2020

  • Vers le mécanisme d’action du complexe d’assemblage du Complexe I respiratoire chez la mitochondrie

    2020

    Les complexes respiratoires situés dans les membranes internes de nos mitochondries sont de véritables batteries macromoléculaires : ils couplent le flux d’électrons à travers des clusters de métaux et des cofacteurs avec un transfert de protons pour créer un gradient qui fournit l’énergie nécessaire à la production d’ATP et donc à l’alimentation des processus essentiels de la vie. Le premier complexe dans la chaîne respiratoire, nommé Complexe I, est une des plus grandes protéines membranaires, composée (...)
  • Etudes structurales et fonctionnelles de nouvelles rhodopsines microbiennes

    2020

    Les rhodopsines microbiennes constituent une superfamille vaste et diversifiée de protéines membranaires photosensibles. Elles jouent un rôle majeur dans la capture de l’énergie solaire dans la mer et utilisent cette énergie pour effectuer la translocation d’ions à travers la membrane plasmique ou contrôler divers processus sensoriels ou enzymatiques. Les rhodopsines microbiennes ont également trouvé des applications essentielles en médecine dans le domaine des neurosciences, étant au cœur de (...)
  • Comment les protéines "chaperonnes" distinguent-elles les protéines qu’elles transportent à l’intérieur des mitochondries ?

    2020

    Le protéome mitochondrial humain est estimé à plus d’un millier de protéines dont 99% sont synthétisées en dehors des mitochondries. Ces protéines sont importées à l’intérieur de la mitochondrie dans des endroits très spécifiques, dans une des membranes, dans l’espace inter-membranaire ou dans la matrice. Les mécanismes moléculaires de l’import sont encore mal compris au niveau atomique. Une étude du groupe NMR a mis en lumière la base mécanistique de la spécificité du système de chaperonnes de l’espace (...)
  • La protéine HU de Deinococcus radiodurans imagée par AFM

    2020

    Contrairement aux eucaryotes qui possèdent leur matériel génétique au sein d’un noyau, l’ADN bactérien est maintenant connu pour être plutôt regroupé en régions diffuses, mais non aléatoires, que sont les nucléoïdes. Mais comment sont-ils organisés ? HU est une protéine importante, voire essentielle, dans certains nucléoïdes bactériens. La fonction cellulaire de HU dans la compaction de l’ADN est cependant controversée pratiquement depuis son identification dans les années 1970, notamment par des comportements (...)
  • Paul Schanda, lauréat du prix Varian Young Investigator Award de l’EUROMAR

    2020

    Le comité EUROMAR a décerné le prix Varian Young Investigator à Paul Schanda (IBS/NMR). Ce prix prestigieux a été créé à l’honneur de Russel Varian, pionnier de la spectroscopie RMN, pour reconnaître les contributions exceptionnelles dans le domaine du développement de la résonance magnétique. Le prix salue notamment les développements méthodologiques de Paul Schanda pour caractériser la dynamique et la structure des protéines à l’état solide et liquide. Certaines méthodes développées par son équipe sont (...)
  • L’IBS s’organise face à l’évolution du contexte sanitaire

    2020

    Nos activités sont maintenues sous réserve d’ajustements organisationnels : la vie de nos laboratoires se poursuit mais le télétravail est privilégié pour ceux dont les activités le permettent. Pour les personnes en télétravail, qui restent joignables par mail ou téléphone, une présence temporaire et par rotation est mise en place au sein des équipes pour assurer un fonctionnement efficace des collectifs de travail. Pour les personnes en présentiel, la réduction des interactions sociales et le respect (...)
  • SARS-CoV-2 : découverte d’un mécanisme de transmission inédit

    2020

    La glycoprotéine S, présente à la surface du Coronavirus SARS-CoV-2, permet l’entrée du virus dans les cellules humaines via son interaction avec un récepteur, l’enzyme ACE2, présent à la surface des cellules infectées. L’équipe de F. Fieschi du groupe M&P, à laquelle sont associés des membres des groupes IRPAS et MEM et des groupes espagnol et italien, vient de mettre en évidence que des récepteurs lectines (DC-SIGN, L-SIGN , MGL et Langerin) de cellules immunitaires sont également capables de (...)
  • Structure d’une enzyme clé de la réplication d’un virus pathogène humain visualisée en action par cryo-ME

