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Institut de Biologie StructuraleGrenoble / France

Contacts relatifs à cet article / Vivès Romain

Activité scientifique de l’équipe SAGAG-Vivès...

Responsable : Romain Vivès


Activité scientifique de l’équipe SAGAG-Vivès

Les héparanes sulfate (HS) sont des polysaccharides sulfatés qui sont un des constituants majeurs du glycocalyx, l’épaisse couche de glycoconjugués que l’on trouve à la surface de la plupart des cellules animales (1). Grâce à ce positionnement stratégique à l’interface de la cellule et de son environnement extérieur, les HS rencontrent, fixent et modulent l’activité d’une multitude de ligands protéiques, et participent ainsi à la plupart des grands processus cellulaires (2). Ces vastes propriétés biologiques s’expliquent par la présence au sein du polysaccharide de motifs saccharidiques spécifiques (3), dont la structure et la sulfatation définit un « glycocode  » rassemblant les informations de reconnaissance et d’interaction avec les différents partenaires protéiques. La structure des HS doit dont être très finement régulée, afin de permettre à la cellule d’adapter sa réponse à tout stimuli extérieur. Récemment, il a été montré qu’une famille de sulfatases, les Sulfs jouaient un rôle majeur de régulateurs glycobiologiques, en modifiant la sulfatation des HS et leurs capacités d’interaction (4).

SAGAG Vivès : les HS

Notre équipe s’intéresse tout particulièrement à ce mécanisme enzymatique qui représente la seule machine moléculaire post-synthétique capable de réguler et modifier le glycocode des HS. Dans ce cadre, nos travaux portent sur l’étude des caractéristiques structurales de l’enzymes (5), son organisation moléculaire, ses spécificités de substrat, et les modifications post-traductionnelles essentielles pour son activité. Nous étudions également son activité enzymatique et sa fonction (6), au moyen de tests biologiques in vitro, cellulaires et in vivo disponibles au laboratoire ou par le biais des nombreuses collaborations nationales et internationales établies sur le sujet. Enfin, nous cherchons à développer des inhibiteurs basés sur des mimétiques d’HS pour le développement de nouvelles approches thérapeutiques anti-cancéreuses ciblant les Sulfs (7).

SAGAG Vivès : Etude des Sulfs

Actualités

L’équipe SAGAG-Vivès recrute !

Nous recherchons un ingénieur d’étude spécialisé en biochimie/biologie cellulaire pour un CDD de 18-24 mois.

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Actualités (Archives)

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Membres de l’équipe

Membres actuels

  • Rebecca-Joe Boustany (M2)
  • Evelyne Gout (IE CNRS)
  • Yoann Crétinon (Doctorant)
  • Jean Le Pennec (Doctorant)
  • Romain Vivès (DR CNRS)

Anciens membres (depuis 2014)

  • Marina Callandret (Master 2), actuellement en thèse (IAB, Grenoble)
  • Rubal Ravinder (collab. CERMAV, doctorante)
  • Rana El Masri (doctorante), actuellement en post-doc (l’institut Cochin, Paris)
  • Gaël Méli-duthoit (étudiant BTS par alternance)
  • Mayssa Ghaddar (Master 2)
  • Zahra al Oula Hassoun (Master 2), actuellement en thèse (Liège, Belgique).
  • Elisa Tournebize (Master 1), actuellement recrutée (SANOFI-Pasteur, Lyon).
  • Hugo Fumat (Licence 3)
  • Elodie Henriet (CDD ingénieur), actuellement en thèse (Orléans, France).
  • Adrien Laroche (Licence 3)
  • Amal Seffouh (thèse), actuellement en post-doc (Montréal, Canada).

Financements

ANR, UGA, Glyco@Alps...

