Le peptidoglycane (PG) est un polymère de quelques giga-daltons constituant l’échafaudage et l’intégrité de la paroi cellulaire bactérienne (CW). Le PG est métabolisé par un groupe large et diversifié d’hydrolases, gardiennes de la croissance et de la division cellulaires bactériennes. Les hydrolases ont été le sujet de nombreuses études au fil des années, mais la compréhension moléculaire de leur action au sein du maillage de PG manque encore.
Notre travail récent comble cette lacune en fournissant des connaissances structurelles sur l’interaction de deux peptidases apparentées de la famille M23, la lysostaphine et LytM, avec de courts fragments de PG et l’ensemble du sacculus. Grâce à la résonance magnétique nucléaire, à la modélisation basée sur ces données, à la spectrométrie de masse, à la mutagenèse dirigée par site et à des approches biochimiques, nous fournissons des détails quant aux résidus impliqués dans leur interaction avec la paroi cellulaire bactérienne. Cela nous permet de répondre à des questions concernant la relation entre la sélectivité et la spécificité de la lysostaphine et LytM et leur fonction physiologique. Nous proposons un nouveau modèle dans lequel la réticulation du PG affecte différemment l’activité de ces deux enzymes.
Avec ce travail, nous avons l’intention de mieux comprendre l’action et la régulation des hydrolases de PG dans le maillage complexe de la paroi cellulaire bactérienne. Dans une perspective plus large, notre travail servira de base à de futures recherches concernant le développement de nouveaux agents antimicrobiens.
Collaboration : I. Sabala ( Warsaw, Poland)