    2020

    Les Bunyavirales sont un ordre de virus à ARN simple brin de polarité négative segmenté comprenant plusieurs agents pathogènes humains potentiellement mortels contre lesquels il n’existe actuellement aucun traitement (virus La Crosse, virus Hantaan, virus Crimée Congo, virus Lassa). La réplication et la transcription de leur génome constituent des réactions essentielles au cycle viral et sont catalysées par une enzyme virale clé : l’ARN-polymérase ARN-dépendante. Le groupe MEM de l’IBS, en (...)
  • Suivre l’agrégation des protéines en temps réel par spectroscopie neutronique

    2020

    L’agrégation des protéines en superstructures amyloïdes constitue la manifestation moléculaire d’une grande variété de maladies neurodégénératives telles que Alzheimer ou Parkinson. Il devient de plus en plus évident que des oligomères apparaissant au début de l’agrégation sont les véritables espèces toxiques, rendant ainsi les mesures résolues en temps particulièrement importantes. Bien que plusieurs méthodes résolues en temps ont été développées and appliquées pour l’étude de l’agrégation des protéines, des (...)
  • Hélène Malet est nommée membre Junior de l’Institut Universitaire de France

    2020

    Hélène Malet, Maître de Conférences à l’Université Grenoble Alpes et chercheur dans l’équipe du Dr Guy Schoehn au sein du groupe de Microscopie Électronique et Méthodes de l’IBS, est nommée membre Junior de l’Institut Universitaire de France (IUF*) à compter du 1er octobre 2020, pour une durée de 5 ans. La réplication et la transcription virale sont des étapes clés du cycle viral. Hélène Malet analyse la structure des protéines virales impliquées dans le fonctionnement de ces processus, notamment les (...)
  • Regard moléculaire sur la transmission de la grippe aviaire à l’Homme

    2020

    ​En recourant à une méthode RMN, les chercheurs de l’IBS, en collaboration avec l’EMBL Grenoble, ont révélé les mécanismes moléculaires qui permettent au virus de la grippe aviaire de s’adapter de l’oiseau à l’Homme. Chez l’oiseau, le virus de la grippe aviaire agit via l’interaction de sa polymérase avec un facteur de transcription clé : ANP32A. Sans que cette interaction soit bien connue, deux régions de ces molécules, très dynamiques, semblaient être particulièrement impliquées. Cette connaissance (...)
  • Cristallisation des protéines sur puce microfluidique pour des études de diffraction in situ aux rayons X

    2020

    En mettant au point un procédé de microfabrication permettant l’intégration d’une membrane de dialyse en cellulose régénérée entre deux couches d’une micropuce en résine photodurcissable, les chercheurs du Groupe Synchrotron de l’IBS, en collaboration avec le Laboratoire du Future (LOF) de Bordeaux, ont proposé un moyen robuste et peu coûteux de fabriquer des puces microfluidiques polyvalentes. Elles couvrent l’ensemble du processus, de la croissance des cristaux sur puce avec les propriétés (...)
  • Comment une bactérie s’emmitoufle pour passer inaperçue et augmenter sa virulence

    2020

    La capsule de la bactérie Streptococcus pneumoniae est son facteur de virulence dominant car elle affecte de multiples interactions avec l’hôte, notamment en contribuant à la colonisation de l’organisme et à l’échappement au système immunitaire de l’hôte. Au cours de l’infection, l’épaisseur de la capsule varie, mais les mécanismes de régulation étaient jusqu’à présent mal compris. Des chercheurs de l’IBS, en collaboration avec des équipes de UCL Medical School et l’Université St Georges de Londres ainsi que (...)
  • Les protéines fluorescentes dansent dans le noir