Réseaux scientifiques

Collaborations scientifiques nationales

  • Dr. D. Bonnaffé, ICMMO, Orsay
  • Dr. Y. Bourne, AFMB, Marseille
  • Dr. R. Daniel, LAMBE, Université d’Evry-Val d’Essonne
  • Dr. O. Filhol-Cochet, CEA-BIG, Grenoble
  • Dr. S. Halila, CERMAV, Grenoble
  • Dr. B. Horvat, ENS, Lyon
  • Dr. B. Huard, IAB, Grenoble
  • Dr. C. le Narvor, ICMMO, Orsay

Collaborations scientifiques internationales

  • Dr. S. Ali, Newcastle University, UK
  • Dr. K. Dobra , University of Stockholm, Sweden
  • Dr. E. Schmidt, University of Colorado, USA
  • Dr. J. Van den Born, University of Groningen, the Netherlands
  • Dr. X. Yue, Louisiana State University, USA

Le GDR « Gagosciences »

Romain Vivès est coordinateur du GDR CNRS3739 « Gagosicences ». Ce GDR a été créé afin de fédérer des équipes de recherche françaises étudiant les GAGs au sein d’un réseau structuré, bâti autour de compétences diversifiées et d’approches complémentaires, et promouvant une démarche pluridisciplinaire pour la progression des connaissances en glycosciences. Les recherches conduites par les équipes membres s’articulent autour de 3 grands pôles de compétence (Biologie, Chimie et Développements méthodologiques), et l’ambition du GDR est de favoriser les échanges entre ces différentes disciplines.

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GDR GAG

Glyco@Alps

Romain Vivès est membre du comité exécutif du programme IDEX-UGA Glyco@Alps (responsable WP2). Le réseau Glyco@Alps explore la complexité et la diversité structurale fascinante des sucres, dont ceux issus de la biodiversité alpine, et se concentre sur leur exploitation dans les produits biopharmaceutiques, le diagnostic médical, la médecine personnalisée, les matériaux, la durabilité environnementale et les bio-industries innovantes. Il rassemble une centaine de chercheurs de la région grenobloise, issus de 17 laboratoires différents.

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Glyc@Alps


Publications récentes

Heparan Sulfate Biosynthesis and Sulfation Profiles as Modulators of Cancer Signalling and Progression
C. Marques, CA Reis, RR Vivès and A. Magalhães
Frontiers in Oncology, 2021, <10.3389/fonc.2021.778752.>

Preparation and characterization of Heparan sulfate derived oligosaccharides to investigate protein-GAG interaction and HS biosynthesis enzyme activity
C. Laguri, R. Sadir, E. Gout, R.R. Vivès and Hugues Lortat-Jacob
Methods in Molecular Biology , 2022, Vol. 2303, 121-137 <10.1007/978-1-0716-1398-6_11>

Regulation of fractone heparan sulfate composition in young and aged subventricular zone neurogenic niches
A. Kerever, F. Nagahara, K. Keino-Masu, M. Masu, T.H. van Kuppevelt, R.R. Vivès, and E. Arikawa-Hirasawa
Glycobiology , 2021, <10.1093/glycob/cwab081>

Interplay between CD44 receptor and passive membrane interactions of soft hyaluronan nano-platelets with cells
R. Diaz-Salmeron, J.P. Michel, R.R. Vivès, A. da Costa, S. Denis, H. Hadji, G. Ponchel and K. Bouchemal Colloids and Surfaces B : Biointerfaces , 2021, <10.1016/j.colsurfb.2021.111916>

Hypercholesterolemia in progressive renal failure associates with changes in hepatic heparan sulfate – PCSK9 interaction
. Shrestha, S. Adepu, R.R. Vivès, R. El Masri, A. Klooster, F. Kaptein, W. Dam, H.G.D Leuvenink, S. Bakker, H. van Goor, B. van de Sluis and J. van den Born
JASN , 2021, <10.1681/ASN.2020091376>

Proteinuria converts hepatic heparan sulfate to effective proprotein convertase subtilisin kexin type 9 enzyme binding partner
P. Shrestha, S. Yazdani, R.R. Vivès, R. EI Masri, W. Dam, B.van de Sluis and J.van den Born
Kidney Int. , 2021, <10.1016/j.kint.2021.01.023>

