2022

Les héparanes sulfates sont de longues chaînes de polysaccharides très complexes que l’on trouve à la surface des cellules et dans la matrice extracellulaire. Ils jouent un rôle clé dans de nombreux processus biologiques, notamment le développement cellulaire, la signalisation et les réponses immunitaires, mais aussi dans les infections pathogènes comme le SRAS-CoV-2. Une étape centrale de la biosynthèse de l’héparane sulfate est la génération d’un long squelette glycanique, constitué d’unités de (...)

Le brevet européen WO2022218997, déposé par l’équipe de Pascal Fender (IBS/MEM), protège une plateforme vaccinale universelle. Entièrement protéique et thermostable, elle permet l’affichage spontané et irréversible d’antigènes complexes par une technologie ’plug and display’. Des études précliniques ont montré son efficacité dans le domaine des maladies infectieuses émergentes comme les coronavirus (Chevillard et al., Mol Ther 2022, https://doi.org/10.1016/j.ymthe.2022.02.011) et en cancérologie dans le (...)

Malene Jensen, directrice de recherche CNRS dans le groupe "Flexibilité et Dynamique des Protéines" de l’IBS, est l’une des 7 chercheuses ou chercheurs d’exception en sciences de la vie distingués par le 1er programme Impulscience de la Fondation Bettencourt Schueller. Cette fondation s’engage à accompagner financièrement chacun de ces chercheurs pendant une durée de 5 ans avec 2,3 millions d’euros, une somme qui couvre le programme de recherche, une prime personnelle pour le chercheur et la prise en (...)

Le contrôle de l’équilibre ionique est vital pour les cellules. Il est contrôlé par des canaux ioniques membranaires et des pompes, qui utilisent généralement l’énergie de l’ATP ou de la lumière. La rhodopsine microbienne (RM), pompe ionique pilotée par la lumière, est présente dans un certain nombre de micro-organismes. La RM peut pomper divers ions monovalents comme les ions Na+, K+, Cl-, I-, NO3-. La halorhodopsine de la cyanobactérie Synechocystis sp. (SyHR), récemment découverte, pompe le chlorure. (...)

La microscopie à super résolution continue de mettre à jour de nouveaux aspects de la biologie à l’échelle nanométrique. Les mesures quantitatives utilisant la microscopie à super résolution restent toutefois limitées en raison du comportement photophysique très complexe des marqueurs fluorescents utilisés. Dans le cas des protéines fluorescentes photoconvertibles (PCFPs), leur efficacité limitée de conversion du vert au rouge réduit la résolution spatiale et génère des erreurs de sous-comptage dans les (...)

L’IBS a fêté son 30eme anniversaire à l’occasion de sa Journée scientifique annuelle le 16 juin 2022 en présence de 220 personnes. Pour cette occasion spéciale, la journée scientifique a eu lieu à l’amphithéâtre Minactec avec, entre autre, des rétrospectives de 30 années de réalisations, ainsi qu’une partie dédiée aux enjeux actuels et perspectives. Un focus particulier a été présenté sur la cristallographie (après un focus RMN en 2019 et microscopie électronique en 2021). Afin de partager ces informations avec (...)

La chimie radicalaire permet, grâce à l’utilisation d’intermédiaires de haute énergie, de réaliser des réactions difficiles, voire impossibles par la chimie dite polaire. Dans la nature, ces réactions sont extrêmement contrôlées par l’environnement structural au sein d’enzymes dédiées. Les protéines dites « Radical SAM » utilisent un centre fer-soufre et la S-adénosylméthionine pour initier des réactions radicalaires variées. Ces métalloprotéines sont notamment retrouvées dans la biosynthèse de nombreux (...)

Chez les enzymes, la « 1ère sphère de coordination » décrit la liaison d’un ou plusieurs substrats au site actif, tandis que les ligands protéiques qui servent à le(s) orienter correctement sont généralement définis comme appartenant à la « 2ème sphère de coordination ». Les éléments protéiques qui se trouvent au-delà de ce point, et qui peuvent encore affecter la catalyse, font partie de la « sphère de coordination externe ». La quinolinate synthase est un bon exemple de cette classification car, en plus (...)

Les polysaccharides de type Glycosaminoglycanes (GAGs) sont des constituants essentiels des surfaces cellulaires et des matrices interstitielles. Parmi eux, les héparanes sulfates (HS) sont impliqués dans un grand nombre de fonctions biologiques, de par leur capacité à fixer et à réguler l’activité d’un large répertoire de protéines de signalisation. Ces mécanismes sont finement contrôlés, notamment par des enzymes extracellulaires telles que l’endosulfatase HSulf-2, qui modifient la structure des HS et (...)

Des études de résonance magnétique nucléaire (RMN) menées dans les années 1970 ont démontré de manière surprenante que les acides aminés aromatiques des protéines peuvent subir des rotations. Paradoxalement, ces acides aminés aromatiques sont, dans de nombreux cas, situés dans le cœur hydrophobe, où ils s’engagent dans de multiples interactions pour maintenir le repliement de la protéine et donc sa fonction. À l’époque, il a été proposé que des "mouvements respiratoires" à grande échelle de la protéine (...)

Si des solutions vaccinales basées sur l’ARNm ont émergé très rapidement pour gérer la crise ‘COVID-19’ provoquée par le SARS-CoV-2, ces dernières possèdent des limites logistiques (conservation à -20°C, utilisation dans les 6h) qui ne permettent pas leur déploiement à large échelle. De plus, une immunité stérilisante empêchant une personne vaccinée de transmettre le virus n’existe pas à ce jour. L’équipe ‘Adenovirus et applications’ de Pascal Fender à l’IBS a conçu une particule non-infectieuse inspirée de (...)

Après AminoCraft*, l’application ludique pour mémoriser la structure chimique des 20 acides aminés, deux chercheuses de l’IBS, Eve de Rosny et Véronique Rossi, professeurs associés à l’Université Grenoble Alpes (UGA), en collaboration avec Marie-France Breton de l’Université de Cergy, ont développé MetaboCraft. Le nouveau défi consiste à reconstituer les voies métaboliques de la glycolyse et du cycle de Krebs. Comme pour AminoCraft, l’objectif est de permettre aux étudiants de s’amuser tout en apprenant (...)

La pandémie de SARS-CoV-2 est toujours en cours et nécessite des programme de vaccination efficaces. Dans cette étude, publiée online dans Cell Reports Medicine, des chercheurs de l’IBS (groupes EBEV, CAID, MEM et M&P), en collaboration avec l’IDMIT, l’Université d’Amsterdam et l’Institut Pasteur, ont dévéloppé un candidat vaccin composé de vésicules lipidiques synthétiques recouverts de glycoprotéine S du SARS-CoV2 et qui ressemblent à des particules virales. Le trimère natif de la glycoprotéine S est (...)

Alors que les vaccins ciblent les mécanismes moléculaires responsables de l’entrée du SARS-Cov-2 dans la cellule via la protéine Spike, il est tout aussi important de cibler la machinerie de réplication virale chez les patients déjà infectés par le virus. Or la machinerie de réplication du génome du SARS-Cov-2, le virus responsable de la Covid-19, présente des cibles importantes mais largement inexploitées. Des chercheurs de l’IBS (Groupe Flexibilité et Dynamique des Protéines par RMN) ont focalisé (...)