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Institut de Biologie StructuraleGrenoble / France

Présentation équipe Pellequer

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Membres

Responsable de l’équipe : Jean-Luc Pellequer (Chercheur CEA, HDR)

Membres de l’équipe :

- Jean-Marie Teulon (Ingénieur CEA)
- Jean-Luc Pellequer (Chercheur CEA) ORCID iD iconorcid.org/0000-0002-8944-2715
- Daphna Fenel (Technicienne CEA, 20%)
- Shu-wen W. Chen (Chercheur CDD)
- Harinderbir Kaur (Etudiante Thèse ITN Marie Curie)

Présentation

L’équipe AFM vise à développer des techniques d’analyse en microscopie à force atomique (AFM) selon trois axes majeurs : l’imagerie haute résolution, la spectroscopie dynamique de force et la biomécanique cellulaire. Les projets en cours sont :

  • Bionanomécanique sur racine de plante —> Un projet Européen ITN a été accordée au consortium Phys2BioMed, un groupe de chercheurs issus principalement de notre précédente action COST TD1002. Le projet vise à étudier la réponse mécanique des tissus racinaires lors de stress abiotiques pour comprendre les voies de signalisation multistress STOP1-LPR1 chez les plantes Arabidopsis.
  • Développements méthodologiques —> L’activité à long terme dans le développement de méthodes telles que le traitement d’images sera poursuivie. De nouveaux développements pour l’analyse des courbes force-indentation sont développés. Ceci est important pour extraire le module de Young (élasticité) des cellules pour lesquelles le manque actuel de programmes automatisés précis est un handicap pour développer de nouvelles mesures de systèmes complexes comme les racines de plantes vivantes.
  • Métrologie et nanotoxicologie —> L’équipe participe à une comparaison interlaboratoire nationale de techniques pour déterminer la taille des nanoparticules. L’équipe est co-leader sur la technique AFM.

Pour de plus amples informations, merci de contacter Jean-Luc Pellequer

Mots clés

- Microscopie à Force Atomique, Spectroscopie Dynamique de Force, Nanomecanique, Traitement d’image, Métrologie de Nanoparticule, Reconstruction de structures à base d’AFM, Modélisation comparative.

Instruments de l’équipe

- Multimode 8, Nanoscope V (Bruker)
- Dimension 3100, Nanoscope V (Bruker)
Instruments associés aux microscopes :
- Microscope fluo, Nikon Eclipse TE2000
- Lampe UV/Ozone
- Incubateur réfrigéré Memmert IPP100+ équipé avec un lampe LED 45W full spectrum

Publications notables

  • Uroda T, Chillon I, Annibale P, Teulon J-M, Pessey O, Karuppasamy M, Pellequer JL and Marcia M
    Visualizing the functional 3D shape and topography of long noncoding RNAs by single-particle atomic force microscopy and in-solution hydrodynamic techniques.
    Nat. Protoc. 2020, 15 : 2107-2139.
  • Uroda T, Anastasakou E, Rossi A, Teulon JM, Pellequer JL, Annibale P, Pessey O, Inga A, Chillon I and Marcia M
    Conserved pseudoknots in lncRNA MEG3 are essential for stimulation of the p53 pathway.
    Mol. Cell 2019, 75 : 1-14.
  • Silvestre-Roig C, Braster Q, Wichapong K, Lee EY, Teulon JM, Berrebeh N, Winter J, Adrover JM, Santos GS, Froese A, Lemnitzer P, Ortega-Gómez A, Chevre R, Marschner J, Schumski A, Winter C, Perez-Olivares L, Pan C, Paulin N, Schoufour T, Hartwig H, González-Ramos S, Kamp F, Megens RTA, Mowen KA, Gunzer M, Maegdefessel L, Hackeng T, Lutgens E, Daemen M, von Blume J, Anders H-J, Nikolaev VO, Pellequer JL, Weber C, Hidalgo A, Nicolaes GAF, Wong GCL and Soehnlein O
    Externalized histone H4 orchestrates chronic inflammation by inducing lytic cell death.
    Nature 2019, 569 : 236-240.
  • Teulon JM, Godon C, Chantalat L, Moriscot C, Cambedouzou J, Odorico M, Ravaux J, Podor R, Gerdil A, Habert A, Herlin-Boime N, Chen SwW and Pellequer JL
    On the operational aspects of measuring nanoparticle sizes.
    Nanomaterials 2019, 9 : 18. (cover)
  • Balzergue C, Dartevelle T, Godon C, Laugier E, Meisrimler C, Teulon JM, Creff A, Bissler M, Brouchoud C, Hagège A, Müller J, Chiarenza S, Javot H, Becuwe-Linka N, David P, Péret B, Delannoy E, Thibaud M-C, Armangaud J, Abel S, Pellequer JL, Nussaume L and Desnos T
    Low phosphate activates STOP1-ALMT1 to rapidly inhibit root cell elongation.
    Nat. Commun. 2017, 8 : 15300.
  • Schillers H, Rianna C, Schäpe J, Luque T, Doschke H, Wälte M, Uriarte JJ, Campillo N, Michanetzis GP, Bobrowska J, Dumitru A, Herruzo ET, Bovio S, Parot P, Galluzzi M, Podestà A, Puricelli L, Scheuring S, Missirlis Y, Garcia R, Odorico M, Teulon JM, Lafont F, Lekka M, Rico F, Rigato A, Pellequer JL, Oberleithner H, Navajas D and Radmacher M
    Standardized Nanomechanical Atomic force microscopy Procedure (SNAP) for measuring soft and biological samples.
    Sci. Rep. 2017, 7 : 5117.
  • Chen SwW, Odorico M, Meillan M, Vellutini L, Teulon JM, Parot P, Bennetau B and Pellequer JL
    Nanoscale structural features determined by AFM for single virus particles.
    Nanoscale 2013, 22 : 10877-10886.
  • Trinh MH, Odorico M, Pique ME, Teulon JM, Roberts VA, Ten Eyck LF, Getzoff ED, Parot P, Chen SwW and Pellequer JL
    Computational reconstruction of multidomain proteins using atomic force microscopy data.
    Structure 2012, 20 : 113-120.

L’ensemble des publications de ce groupe peut être consulté __ici__