Groupe Pathogénie Bactérienne
Responsable : Andrea DESSEN, Ph.D. (Directeur de recherche CNRS) (BR)
Prix Charles-Louis de Saulses de Freycinet 2015
Médaille, Academie des Sciences
Présentation
Le groupe Pathogénie Bactérienne possède un laboratoire principal en France (IBS Grenoble) et, depuis 2012, une antenne au Brésil (LNBio Campinas). Cette organisation est soutenue par le CNRS, le CEA, et l’Université de Grenoble sous forme d’un ’Laboratoire International Associé’, et par la Fondation de l’Etat de Sao Paulo pour la Recherche (FAPESP). De plus amples informations concernant le groupe de Campinas peuvent être obtenues via les liens suivants :
En français : www.cnrsrio.org
En anglais : agencia.fapesp.br
Thèmes de recherche
Notre groupe s’intéresse à l’étude des mécanismes employés par la bactérie pour initier l’infection et se concentre pour cela sur différents systèmes :
La paroi bactérienne : complexes macromoléculaires et cibles pour le développement d’antibiotiques
Les facteurs de virulence et les systèmes de sécrétion
Equipe Grenoble
Membres permanents :
Alexandre DOS SANTOS MARTINS (Technicien supérieur CEA) (PT)
Carlos CONTRERAS-MARTEL, Ph.D. (Charge de recherche CNRS) (CL)
Pauline MACHEBOEUF, Ph.D. (Charge de recherche CNRS) (FR)
Post-doctorants :
Mayara MIYACHIRO (BR)
Doctorants :
Jean-Mathieu DESVEAUX (FR)
Sarah BONHOMME (FR)
Kevin DUARTE (FR)
Stagiaires :
Michael JENKINS (IR)
Equipe Campinas
Membres permanents :
Daniel TRINDADE, Ph.D. (BR)
Post-doctorants :
Doctorants :
Yuri DE OLIVEIRA SILVA (BR)
Étudiants de master :
Caique CAMARGO MALOSPIRITO (BR)
Karina SHIRAKAWA (BR)
Techniques spécialisées
Nous utilisons des techniques de biologie moléculaire (mutagénèse dirigée, clonage polycistronique), de la biochimie (expression et purification de protéines recombinantes, pontage chimique, analyses enzymatiques), cristallographie aux rayons X et de la microscopie électronique, pour pouvoir corréler la structure d’une protéine, d’un complexe protéine-ligand ou multi-protéique avec sa fonction dans la cellule ou pendant le processus infectieux.
Mots clés
Infection bactérienne, machineries macromoléculaires, biologie structurale.
Thèses
La consultation des thèses soutenues par des membres du groupe est possible ici.
Publications marquantes
2019
Miyachiro MM, Granato D, Trindade DM, Ebel C, Paes Leme AF, Dessen A (2019) Complex formation between Mur enzymes from Streptococcus pneumoniae. Biochemistry, in press
Howard SP, Estrozi L, Bertrand Q, Contreras-Martel C, Job V, Martins A, Schoehn G, Dessen A (2019) Structure and assembly of pilotin-dependent and -independent secretins of the Type II secretion system. PLoS Pathog. 15 : e1007731.
Laddomada F, Miyachiro MM, Jessop M, Patin D, Job V, Mengin-Lecreulx D, Le Roy A, Ebel C, Breyton C, Gutsche I, Dessen A (2019) The MurG glycosyltransferase provides an oligomeric scaffold for the cytoplasmic steps of peptidoglycan biosynthesis in Bordetella pertussis. Sci. Rep., 9 : 4656.
Lombardi C, Tolchard J, Bouillot S, Signor L, Gebus C, Liebl D, Fenel D, Teulon J-M, Habenstein B, Pellequer J-L, Faudry E, Loquet A, Attree I, Dessen A, Job V (2019) Structural and functional characterization of the Type III secretion system (T3SS) needle of Pseudomonas aeruginosa. Front. Microbiol. 10, 573.
2018
Dortet L, Lombardi C, Cretin F, Dessen A, Filloux A (2018) Pore-forming activity of the Pseudomonas aeruginosa type III secretion system translocon alters the host epigenome. Nature Microbiol. 3:378-386.
Zouhir S, Robert-Genthon M, Trindade DM, Job V, Nedeljković M, Breyton C, Ebel C, Attree I, Dessen A (2018) Assembly of an atypical macroglobulin complex from Pseudomonas aeruginosa. Sci. Rep. 8 : 527
Trouvé J, Mohamed A, Leisico F, Contreras-Martel C, Liu B, Mas C, Rudner DZ, Rodrigues CD, Morlot C (2018) Structural characterization of the sporulation protein GerM from Bacillus subtilis. J. Struct. Biol. 204 ; 481-490.
Morlot C, Straume D, Peters K, Hegnar O, Simon N, Villard AM, Contreras-Martel C, Leisico F, Breukink E, Gravier-Pelletier C, Le Corre L, Vollmer W, Pietrancosta N, Havarstein L, Zapun A. (2018) Nature Commun. 9 : 3180.
