Equipe 1 : Interactions moléculaires avec la paroi cellulaire bactérienne
Membres de l’équipe
- Francesca Mosca (doctorante)
- Alicja Razew (post doctorante)
- Isabel Ayala (ingénieur en biochimie moléculaire)
- Adrien Favier (ingénieur de recherche)
- Alicia Vallet (ingénieur plateforme RMN)
- Beate Bersch ( Chargée de recherche, CNRS)
- Catherine Bougault (MdC, UGA)
- Jean-Pierre Simorre (Directeur de recherche, CNRS )
Présentation
La compréhension de l’organisation structurale de la paroi bactérienne, et son évolution spatiale et temporelle en fonction de son environnement, reste un élément clef pour appréhender les mécanismes moléculaires se déroulant à la surface des bactéries. Nos résultats déjà publiés ont établi que la RMN du solide, combinée à la RMN en solution, est une technique de choix pour étudier finement la paroi bactérienne et les interactions entre ses différents constituants. Les spectres enregistrés sur des échantillons intacts de parois isolées, ou même de bactéries entières, montrent qu’il est possible d’obtenir des informations à l’échelle atomique sur son organisation ou sa maturation, notamment sous l’influence de traitements antibiotiques. Nos travaux ont démontré que la RMN est particulièrement utile pour, d’une part, étudier des interactions d’affinité faible et éventuellement transitoires comme celles d’antibiotiques et de protéines cibles (PBP, Ldt, β-lactamases), et d’autre part pour caractériser des systèmes flexibles et hétérogènes tels que l’on en trouve parmi les composants de la paroi bactérienne. Ces résultats ont permis d’élargir les études aux lipopolyssacharides recouvrant la surface cellulaire bactérienne ainsi qu’à leurs interactions avec leur système de transport à travers la paroi.
En parallèle de ces développements, l’équipe a mené avec succès plusieurs études riches en information sur des systèmes fortement impliqués dans les phénomènes de résistance aux antibiotiques ou sur de potentielles cibles pour le développement de nouveaux antibiotiques : LpoP chez Pseudomonas aeruginosa, MapZ chez Streptococcus pneumoniae et PBP4 chez Staphyloccocus aureus. Les publications sur le système Lpo décrivent les premiers activateurs des PBP identifiés qui permettent de coupler la croissance du peptidoglycane à l’élongation ou la division cellulaire. Ces travaux apportent une compréhension fine des mécanismes moléculaires d’activation des protéines impliquées, étape clef pour analyser la régulation de la synthèse du peptidoglycane au cours du cycle cellulaire.
Projets Scientifiques en cours
- Projet ANR « OM-Pseudo » 2023-2030.
« Assemblage de la membrane externe contrôlé par la maturation du peptidoglycan chez Pseudomonas »
- Projet ITN BREAKthrough : 2023- 2026
“Breaking the barrier - An integrated multidisciplinary approach to kill Gram-negative bacteria through existing antibiotics by making their outer membrane permeable”.
- Projet NASPEC PPR « Antibiorésistance : comprendre, innover, agir ». 2021- 2026.
" Antibiotiques à spectre étroit pour lutter contre l’émergence de la résistance bactérienne "
Publications Récentes
- Monitoring Drug-Protein Interactions in the Bacterial Periplasm by Solution Nuclear Magnetic Resonance Spectroscopy.
Razew A, et al. J Am Chem Soc. 2024 Apr 3 ;146(13):9252-9260.
- MAS NMR experiments of corynebacterial cell walls : Complementary 1H- and CPMAS CryoProbe-enhanced 13C-detected experiments
Vallet A et al. J Magn Reson. 2024 Jul ;364:107708.
- Staphylococcus aureus sacculus mediates activities of M23 hydrolases
Razew A et al. , Nat Commun. 2023 Oct 23 ;14(1):6706.
- Structural features of the interaction of MapZ with FtsZ and membranes in Streptococcus pneumoniae
Hosek T et al., Sci Rep. 2020 Mar 4 ;10(1):4051. -
- Structure of the Peptidoglycan Synthase Activator LpoP in Pseudomonas aeruginosa
Caveney NA et al. Structure. 2020 Jun 2 ;28(6):643-650.