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Institut de Biologie StructuraleGrenoble / France

Sujets de stage M2 2021-2022

Financement GRAL

Dans le cadre de l’EUR "Ecole universitaire de recherche en Chimie, Biologie et Santé" (CBH-EUR-GS) et en collaboration avec l’Université de Grenoble, le LABEX-GRAL finance des bourses d’excellence de Master 2 dans les laboratoires GRAL de l’IRIG (IBS, BCI, BGE, CBM, and PCV).

Les sujets de stage de Master 2 IBS éligibles pour un financement sont listés ci-dessous :
- Biosynthesis of post-translationally modified peptides by radical chemistry - Contact : E. de la Mora (IBS/METALLO)
- Visual Proteomics by high resolution cryo-EM of crude cell extracts - Contact : A. Desfosses (IBS/MICA)
- Structural and Functional investigation of ClpX/ClpP proteolytic machine in action - Contact : J. Boisbouvier (IBS/NMR)
- E. coli outer membrane recognition by Colicin N : evaluation of the contribution of lipopolysaccharides and OmpF - Contact : Beate Bersch (IBS/NMR)
- Cross-linking of Heparan Sulfate induced by CXCL12 chemokine : structural remodelling of glycocalyx and functional effects - Contact : R. Sadir (IBS/SAGAG)
- Enzymatic alteration of cell-surface glycan landscape in human disease - Contact : R. Vivès IBS (IBS/SAGAG)
- Preparation of vaccinia virus polymerase complexes bound to DNA and nucleotide substrates - Contact : W. Burmeister IBS/VRM)
- Cryo-EM of the Influenza virus nuclear export machinery - Contact : A. Ballandras-Colas (IBS/VRM)

Calendrier :
- Ouverture de l’appel à candidatures : Mars 2022
- Les candidatures doivent être soumises avant le 15 mai 2022
- Résultats : Juin 2022

Détails pour postuler

Sujets de stage M2 2020-2021

Sujets 2021-2022 transmis au Master Biologie de l’UGA

Saisie en cours

  • Structural investigation of ClpX/ClpP proteolytic machinery in action (details), contact : J. Boisbouvier (IBS/NMR) - Master biologie, Parcours "Structural Biology of Pathogens" - POURVU
  • Inhibition of the hNTH1-YB1 complex : a new strategy to counter cisplatin
    resistance in solid cancers
    (details), contact : F. Hans (IBS/I2SR) - Master biologie, Parcours "Physiology, Epigenetics, Differentiation, Cancer" - POURVU
  • Study of cell wall synthesis in a human pathogen using super-resolution fluorescence microscopy (details), contact : C. Morlot (IBS/PG) - Master biologie, Parcours "Structural Biology of Pathogens",
  • Study of the MreD interactome and its role in bacterial fitness and virulence (details), contact : V. Job (IBS/PB&RC) - Master biologie, Parcours "Immunology, Microbiology, Infectious Diseases",
  • Sequencing of proteins using mass spectrometry (details), contact : E. Boeri (IBS/EPIGEN) - Master biologie, Parcours "Structural Biology of Pathogens",
  • Mechanisms of peptidoglycan transpeptidation (details), contact : A. Zapun (IBS/PG) - Master biologie, Parcours "Structural Biology of Pathogens",
  • Protein-induced cross-link of heparan sulfate : structural remodelling of glycocalyx and functional effects (details), contact : R. Sadir (IBS/SAGAG) - Master biologie, Parcours Integrative Structural Biology (ISB)
  • Directed evolution of Influenza virus inhibitors (details), contact : D. Hart (IBS/VRM) - Master biologie, Parcours "Structural Biology of Pathogens" - STAGE POURVU
  • Study and characterization of protein complexes involving HIV-1 Rev and cellular host proteins (details), contact : M. Noirclerc (IBS/EPIGEN) - Master biologie, Parcours "Structural Biology of Pathogens",
  • Characterization of the megacomplex involved in the biosynthesis of the genotoxin colibactin in E. coli (details), contact : P. Macheboeuf (IBS/PATBAC) - Master biologie, Parcours "Structural Biology of Pathogens",
  • Study and optimization of the fluorescent protein mScarlet through the analysis of several mutants (details), contact : J. Dupuy (IBS/GSY) - Master biologie, Parcours "Structural Biology of Pathogens",
  • Determination of the structure of bacteriophage T5 Receptor Binding Protein (pb5) by cryo-EM (details), contact : C. Breyton (IBS/M&P) - Master biologie, Parcours "Structural Biology of Pathogens",
  • Study of the kinetics and bacterial cooperation in cell intoxication by Pseudomonas aeruginosa (details), contact : E. Faudry (IBS/PB&RC) - Master biologie, Parcours "Immunology, Microbiology, Infectious Diseases" - POURVU
  • Study of the MreD interactome and its role in bacterial fitness and virulence (details), contact : V. Job (IBS/PB&RC) - Master biologie, Parcours "Immunology, Microbiology, Infectious Diseases".

Sujets 2021-2022 transmis au Master Chimie de l’UGA

  • Mass spectrometry-based sequencing of soluble and membrane proteins (details), contact : E. Boeri (IBS/EPIGEN) - Master Chimie, Parcours "Chemistry for Life Sciences (CLS)"
  • Study of phototransformable fluorescent proteins photoreactions as a function of the lo-cal physicochemical environment (details), contact : M. Byrdin (IBS/I2SR) - Master Chimie, Parcours "Chemistry for Life Sciences (CLS)"

En 2019-2020, les sujets suivants ont été proposés aux autres départements de l’UGA :

Sujets 2019-2020 à destination du Master Ingénierie Santé (IS) de l’UGA :

  • Identification & validation of inhibitors of the hNTH1-YB1 interface : a new therapeutic strategy for the treatment of drug-resistant tumours (details), contact : J. Timmins (IBS/VIC)

Sujets 2019-2020 à destination des M2 Matière Quantique, Matière Complexe Matière du Vivant, Nanochimie, Nanobiologie et Nanophysique (en cours de saisie) :

  • Stress response in bacteria / Electron microscopy (details), contact : I. Gutsche & A. Desfosses (IBS/MICA)
  • Serial protein crystallography : development of a sample delivery system using the Gas Dynamic Virtual Nozzle (GDVN) technology (details), contact : G. Schiro (IBS/DYNAMOP)
  • Can fluorescent proteins be further improved ? (details), contact : M. Byrdin (IBS/DYNAMOP)

Autres financements