwy038〉

A jasmonic acid derivative improves skin healing and induces changes in proteoglycan expression and glycosaminoglycan structure
Elodie Henriet, Sibylle Jäger, Christian Tran, Philippe Bastien, Jean-François Michelet, Anne-Marie Minondo, Florian Formanek, Maria Dalko-Csiba, Hugues Lortat-Jacob, Lionel Breton, Romain R Vivès
BBA - General Subjects, Elsevier, 2017, 1861 (9), pp.2250-2260. 〈10.1016/j.bbagen.2017.06.006〉

High sodium diet converts renal proteoglycans into pro-inflammatory mediators in rats
Ryanne S. Hijmans, Pragyi Shrestha, Sarpong Ka, Saleh Yazdani, Rana El Masri, Wilhelmina H. A. De Jong, Gerjan Navis, Romain R Vivès, Jacob van Den Born
PLoS ONE, Public Library of Science, 2017, 12 (6), pp.e0178940. 〈10.1371/journal.pone.0178940. eCollection 2017〉

Solution structure of CXCL13 and heparan sulfate binding show that GAG binding site and cellular signalling rely on distinct domains
Yoan Monneau, Lingjie Luo, Nehru Viji Sankaranarayanan, Balaji Nagarajan, Romain R Vivès, Françoise Baleux, Umesh R. Desai, Fernando Arenzana-Seidedos, Hugues Lortat-Jacob
Open Biology, Royal Society, 2017, 7, pp.170133. 〈10.1098/rsob.170133〉

The "in and out" of glucosamine 6-O-sulfation : the 6th sense of heparan sulfate.
Rana El Masri, Amal Seffouh, Hugues Lortat-Jacob, Romain R Vivès

Glycoconjugate Journal, Springer Verlag, 2017, 34 (3), pp.285-298. 〈10.1007/s10719-016-9736-5〉

Heparan sulfate-dependent enhancement of henipavirus infection.
Cyrille Mathieu, Kévin P Dhondt, Marie Châlons, Stéphane Mély, Hervé Raoul, Didier Negre, François-Loïc Cosset, Denis Gerlier, Romain R Vivès, Branka Horvat
mBio, American Society for Microbiology, 2015, 6 (2), pp.e02427

Langerin-heparin interaction : two binding sites for small and large ligands as revealed by a combination of NMR spectroscopy and cross-linking mapping experiments.
Juan C Muñoz-García, Eric Chabrol, Romain R Vivès, Aline Thomas, José L De Paz, Javier Rojo, Anne Imberty, Franck Fieschi, Pedro M Nieto, Jesus Angulo
Journal of the American Chemical Society, American Chemical Society, 2015, 137 (12), pp.4100-10

Syndecan-1 alters heparan sulfate composition and signaling pathways in malignant mesothelioma
Ghazal Heidari-Hamedani, Romain R Vivès, Amal Seffouh, Nikolaos A Afratis, Arie Oosterhof, Toin H Van Kuppevelt, Nikos K Karamanos, Muzaffer Metintas, Anders Hjerpe, Katalin Dobra, Tünde Szatmári
Cellular Signalling, Elsevier, 2015, 〈10.1016/j.cellsig.2015.07.017〉

Syndecan-1 alters heparan sulfate composition and signaling pathways in malignant mesothelioma .
Ghazal Heidari-Hamedani, Romain R Vivès, Amal Seffouh, Nikolaos A Afratis, Arie Oosterhof, Toin H Van Kuppevelt, Nikos K Karamanos, Muzaffer Metintas, Anders Hjerpe, Katalin Dobra, Tünde Szatmári
Cellular Signalling, Elsevier, 2015, 27 (10), pp.2054-67