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Institut de Biologie StructuraleGrenoble / France

Contacts relatifs à cet article / BOURGEOIS Dominique

Groupe Imagerie Intégrée de la Réponse au Stress (I2SR)

Responsable : Dominique BOURGEOIS

Présentation générale

Le groupe I2SR étudie les mécanismes de réponse au stress chez les procaryotes et les eucaryotes en utilisant des approches intégrées de biologie cellulaire structurelle et, en particulier, des techniques avancées d’imagerie par fluorescence. Le groupe est composé de :

- L’équipe PIXEL dirigée par Dominique BOURGEOIS
- L’équipe GenOM dirigée par Joanna TIMMINS
- La plateforme d’imagerie M4D dirigée par Jean-Philippe KLEMAN

Le groupe a été créé grâce à une approche ascendante, réunissant une équipe axée sur la méthodologie (PIXEL) et une équipe axée sur la biologie (GenOM) pour créer une véritable synergie avec des interactions étroites de bénéfices mutuels.
Nous nous intéressons aux réponses cellulaires aux stress tels que les UV et les rayonnements ionisants et l’un de nos organismes modèles préférés est Deinococcus radiodurans, une bactérie fascinante dotée d’une capacité exceptionnelle de résistance aux rayonnements. Nous étudions son remarquable mécanisme de réparation de l’ADN et étudions les changements de la morphologie des cellules et des nucléoïdes qui se produisent dans des conditions normales et de stress. Nous étudions également les mécanismes de réponse au stress dans les cellules eucaryotes, notamment dans le contexte du cancer et de l’apoptose. Cette recherche biologique est étroitement liée aux développements méthodologiques dans les domaines de la recherche sur les protéines fluorescentes et de la microscopie à fluorescence avancée, notamment la microscopie de localisation de molécules uniques (SMLM). Ces développements profitent directement à la plateforme M4D et à ses utilisateurs.

Personnel

Personnel permanent

ADAM Virgile, CNRS CRCN (PIXEL)
BOURGEOIS Dominique, CNRS DR1 (PIXEL)
BYRDIN Martin, CEA E4 (PIXEL)
DE BONIS Salvatore, CEA Tech (GenOM)
FRACHET Philippe, UGA MCF HCex (PIXEL)
HANS Fabienne, UGA MCF HC (GenOM)
KLEMAN Jean-Philippe, CEA E6 (GenOM)
LACROIX Françoise, CNRS IEHC (GenOM)
TACNET Pascale, CNRS IR1 (PIXEL)
TIMMINS Joanna, CNRS DR2 (GenOM)
VAUCLARE Pierre, CNRS CRCN (GenOM)

Doctorant(e)s et Post-doctorant(e)s

BANNEVILLE Anne-Sophie, PhD student (GenOM)
DUFOUR Samy, PhD student (PIXEL)
GLUSHONKOV Oleksandr, Post-doc (PIXEL)
MANTOVANELLI Angela, PhD student (PIXEL)
SECK Anna, PhD student (GenOM)
WULFFELE Jip, PhD student (PIXEL)

Mots clés

Integrated structural cell biology ; Stress response ; Deinococcus radiodurans ; Cancer ; Apoptosis ; Protein dynamics ; Super-resolution fluorescence microscopy ; X-ray crystallography.

Techniques spécialisées

Molecular biology & Mutagenesis
Biochemistry (activity assays ; interaction studies ; FRET)
Protein expression & purification
Fluorescent protein engineering
Macromolecular crystallography
Kinetic crystallography
Conventional fluorescence microscopy (spinning disk confocal, video microscopy, FRAP)
Single-molecule localization microscopy (PALM, dSTORM, PAINT), single-particle tracking
Microspectrophotometry

Services disponibles

M4D platform (Jean-Philippe KLEMAN)

Publications marquantes

M. Byrdin, C. Duan, D. Bourgeois, K. Brettel. “A Long-Lived Triplet State Is the Entrance Gateway to Oxidative Photochemistry in Green Fluorescent Proteins”. J. Am. Chem. Soc., (2018), 140, 2897-2905. Doi : 10.1021/jacs.7b12755

E. de Zitter, D. Thédié, V. Mönkemöller, S. Hugelier, J. Beaudouin, V. Adam, M. Byrdin, L. Van Meervelt, P. Dedecker*& D. Bourgeois* .“Mechanistic investigation of mEos4b suggests a strategy to reduce track interruptions in sptPALM”. Nature Meth., (2019) 16, 707-710.

K. Floc’h, F. Lacroix, P. Servant, P. Servant, Y.S. Wong, J.P. Kleman, D. Bourgeois & J. Timmins. “Cell morphology and nucleoid dynamics in dividing
Deinococcus radiodurans”. Nature Commun., (2019), 10, 3815

E. De Zitter, J. Ridard, D. Thédié, V. Adam, B. Lévy, M. Byrdin, G. Gotthard, L. Van Meervelt, P. Dedecker, I. Demachy, and D. Bourgeois*.“Mechanistic Investigations of Green mEos4b Reveal a Dynamic Long-Lived Dark State”. J. Am. Chem. Soc., (2020), 142, 10978–10988. Doi : 10.1021/jacs.0c01880

Pour consulter l’ensemble des publications du groupe depuis 2014, cliquer ici (lien à venir)