2021

Malgré leur espérance de vie de 1 à 3 ans, les tardigrades sont de micro-animaux aquatiques remarquables par leur capacité à survivre pendant de très longues périodes à des conditions de stress aussi diverses et létales que des températures et pressions extrêmes, la dessiccation ou même l’irradiation. Les mécanismes moléculaires leurs conférant cette résistance unique aux conditions extrêmes restaient jusqu’alors inconnus en dépit de l’intérêt vieux de plusieurs siècles que les tardigrades (…)

Les protéines intrinsèquement désordonnées (PID) ne possèdent pas de structure tridimensionnelle stable et bien définie. Elles sont extrêmement dynamiques, et cette propriété leur permet d’exercer leurs fonctions en se liant aisément et efficacement à toute une diversité de partenaires. A défaut de pouvoir leur attribuer une unique structure, les PIDs doivent être décrites en termes d’ensembles de conformations, reflétant un paysage conformationnel propre à chacune. Classiquement, obtenir (…)

L’équipe ‘Adénovirus’, dirigée par Pascal Fender au sein du groupe Microscopie Electronique & Méthodes de l’IBS, travaille sur les protéines de l’adénovirus impliquées dans l’entrée de ce virus, qui infecte de nombreuses espèces animales ainsi que l’homme. Cette équipe a découvert une particule protéique pseudo-virale non infectieuse mimant ce virus : l’ADDomerTM. En 2016, en collaboration avec l’EMBL de Grenoble, les chercheurs ont modifié cette particule pour exposer des épitopes de (…)

Andrea Dessen, responsable du groupe Pathogénie Bactérienne de l’IBS, est lauréate de la Médaille d’Argent du CNRS pour l’année 2021. Cette médaille distingue des chercheurs et des chercheuses pour l’originalité, la qualité et l’importance de leurs travaux, reconnus sur le plan national et international. Andrea Dessen, ingénieur chimiste diplômée à l’Université de Rio de Janeiro, a effectué sa thèse à l’Université de New York. Ce travail a été suivi de deux stages postdoctoraux, au Albert (…)

Hélène Malet, Maître de Conférences à l’Université Grenoble Alpes et chercheuse dans le groupe de Microscopie Électronique et Méthodes de l’IBS, est lauréate de la Médaille de bronze du CNRS pour l’année 2021 pour ses travaux sur les protéines virales impliquées dans le fonctionnement de la réplication et la transcription virale. Cette médaille récompense le premier travail d’un(e) chercheur, qui fait de elle/lui un(e) spécialiste de talent dans son domaine. La réplication et la (…)

Les bactéries adoptent une morphologie qui leur permet de s’adapter la pression sélective de leur environnement, ce qui en fait un critère essentiel à leur survie. Cette forme est intimement liée à la synthèse de la paroi bactérienne. Chez les bactéries à Gram +, telle que S. pneumoniae, la paroi est principalement composée d’une couche épaisse de peptidoglycane (PG), qui forme un réseau de sucres et de peptides à la surface de la cellule. Bien que les machineries de synthèse du PG, appelées (…)

Les protéines fluorescentes de la famille GFP qui changent d’état lorsqu’elles sont éclairées à des longueurs d’onde spécifiques sont des marqueurs largement utilisés en imagerie super-résolution. Les propriétés photophysiques de ces protéines dépendent toutefois de manière cruciale des conditions environnementales dans lesquelles elles sont exprimées et utilisées. Actuellement, les stratégies basées sur la conception rationnelle pour améliorer les propriétés de ces protéines fluorescentes (…)

La protéine Spike du SARS-CoV-2 est connue pour se lier aux récepteurs ACE2 à la surface des cellules surtout dans les poumons, permettant ainsi l’entrée du virus dans les cellules humaines. Les scientifiques de l’Institut Laue-Langevin (ILL), en collaboration avec l’Institut de Biologie Structurale (IBS), l’Institut Paul Scherrer (PSI) et l’Australian Nuclear Science and Technology Organisation (ANSTO), se sont concentrés sur les interactions entre la protéine Spike et le reste de la (…)

Pseudomonas aeruginosa peut provoquer des infections nosocomiales via la toxine ExoU qui agit sur les lipides de la membrane plasmique en provoquant leur rupture et la nécrose de la cellule hôte. En découvrant que ExoU a besoin de la protéine DNAJC5 de l’hôte pour son activité nécrotique, les chercheurs de l’Irig viennent d’identifier le talon d’Achille de cette toxine. Pseudomonas aeruginosa est une bactérie pathogène opportuniste responsable d’infections nosocomiales et d’infections (…)

Les hydrogénases à [FeFe] sont des métalloenzymes capables de catalyser la réaction réversible d’oxydation de l’hydrogène moléculaire. Elles utilisent pour cela un centre organométallique unique appelé agrégat H, dont les propriétés physicochimiques et structurales servent de source d’inspiration pour l’élaboration de catalyseurs en vue d’une utilisation plus importante de l’hydrogène moléculaire comme source d’énergie renouvelable. Des chercheurs de l’IRIG lèvent un coin de voile sur les (…)

