u cours de son cycle infectieux, le virus influenza entre dans le noyau de la cellule infectée pour répliquer son génome viral segmenté en de multiples copies, avant de l’exporter vers le cytoplasme et la membrane cellulaire. La protéine virale NEP (Nuclear Export Protein) joue un rôle central dans le mécanisme contrôlé de l’export nucléaire des segments d’ARN génomique viraux. La protéine interagit à la fois avec d’autres protéines virales qui s’attachent aux nouveaux segments d’ARN synthétisés et détourne des facteurs cellulaires impliqués dans l’export nucléaire de la cellule infectée.
Nous avons pour objectif d’élucider ce mécanisme peu compris au niveau moléculaire en utilisant des techniques de biochimie (production et purification de protéines recombinantes en système bactérien ou baculovirus-cellule d’insecte), de biophysique (SEC-MALS, anisotropie de fluorescence, BLI, etc.) et de biologie structurale (cryo-microscopie électronique, cristallographie, SAXS).
Modèles possibles de l’interaction de NEP avec la ribonucléoprotéine (RNP, constituée d’un segment d’ARN viral recouvert de multiples copies de la nucléoprotéine NP et de la polymérase hétérotrimérique PA-PB1-PB2 attachée aux extrémités 3’ et 5’ de l’ARN viral), la protéine virale de matrice M1 et le facteur cellulaire CRM1-RanGTP responsable de l’export nucléaire. T. Crépin
Nous nous intéressons aussi aux interactions avec les différents partenaires cellulaires que peuvent rencontrer les segments d’ARN encapsidés par la nucléoprotéine (complexe RiboNucléoProtéique, RNP) telles que des protéines de l’import nucléaire ou du système immunitaire.