Heparan Sulfate Proteoglycans Biosynthesis and Post Synthesis Mechanisms Combine Few Enzymes and Few Core Proteins to Generate Extensive Structural and Functional Diversity
Annaval T, Wild R, Crétinon Y, Sadir R, Vivès RR, Lortat-Jacob H.
Molecules, 2020, <10.3390/molecules25184215>

HS and Inflammation : A Potential Playground for the Sulfs ?
Rana El Masri, Yoann Crétinon, Evelyne Gout, Romain R Vivès
Frontiers in Immunology, 2020, <10.3389/fimmu.2020.00570>

MASP-2 Is a Heparin-Binding Protease ; Identification of Blocking Oligosaccharides
Ditmer Talsma, Felix Poppelaars, Wendy Dam, Anita Meter-Arkema, Romain R Vivès, Peter Gál, Geert-Jan Boons, Pradeep Chopra, Annamaria Naggi, Marc Seelen, Stephan Berger, Mohamed Daha, Coen Stegeman, Jacob van den Born
Frontiers in Immunology, 2020, <10.3389/fimmu.2020.00732>

Loss of endothelial sulfatase-1 after experimental sepsis attenuates subsequent pulmonary inflammatory responses
Kaori Oshima, Xiaorui Han, Yilan Ouyang, Rana El Masri, Yimu Yang, Sarah Haeger, Sarah Mcmurtry, Trevor Lane, Pavel Davizon-Castillo, Fuming Zhang, Xinping Yue, Romain R Vivès, Robert Linhardt, Eric Schmidt
American Journal of Physiology - Lung Cellular and Molecular Physiology, 2019, <10.1152/ajplung.00175.2019>

A microscale double labelling of GAG oligosaccharides compatible with enzymatic treatment and mass spectrometry
Przybylski C, Bonnet V, Vivès RR
Chem Commun (Camb), 2019, <10.1039/c9cc00254e>

Substrate binding mode and catalytic mechanism of human heparan sulfate d-glucuronyl C5 epimerase
Debarnot C, Monneau YR, Roig-Zamboni V, Delauzun V, Le Narvor C, Richard E, Hénault J, Goulet A, Fadel F, Vivès RR, Priem B, Bonnaffé D, Lortat-Jacob H, Bourne Y
Proc Natl Acad Sci U S A, 2019, <10.1073/pnas.1818333116>

Heparan sulfate in chronic kidney diseases : Exploring the role of 3-O-sulfation
Ferreras L, Moles A, Situmorang GR, El Masri R, Wilson IL, Cooke K, Thompson E, Kusche-Gullberg M, Vivès RR, Sheerin NS, Ali S.
Biochim Biophys Acta Gen Subj, 2019, 1863(5):839-848. <10.1016/j.bbagen.2019.02.009>

Expression and purification of recombinant extracellular sulfatase HSulf-2 allows deciphering of enzyme sub-domain coordinated role for the binding and 6-O-desulfation of heparan sulfate
Seffouh A, El Masri R, Makshakova O, Gout E, Hassoun ZEO, Andrieu JP, Lortat-Jacob H, Vivès RR.
Cell Mol Life Sci. 2019 <10.1007/s00018-019-03027-2>

Mass spectrometry analysis of the human endosulfatase Hsulf-2
Seffouh I, Przybylski C, Seffouh A, El Masri R, Vivès RR, Gonnet F, Daniel R.
Biochem Biophys Rep, 2019, 18:100617.
<10.1016/j.bbrep.2019.01.010.>

A proliferation-inducing ligand-mediated anti-inflammatory response of astrocytes in multiple sclerosis
Baert L, Benkhoucha M, Popa N, Ahmed MC, Manfroi B, Boutonnat J, Sturm N, Raguenez G, Tessier M, Casez O, Marignier R, Ahmadi M, Broisat A, Ghezzi C, Rivat C, Sonrier C, Hahne M, Baeten D, Vives RR, Lortat-Jacob H, Marche PN, Schneider P, Lassmann HP, Boucraut J, Lalive PH, Huard B.
Ann Neurol., 2019, 85:406-420. <10.1002/ana.25415>