D’une manière générale, les cellules portent sur leur surface des récepteurs, dont certains servent seulement à l’accrochage des virus alors que d’autres peuvent contribuer au franchissement de la barrière cellulaire. Ainsi la glycoprotéine S, présente à la surface du Coronavirus SARS-CoV-2, permet l’entrée du virus dans les cellules humaines via son interaction avec un récepteur, l’enzyme ACE2, présent à la surface des cellules infectées. Des scientifiques du groupe M&P de l’IBS, en (…)

Le peptidoglycane (PG) est un composant essentiel de la paroi bactérienne. Il joue un rôle important dans la forme des bactéries et le processus de division cellulaire. Dû à l’importance du PG pour la survie des bactéries, sa machinerie de biosynthèse est une cible préférentielle pour le développement d’antibiotiques depuis de décennies. Cependant, les informations sur la régulation du processus d’élongation de la paroi sont très peu nombreuses. Dans ce travail nous montrons que la protéine (…)

La glycoprotéine d’enveloppe (Env) du VIH-1 est la cible principale des anticorps neutralisants, qui bloquent l’entrée du virus. Env est un trimère métastable composé du domaine de liaison aux récepteurs, gp120 et de la sous-unité de la protéine de fusion, gp41. Lors de la liaison aux récepteurs cellulaires, Env subit une série de changements de conformation, notamment au sein de gp41, qui rapproche les membranes virale et cellulaire pour catalyser la fusion membranaire et initier (…)

L’évolution est le processus biologique le plus fondamental. Il est essentiel au maintien du vivant dans un monde en perpétuel changement. Les processus d’évolution impactent l’organisation génomique, la forme, les fonctions et le phénotype des cellules et de leurs biomolécules. Décrire et comprendre les propriétés des protéines ne peut donc se faire que si leur dimension « historique » est prise en compte. En effet toutes les protéines contemporaines sont le fruit de cheminements évolutifs (…)

Un consortium international* de scientifiques, dont des chercheurs des groupes DYNAMOP et GSY de l’IBS, a décrypté le mécanisme de fonctionnement de l’enzyme Fatty Acid Photodecarboxylase (FAP), une découverte publiée dans Science le 08/04/2021. Cette photoenzyme est naturellement présente dans de nombreuses algues microscopiques et utilise l’énergie lumineuse pour catalyser la formation d’hydrocarbures à partir d’acides gras. Pour élucider le mécanisme de cette enzyme unique, les équipes (…)

La nitrogénase est une métalloprotéine essentielle qui catalyse la réduction du diazote en ammoniac à température et pression ambiante. Elle joue donc un rôle majeur du cycle global de l’azote. Elle utilise, pour cela, deux centres métalliques : le P-cluster, un centre atypique [Fe8S7] qui permet le transfert d’électron vers le site actif proprement dit qui est un centre organométallique [MoFe7S9C-(R)-homocitrate]. La biosynthèse de ce dernier nécessite l’action d’une douzaine de protéines (…)

L’action « Equipements structurants pour la recherche » du 3eme Programme d’Investissements d’Avenir EquipEx+ vise à soutenir de nouveaux équipements de recherche de standard international, pour renforcer l’excellence et la compétitivité de la recherche scientifique française. Suite à un appel à manifestations d’intérêt lancé mi-2020, 50 propositions ont été sélectionnées par un jury international et annoncées fin 2020, 32 projets notés A+ et 18 projets A pour un montant global de 422 (…)

La danse des molécules d’eau à la surface des protéines solubles leur permet d’être dynamiques et biologiquement actives. Étonnamment, des polymères attachés à une surface d’une protéine peuvent remplacer cette eau d’hydratation et garantissent le maintien de l’activité macromoléculaire. Le mécanisme par lequel les polymères se substituent à l’eau d’hydratation vient d’être découvert par des chercheurs du groupe DYNAMOP à l’IBS, en collaboration avec des collègues des Universités de (…)

Les bactéries possèdent un arsenal sophistiqué de mécanismes de défense qui leur permettent de survivre dans des conditions défavorables. Ainsi l’adaptation au stress acide et à l’hypoxie est cruciale pour la transmission des entérobactéries dans le tube digestif de leur hôte humain. A l’aide de la microscopie de fluorescence super-resolution en trois dimensions et de la cryo-microscopie electronique, les chercheurs du groupe MICA de l’IBS, en collaboration avec l’équipe Pixel du groupe I2SR (…)

Nous sommes fiers d’annoncer que Andrea Carfi, actuel vice-président et directeur de la recherche sur les maladies infectieuses chez Moderna (société qui développe le vaccin à ARNm contre la COVID-19), est un ancien doctorant de l’IBS. Après avoir obtenu un doctorat à l’IBS en 1997 sous la direction d’Otto Dideberg (désormais retraité), Andrea Carfi a effectué un post-doctorat dans le groupe du professeur Don Wiley à l’hôpital pour enfants de Boston (Université de Harvard), croisant ainsi (…)