Présentation

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logo FRM 2017 avec image de microscopy de bacterie et boites de petri differents couleur

MOTS-CLES

Pseudomonas aeruginosa,Francisella tularensis, Klebsiella pneumoniae, résistance aux antibiotic , toxines, interaction hôte - pathogène, régulation, signalisation, infection nosocomiale, anti-virulence

SUJETS DE RECHERCHE

  • Les facteurs de virulence de P. aeruginosa
    * Système de sécrétion de Type III – structure, fonction et inhibition
    * Mécanismes d’action de la toxine ExoU – trafic intracellulaire
    * Protéines de sécrétion à deux partenaires – ExlA et PdtA
  • Les réseaux de régulation de P. aeruginosa
    * systèmes à deux composants impliqués dans la virulence et la formation des biofilms
  • Résistance bactérienne vis-à-vis du système immunitaire – mécanismes de persistance (Pseudomonas et Klebsiella)
  • L’enveloppe de P. aeruginosa
    * Résistance aux peptides antimicrobiens (AMP)
    * Etude de l’élongasome / divisome
  • Mécanismes de virulence de Francisella tularensis
    * Mécanismes d’échappement au système immunitaire inné
    * Facteur de virulence : système de sécrétion de Type VI
Image de la bactérie Pseudomonas aeruginosa avec ses principaux facteurs de virulences et cible pour l'antibiothérapie
Pseudomonas aeruginosa avec ses principaux facteur de virulences

TECHNIQUES SPECIFIQUES

  • Génétique bactérienne (production de mutants KO)
  • Bactériologie cellulaire
  • Cribles à l’échelle génomique (CRISPR-Cas et Transposons)
  • NGS (Tn-Seq, WGS, DAP-Seq, CHIP-Seq, RNA-Seq...)
  • Microscopie (Microscopie à fluorescence, IF, 3D vidéo, microscopie confocale spinning-disk, microscopie automatisée et analyse d’images (MicrobeJ))
  • Interaction hôte - pathogène (modèles d’infection ex : Galleria mellonella, macrophages, cellules épithéliales et sang humain)
  • Compétitions bactériennes (E. coli, Pseudomonas sp, Acinetobacter, Bacillus sp…)
  • FACS (mesure des cytokines, détection et quantification des protéines de surface, test d’injection des toxines du T3SS en utilisant system rapporteur beta-lactamase, tri de cellules et de bactéries)
  • Expression et purification de protéines (chez E. coli, P. aeruginosa et en cellules eucaryotes)
  • Protéine-protéine et protéine-lipides interactions, purification de radeaux lipidiques

COLLABORATIONS

  • Harvard Medical School, Boston, US (Steve Lory)
  • Department of Medical Microbiology, Ultrecht, NE (Susan H.M. Rooijakkers)
  • Institut Pasteur, Paris (Carmen Buchrieser)
  • Equipe I2BA ’"Inflammation, infections bactériennes et auto-inflammation", CIRI, Lyon (Thomas Henry)
  • Département de Pharmacochimie Moléculaire, Grenoble (Yung-Sing Wong)
  • Nano-Optics and Forces Team, Institut Néel, Grenoble (Jochen Fick)
  • IAB, Grenoble (A. Palencia)
  • CHU Avicenne, Bobigny (B. Lamy)
  • LGP2, Grenoble (N. Reverdy-Bruas, A. Denneulin)
  • Cermav, Grenoble (Sami Halila)
  • TrEE Team, TIMC LAB, Grenoble (Audrey Le Gouellec)
  • CEA/IRIG/Symmes, Grenoble (Thierry Livache)
  • CEA-LETI, Grenoble (P. Marcoux)
  • Équipe « Gen&Chem », Grenoble (Marie-Odile Fauvarque)
  • EDyP-Service, Grenoble (Yohann Couté)
  • IBS, Grenoble (Andrea Dessen et Pascal Poignard)