Sujets de stage M2

Sujets 2020-2021 transmis au Master Biologie de l’UGA

Saisie en cours

• Exploring the link between the human microbiome and cancer development (details), contact : P. Macheboeuf (IBS/PATBAC) - Master biologie, Parcours Integrative Structural Biology (ISB) - POURVU

• Structural specificities of HSulf isoforms (details), contact : R. Vivès (IBS/SAGAG) - Master biologie, Parcours Integrative Structural Biology (ISB) - POURVU

• Molecular insight into heparan sulfate chain elongation (details), contact : R. Wild (IBS/SAGAG) - Master biologie, Parcours Integrative Structural Biology (ISB) - POURVU

• Structure determination of the DNA polymerase complex of vaccinia virus (details), contact : W. Burmeister (IBS/VRM) - Master biologie, Parcours Integrative Structural Biology (ISB)

• Characterization of the interaction between new recombinant Immunoglobulins M and the complement (details), contact : J.B. Reiser (IBS/IRPAS & Wai Li Ling (IBS/MEM) - Master biologie, Parcours Integrative Structural Biology (ISB) ou Immunology, Microbiology, Infectious Diseases (IMID)

• Cryo-electron microscopy structure of connexin26 (details) ; contact : Wai Li Ling (IBS/MEM) - Master biologie, Parcours Integrative Structural Biology (ISB)

• Structural and dynamical study by NMR of the interactions between bacterial cell-wall components and L.D-transpeptidases in mycobacteria (details), contact : C. Bougault (IBS/NMR) - Master biologie, Parcours Integrative Structural Biology (ISB) - POURVU

• Structural studies on targeted RNA degradation (details), contact : J. Kadlec (IBS/VIC) - Master biologie, Parcours Integrative Structural Biology (ISB) ou Physiology, Epigenetics, Differentiation, Cancer (PEDC)

• Characterization of a novel ribosome quality control system in extremophiles (details), contact : B. Franzetti (IBS/ELMA) - Master biologie, Parcours Integrative Structural Biology (ISB)

• Protein-induced clustering of heparan sulfate : structural remodelling of glycocalyx and functional effects (details), R. Sadir (IBS/SAGAG) - Master biologie, Parcours Integrative Structural Biology (ISB)

• Mass spectrometry-based sequencing of soluble and membrane proteins (details), contact : E. Boeri-Erba (IBS/VIC) - Master biologie, Parcours Integrative Structural Biology (ISB)

• Complement C1s in diseases (details), contact : V. Rossi & C. Gaboriaud (IBS/IRPAS) - Master biologie, Parcours Integrative Structural Biology (ISB) ou Immunology, Microbiology, Infectious Diseases (IMID) - POURVU

• Molecular basis of avian influenza polymerase adaptation to human hosts (details), contact : M. Blackledge (IBS/FDP) - Master biologie, Parcours Integrative Structural Biology (ISB)

• Optimization of the red fluorescent protein mScarlet through mutational and structural analysis (details), contact : J. Dupuy (IBS/GSY) - Master biologie, Parcours Integrative Structural Biology (ISB) ou Immunology, Microbiology, Infectious Diseases (IMID)

• Novel regulation of potassium channels by opioid receptors (details), contact : M. Vivaudou (IBS/CHANNELS) - Master biologie, Parcours Integrative Structural Biology (ISB) ou Neurosciences and Neurobiology

• Design of light-gated potassium channels (details), contact : M. Vivaudou (IBS/CHANNELS) - Master biologie, Parcours Integrative Structural Biology (ISB) ou Neurosciences and Neurobiology

• Revealing the mechanism of action of intrinsically disordered scaffold proteins in MAPK cell signaling by NMR spectroscopy (details), M. Ringkjobing-Jensen (IBS/FDP) - Master biologie, Parcours Integrative Structural Biology (ISB)

Sujets 2020-2021 transmis au Master Chimie de l’UGA

Saisie en cours

• Structural and dynamical study by NMR of the interactions between bacterial cell-wall components and L,D-transpeptidases in mycobacteria (details), contact : C. Bougault (IBS/NMR) - Master biologie, Parcours Integrative Structural Biology (ISB) - Master Chimie, Parcours "Chemistry for Life Sciences (CLS)" - POURVU

• Structural study of the metal cluster maturation of Nitrogenase (details), contact : M. Cherrier (IBS/METALLO) - Master Chimie, Parcours "Chemistry for Life Sciences (CLS)"

• Structural characterization of the protein DarE involved in the synthesis of the antibiotic darobactin (details), contact : Y. Nicolet (IBS/METALLO) - Master Chimie, Parcours "Chemistry for Life Sciences (CLS)"

• Mass spectrometry-based sequencing of soluble and membrane proteins (details), contact : E. Boeri-Erba (IBS/VIC) - Master Chimie, Parcours "Chemistry for Life Sciences (CLS)"

En 2019-2020, les sujets suivants ont été proposés aux autres départements de l’UGA :

Sujets 2019-2020 à destination du Master Ingénierie Santé (IS) de l’UGA :

• Identification & validation of inhibitors of the hNTH1-YB1 interface : a new therapeutic strategy for the treatment of drug-resistant tumours (details), contact : J. Timmins (IBS/VIC)

Sujets 2019-2020 à destination des M2 Matière Quantique, Matière Complexe Matière du Vivant, Nanochimie, Nanobiologie et Nanophysique (en cours de saisie) :

• Stress response in bacteria / Electron microscopy (details), contact : I. Gutsche & A. Desfosses (IBS/MICA)

• Serial protein crystallography : development of a sample delivery system using the Gas Dynamic Virtual Nozzle (GDVN) technology (details), contact : G. Schiro (IBS/DYNAMOP)

• Can fluorescent proteins be further improved ? (details), contact : M. Byrdin (IBS/DYNAMOP)

Autres financements 2019-2020

• Stage M2 (avec possiblité de poursuite en thèse) pour étudier la contribution de la dynamique dans la liaison d’un médicament à sa cible biologique à l’aide de la spectroscopie RMN (details), contact : J. Boisbouvier (IBS/NMR) - STAGE POURVU

• Dans le cadre d’un projet du réseau NeuroCog (IDEX UGA), le groupe MEMBRANE dispose d’un financement pour un stage M2 portant sur la Caractérisation fonctionnelle d’un alcaloïde bio-inspiré pour le traitement de la maladie d’Alzheimer (details) ; contact : C. Moreau (IBS/MEMBRANE) - STAGE POURVU

• Stage M2 pour étudier la capacité des ions nanométriques inorganiques à solubiliser les protéines membranaires sous une forme fonctionnelle (details), contact : C. Ebel (IBS/M&P) - STAGE POURVU