Reconnaissance et réparation des lésions de l’ADN

Notre équipe s’intéresse depuis longtemps aux mécanismes de réparation de l’ADN chez D. radiodurans, qui contribuent à la survie de cette espèce après une exposition à de fortes doses d’UV ou de rayonnements ionisants (Timmins and Moe, 2016).

Nous nous intéressons particulièrement aux premières étapes de la réparation de l’ADN, au cours desquelles les lésions de l’ADN sont détectées parmi un vaste excès d’ADN non endommagé puis éliminées. Cette étape s’apparente à chercher une aiguille dans une botte de foin !

Nos recherches se concentrent sur les voies de réparation par excision de bases (BER) et par excision de nucléotides (NER), qui, ensemble, sont responsables de l’élimination de tous les dommages survenant au niveau des nucléotides. Nous effectuons des études structurales et fonctionnelles des principales protéines impliquées dans ces deux voies, et comme la reconnaissance des dommages de l’ADN repose sur des interactions protéines-ADN et protéines-protéines transitoires, nous nous intéressons également à la dynamique de ces processus.

Collaborations

• Jean-Luc RAVANAT (CEA/SyMMES, Grenoble)
• François DEHEZ (LPCT, Nancy)
• Elin MOE (ITQB, Lisbon, Portugal)

Publications récentes

Moe E, Silveira CM, Zuccarello L, Rollo F, Stelter M, De Bonis S, Kulka-Peschke C, Katz S, Hildebrandt P, Zebger I, Timmins J & Todorovic S. Human Endonuclease III/NTH1 : Focusing on the [4Fe-4S] cluster and the N-terminal domain. Chem Comm (2022). DOI : 10.1039/D2CC03643F.
Seck A, De Bonis S, Saint-Pierre C, Gasparutto D, Ravanat JL & Timmins J. In vitro reconstitution of an efficient nucleotide excision repair system using mesophilic enzymes from Deinococcus radiodurans. Communications Biology (2022). 5, 127. DOI : 10.1038/s42003-022-03064-x.
Sarre A, Stelter M, Rollo F, De Bonis S, Seck A, Hognon C, Ravanat JL, Monari A, Dehez F, Moe E and Timmins J. The three Endonuclease III variants of Deinococcus radiodurans possess distinct and complementary DNA repair activities. DNA Repair (2019) 78 p. 45-59. DOI : 10.1016/j.dnarep.2019.03.014.
Timmins J and Moe E. A decade of biochemical and structural studies of the DNA repair machinery of Deinococcus radiodurans. Review article. Comput Struct Biotechnol J. (2016) 14 p. 168-176. DOI : 10.1016/j.csbj.2016.04.001.
Sarre A, Ökvist M, Klar T, Hall DR, Smålas A, McSweeney S, Moe E and Timmins J. Structural and functional characterization of two unusual endonuclease III enzymes from Deinococcus radiodurans. Journal of Structural Biology (2015) 191 (2) p. 87-99. DOI : 10.1016/j.jsb.2015.05.009.