Comment une enzyme fait de la place pour ses substrats

Chez les enzymes, la « 1ère sphère de coordination  » décrit la liaison d’un ou plusieurs substrats au site actif, tandis que les ligands protéiques qui servent à le(s) orienter correctement sont généralement définis comme appartenant à la « 2ème sphère de coordination ». Les éléments protéiques qui se trouvent au-delà de ce point, et qui peuvent encore affecter la catalyse, font partie de la « sphère de coordination externe ». La quinolinate synthase est un bon exemple de cette classification car, en plus d’avoir un site actif et des résidus qui fixent ses substrats, elle module le volume de ce site par des changements conformationnels internes remarquables.

Quinolinate synthase : an example of the roles of the second and outer coordination spheres in enzyme catalysis. Juan C. Fontecilla-Camps* and Anne Volbeda. Chem Rev. (2022) doi : 10.1021/acs.chemrev.1c00869.

Contact : Juan Carlos Fontecilla-Camps chercheur CEA de l’IBS (groupe Métalloprotéines)