2017
Contreras-Martel C, Martins A, Ecobichon C, Trindade DM, Mattei PJ, El Ghachi M, Hicham S, Hardouin P, Boneca IG, Dessen A (2017) Molecular architecture of the PBP2:MreC core bacterial cell wall synthesis complex. Nature Comm. 8 : 776.
Bonnet J, Cartannaz J, Tourcier G, Contreras-Martel C, Kleman JP, Morlot C, Vernet T, Di Guilmi AM (2017) Autocatalytic association of proteins by covalent bond formation : a bio molecular welding toolbox derived from a bacterial adhesion. Sci. Rep. 7 : 43564.
Mayrink Assis L, Nedeljković M, Dessen A (2017) New strategies for targeting of multi-drug resistant Staphylococcus aureus. Drug Res. Updates 31 : 1-14.
Calvez P, Breukink E, Roper DI, Dib M, Contreras-Martel C, Zapun A (2017) Substitutions in PBP2b from b-lactam resistant Streptococcus pneumoniae have different effects on enzymatic activity and drug reactivity. J. Biol. Chem. 292 : 2854-2865.
2016
Laddomada F, Miyachiro MM, Dessen A (2016) Structural insights into protein-protein interactions involved in bacterial cell wall biogenesis. Antibiotics 5 : E14.
Berardozzi R, Adam V, Martins A, Bourgeois D (2016) Arginine 66 controls dark-state formation in green-to-red photoconvertible fluorescent proteins. J. Am. Chem. Soc. 138 : 558-565.
El Khatib M, Martins A, Bourgeois D, Colletier JP, Adam V (2016) Rational design of ultrastable and reversibly photoswitchable fluorescent proteins for super-resolution imaging of the bacterial periplasm. Sci. Rep. 6 : 18459.
da Mata Madeira PV, Zouhir S, Basso P, Neves D, Laubier A, Salacha R, Bleves S, Faudry E, Contreras-Martel C, Dessen A (2016) Structural basis of lipid targeting and destruction by the type V secretion system of Pseudomonas aeruginosa. J. Mol. Biol. 428 : 1790-1803.
Sink R, Kotnik M, Zega A, Barreteau H, Gobec S, Blanot D, Dessen A, Contreras-Martel C (2016) Crystallographic study of peptidoglycan biosynthesis enzyme MurD : domain movement revisited. PLoS One : 11, e0152075.
2015
Shaik M, Lombardi C, Trindade DM, Fenel D, Schoehn G, Di Guilmi AM, Dessen A (2015) A structural snapshot of type II pilus formation in Streptococcus pneumoniae. J. Biol. Chem. 290 : 22581-22592.
Bisson-Filho AW, Discola KF, Castellen P, Blasios V, Martins A, Sforça M, Garcia W, Zeri AC, Erickson HP, Dessen A, and Gueiros-Filho FJ (2015) FtsZ filament capping by MciZ, a developmental regulator of bacterial division. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 112 : E2130-E2138.
Lantez V, Nikolaidis I, Rechenmann M, Vernet T, Noirclerc-Savoye M (2015) Rapid automated detergent screening for the solubilization and purification of membrane proteins and complexes. Eng. Life Sci. 15:39-50.
2014
Wong SG and Dessen A (2014) Structure of a bacterial alpha2-macroglobulin reveals mimicry of eukaryotic innate immunity. Nature Comm. 5 : 4917
Tosi T, Estrozi LF, Job V, Guilvout I, Pugsley AP, Schoehn G, and Dessen A (2014) Structural similarity of secretins from type II and type III secretion systems. Structure 22:1348-1355.
Shaik MM, Maccagni A, Tourcier G, Di Guilmi AM, and Dessen A (2014) Structural basis of pilus anchoring by the ancillary pilin RrgC of Streptococcus pneumoniae. J. Biol. Chem. 289 : 16988-16997.
Lebreton A, Job V, Ragon M, Le Monnier A, Dessen A, Cossart P, and Bierne H (2014) Structural basis for the inhibition of the chromatin receptor BAHD1 by the bacterial nucleomodulin LntA. MBio 5 : e00775-e00713.
Nikolaidis I, Favini-Stabile S, and Dessen A. (2014) Resistance to antibiotics targeted to the bacterial cell wall. Prot. Sci. 23 : 243-259.
Discola KF, Forster A, Simorre JP, Attree I, Dessen A, Job V(2014) Membrane chaperone recognition by the major translocator protein PopB of the type III secretion system of Pseudomonas aeruginosa. J. Biol. Chem. 289 : 3591-3601.
Flayhan A, Vellieux FM, Lurz R, Maury O, Contreras-Martel C, Girard E, Boulanger P, Breyton C (2014) Crystal structure of pb9, the distal tail protein of bacteriophage T5 : a conserved structural motif among all siphophages. J. Virol. 88 : 820-828.
La consultation de l’ensemble des publications du groupe est possible ici.
Bourses
Le groupe Pathogénie Bactérienne cherche un candidat pour une bourse de thèse. Le projet concerne l’étude de facteurs de virulence bactériens ainsi que le criblage de banques de molécules chimiques visant l’identification de nouveaux inhibiteurs de virulence. Merci d’envoyer CV et notes (L3, M1, M2) à andrea.dessen@ibs.fr.