Genetic and enzymatic characterization of 3-O-sulfotransferase SNPs associated with Plasmodium falciparum parasitaemia
Ngoc Thy Nguyen, Romain R Vivès, Magali Torres, Vincent Delauzun, Els Saesen, Veronique Roig-Zamboni, Hugues Lortat-Jacob, Pascal Rihet, Yves Bourne
Glycobiology, Oxford University Press (OUP), 2018, 〈10.1093/glycob/cwy038〉

A jasmonic acid derivative improves skin healing and induces changes in proteoglycan expression and glycosaminoglycan structure
Elodie Henriet, Sibylle Jäger, Christian Tran, Philippe Bastien, Jean-François Michelet, Anne-Marie Minondo, Florian Formanek, Maria Dalko-Csiba, Hugues Lortat-Jacob, Lionel Breton, Romain R Vivès
BBA - General Subjects, Elsevier, 2017, 1861 (9), pp.2250-2260. 〈10.1016/j.bbagen.2017.06.006〉

High sodium diet converts renal proteoglycans into pro-inflammatory mediators in rats
Ryanne S. Hijmans, Pragyi Shrestha, Sarpong Ka, Saleh Yazdani, Rana El Masri, Wilhelmina H. A. De Jong, Gerjan Navis, Romain R Vivès, Jacob van Den Born
PLoS ONE, Public Library of Science, 2017, 12 (6), pp.e0178940. 〈10.1371/journal.pone.0178940. eCollection 2017〉

Solution structure of CXCL13 and heparan sulfate binding show that GAG binding site and cellular signalling rely on distinct domains
Yoan Monneau, Lingjie Luo, Nehru Viji Sankaranarayanan, Balaji Nagarajan, Romain R Vivès, Françoise Baleux, Umesh R. Desai, Fernando Arenzana-Seidedos, Hugues Lortat-Jacob
Open Biology, Royal Society, 2017, 7, pp.170133. 〈10.1098/rsob.170133〉

The "in and out" of glucosamine 6-O-sulfation : the 6th sense of heparan sulfate.
Rana El Masri, Amal Seffouh, Hugues Lortat-Jacob, Romain R Vivès

Glycoconjugate Journal, Springer Verlag, 2017, 34 (3), pp.285-298. 〈10.1007/s10719-016-9736-5〉

Heparan sulfate-dependent enhancement of henipavirus infection.
Cyrille Mathieu, Kévin P Dhondt, Marie Châlons, Stéphane Mély, Hervé Raoul, Didier Negre, François-Loïc Cosset, Denis Gerlier, Romain R Vivès, Branka Horvat
mBio, American Society for Microbiology, 2015, 6 (2), pp.e02427

Langerin-heparin interaction : two binding sites for small and large ligands as revealed by a combination of NMR spectroscopy and cross-linking mapping experiments.
Juan C Muñoz-García, Eric Chabrol, Romain R Vivès, Aline Thomas, José L De Paz, Javier Rojo, Anne Imberty, Franck Fieschi, Pedro M Nieto, Jesus Angulo
Journal of the American Chemical Society, American Chemical Society, 2015, 137 (12), pp.4100-10

Syndecan-1 alters heparan sulfate composition and signaling pathways in malignant mesothelioma
Ghazal Heidari-Hamedani, Romain R Vivès, Amal Seffouh, Nikolaos A Afratis, Arie Oosterhof, Toin H Van Kuppevelt, Nikos K Karamanos, Muzaffer Metintas, Anders Hjerpe, Katalin Dobra, Tünde Szatmári
Cellular Signalling, Elsevier, 2015, 〈10.1016/j.cellsig.2015.07.017〉

Syndecan-1 alters heparan sulfate composition and signaling pathways in malignant mesothelioma .
Ghazal Heidari-Hamedani, Romain R Vivès, Amal Seffouh, Nikolaos A Afratis, Arie Oosterhof, Toin H Van Kuppevelt, Nikos K Karamanos, Muzaffer Metintas, Anders Hjerpe, Katalin Dobra, Tünde Szatmári
Cellular Signalling, Elsevier, 2015, 27 (10), pp.2054-67