    2020

    La possibilité de convertir des protéines fluorescentes photoconvertibles (PCFPs) d’un état vert à un état rouge est largement utilisée en microscopie de localisation de molécules uniques. Cependant, l’imagerie de molécules uniques est fortement perturbée par le "clignotement" (c’est-à-dire la perte transitoire de fluorescence), qui résulte du passage de PCFPs individuelles vers des "états noirs". Le clignotement a généralement été décrit à partir de l’état rouge, mais dans cet article, les chercheurs se (...)
  • Base structurale des activités catalytiques de l’enzyme multifonctionnelle quinolinate synthase

    2020

    Le cofacteur biologique nicotinamide adénine dinucléotide (NAD) est impliqué dans de nombreuses réactions métaboliques essentielles impliquant le transfert d’un proton et de deux électrons. Selon l’organisme, son précurseur, l’acide quinolinique (AQ), est synthétisé à partir du tryptophane (comme chez les humains) ou de la condensation du dihydroxyacétone phosphate et de l’iminoaspartate (chez les bactéries). Cette dernière réaction, qui est probablement la façon la plus ancienne de fabriquer de l’AQ, est (...)
  • Mécanisme moléculaire du radical SAM de la protéine NifB , une enzyme clé de cofacteur de maturation de la nitrogénase

    2020

    La nitrogénase est un acteur majeur du cycle global de l’azote. Elle catalyse la réduction du diazote en ammoniac à température et pression ambiante. Son site actif, aussi appelé FeMo-cofactor, correspond à un centre organométallique [MoFe7S9C-(R)-homocitrate] dont la biosynthèse et l’insertion nécessitent l’action d’une douzaine de protéines accessoires regroupées dans la machinerie d’assemblage NIF (pour NItrogen Fixation). Parmi ces dernières, la protéine NifB est essentielle puisqu’elle va permettre (...)
  • Mécanisme moléculaire d’une pompe à sodium controlée par la lumière

    2020

    La pompe ionique photosensible KR2 est une rhodopsine microbienne découverte dans des bactéries marines en 2013. Sa capacité unique à transporter activement le sodium (Na+) sous l’effet de la lumière, mais pas le potassium (K+), le calcium (Ca2+) et l’hydrogène (H+), fait de cette protéine un outil potentiel pour l’optogénétique - une méthode biotechnologique de contrôle optique précis et peu invasif de la matière vivante. Le mécanisme moléculaire du pompage du Na+ par la lumière n’était pas encore connu, (...)
  • COVID-19 : infos IBS

    2020

    L’IBS relance progressivement ses activités à partir du 25 mai Suite à l’annonce du gouvernement de lever graduellement le confinement à partir du 11 mai, la réouverture progressive de l’IBS est organisée en accord avec toutes les mesures et réglementations de sécurité recommandées par nos tutelles. Le Plan de Reprise d’Activité (PRA) de l’IBS prévoit, à partir du 25 mai, une reprise progressive de l’activité en présentiel, pour se stabiliser après 4 semaines à un niveau d’environ 50% de présence physique (...)
  • Caractériser les ARN longs non codants d’un point de vue 3D

    2020

    Les ARN non codants accomplissent une variété remarquable de fonctions biologiques, de la régulation de l’expression des gènes à la traduction et même à la protection des génomes contre les acides nucléiques étrangers. Parmi eux, les ARN non codants longs (lncRNA) régulent des ARN de grande taille (> 1000 nucléotides) qui sont impliqués dans la prévention des maladies mais leur fonction ainsi que les structures tridimensionnelles restent mal caractérisées. Une étude récente a démontré le rôle des éléments (...)
  • Hommage à Jean-Luc Ferrer

    2020

    L’IBS rend hommage à Jean-Luc Ferrer décédé le 21 avril 2020 dans sa 55eme année, après une bataille menée depuis plusieurs années contre la maladie. Pilier des lignes CRG françaises à l’ESRF, il était un scientifique internationalement reconnu dans le domaine de la biologie structurale. Ingénieur diplômé de l’Ecole Centrale Paris en 1987, Jean-Luc Ferrer a obtenu un doctorat en physique en 1990, après une thèse réalisée au centre CEA de Bruyères-le-Châtel sur la dynamique du spectre d’un laser à électrons (...)