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Institut de Biologie StructuraleGrenoble / France

OptiLink

Présentation

Le criblage automatique de solutions de cristallisation permet d’obtenir rapidement des informations sur les conditions de cristallisation d’une protéine. Le criblage de conditions prédéfinies peut parfois suffire à trouver les conditions de tampon, de sels et d’agent précipitant, nécessaires à l’obtention d’un cristal, mais dans la majorité des cas, il faut affiner une ou plusieurs conditions de cristallisation, ayant donné des résultats prometteurs. Cette phase d’optimisation peut-être longue et complexe, car il faut souvent affiner plusieurs conditions différentes pour une même protéine.

Afin de simplifier l’optimisation des conditions de cristallisation, la plateforme de cristallisation de l’IBS et le GIPSE ont développé en collaboration avec la plateforme de cristallisation de l’EMBL, le logiciel OptiLink : ce logiciel permet de générer des scripts Gemini (version 4.2 ou plus) permettant de piloter un robot Tecan® pour le remplissage de plaques de cristallisation définies via le logiciel OptiCrys. Ce logiciel permet ainsi d’éviter la programmation manuelle du robot par l’expérimentateur.

Références

L’utilisation du logiciel OptiLink devra être référencée de la manière suivante :

OptiLink software : Creation of Tecan® Gemini scripts for the robotic generation of cristallization plates. Céline Charavay, Stéphane Segard, Delphine Blot, Martin Roewer and Jose Marquez

Copyright CEA 2010

Contact : OptiLink at ibs.fr

Démonstration

Démonstration d’OptiLink (flash) (Utiliser Adobe Flash Player pour lire ce fichier)

Documentation

Version française :
-  OptiLink-gui
-  OptiLink-cli

Téléchargement

Le logiciel OptiLink est distribué sous les termes de la licence CeCILL-C.

Avant de télécharger le logiciel, vous devez prendre connaissance des termes de la licence. Si vous acceptez les termes de la licence, vous pouvez télécharger le logiciel :
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