BridgeD : Prédiction du site optimal d’insertion d’un pont disulfure dans une protéine.

Pellequer J.-L. and Chen S.-w.W. (2006) Multi-template approach to modeling engineered disulfide bonds. Proteins 65 : 192-202.

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Il existe trois raisons majeures pour lesquelles l’insertion de ponts disulfure dans une protéine est importante :

  • Stabiliser les protéines contre la dénaturation thermique - une approche souvent utilisée en biotechnologie industrielle.
  • Etudier la dynamique interne d’une protéine en bloquant un état ouvert/fermé ou actif/inactif - cette approche a permis d’étudier plusieurs mécanismes moléculaires comme le mouvement d’hélices transmembranaires en réponse à un stimulus.
  • Connecter deux domaines ou deux protéines - c’est une approche souvent employée pour stabiliser les fragments variables d’anticorps et pour nos projets sur les facteurs de coagulations
    Le concept théorique et le développement informatique ont été réalisés par Wendy Chen.