IBS - Institut de Biologie Structurale - Grenoble / France

Présentation

FAVIER Adrien — 2022-11-16T08:29:41Z

Crédit : Alicia Vallet

Actuellement, le groupe est composé de deux équipes de recherche dirigées par JP. Simorre et B. Brutscher. Les deux équipes développent et exploitent des méthodologies modernes de RMN pour répondre à diverses questions biologiques et biophysiques. Les principaux sujets de recherche actuels se concentrent sur (i) la biogenèse de la paroi cellulaire bactérienne et le développement de nouvelles stratégies antibiotiques ; et (ii) la compréhension mécanistique des transformations induites par la lumière des protéines fluorescentes et autres protéines sensibles à la lumière. Ces sujets sont principalement abordés par des méthodes de RMN, complétées par d'autres techniques biophysiques et biochimiques, notamment SAXS, la microscopie électronique et optique, et la cristallographie aux rayons X, ainsi que par des expériences in vivo/fonctionnelles. Pour mener à bien ce travail, nous avons établi un réseau de collaborateurs de renommée internationale dans ces domaines. Le groupe mène également une activité intense dans le développement de méthodes innovantes de RMN, à la fois en solution et en état solide, et a fait des efforts significatifs pour rendre ces outils disponibles à la communauté scientifique.

Transitions conformationnelles de l'ARN et activité de protéines chaperones de l'ARN (2017)

FAVIER Adrien — 2022-11-10T16:43:15Z

Les protéines chaperonnes aident les ARN à adopter leurs états fonctionnels pertinents. On sait cependant peu de choses sur les détails mécanistiques de l'activité chaperonne de l'ARN. Nous avons utilisé une combinaison de méthodes de RMN en temps réel et en régime permanent pour déchiffrer les voies de formation du duplex d'ARN de deux épingles à cheveux d'ARN complémentaires, ainsi que l'activité chaperonne de la petite protéine bactérienne de choc froid CspA sur cette réaction de repliement.
Collaborations : C. Kreutz (Innsbruck, Autriche), R. Konrat (Vienne, Autriche)

Structure transitoire d'une protéine virale intrinsèquement désordonnée (2015)

FAVIER Adrien — 2022-11-10T16:40:22Z

La protéine non structurelle 5A (NS5A) du virus de l'hépatite C joue un rôle important dans la réplication virale et la formation des particules. Les 250 résidus de l'extrémité C-terminale sont très désordonnés et présentent de nombreux sites d'interaction avec d'autres protéines virales et hôtes. Notre étude RMN a révélé la présence de structures α-hélicoïdales transitoires dans 4 régions de la séquence peptidique qui sont partiellement stabilisées par des interactions tertiaires à longue portée. Deux de ces régions α-hélicoïdales transitoires forment un motif de liaison non canonique pour une liaison de faible affinité avec les domaines SH3, et une compaction partielle lors de la phosphorylation de la protéine.
Collaborations : D. Willbold (FZ Jülich, Allemagne)

Dynamique conformationnelle de rsFolder induite par la lumière (2019)

FAVIER Adrien — 2022-11-10T16:37:16Z

Les protéines fluorescentes phototransformables (PTFP) sont des outils essentiels pour la microscopie à super-résolution (SR). L'ingénierie rationnelle des protéines fluorescentes exploite les informations mécanistiques disponibles à partir des études structurelles, principalement la cristallographie aux rayons X, afin de concevoir de nouvelles variantes de PTFP avec des propriétés améliorées pour des applications particulières. Nous appliquons ici la spectroscopie RMN en solution pour étudier les changements induits par la lumière dans la dynamique conformationnelle de rsFolder, une protéine fluorescente à commutation réversible. La vue dynamique offerte par la RMN met en évidence les régions de la protéine qui comprennent des points de mutation potentiellement intéressants pour de futures campagnes de mutagenèse.
Collaborations : D. Bourgeois (IBS Grenoble)

Étude en temps réel par RMN des états transitoires des protéines (2013)

FAVIER Adrien — 2022-11-10T16:33:02Z

Identification et caractérisation d'un processus d'échange monomère-dimère dans l'état excité de la b2 microglobuline par une combinaison de RMN en temps réel et de RMN de relaxation-dispersion CPMG. Cet état conformationnel a été montré précédemment dans notre équipe comme étant 7 fois plus enclin à l'agrégation que l'état natif.
Collaborations : A.Corazza, G. Esposito (Univ. d'Udine, Italie) ; V. Forge (iRTSV, CEA Grenoble, France)

Membres du groupe

FAVIER Adrien — 2022-10-20T16:03:24Z

Sommaire

Membres actuels

Isabel Ayala (IE CNRS)
Beate Bersch (CR CNRS)
Catherine Bougault (MDC UGA)
Bernhard Brutscher (DR CEA)
Adrien Favier (IR CNRS)
Dominique Marion (Sci. consultant)
Jean-Pierre Simorre (DR CNRS)
Alicia Vallet (IE CNRS)

Alicja Razew (postdoc)
Francesca Mosca (PhD student)
Anna Rosenkrancova (PhD student)
Yacine Ouali (M2 student)
Myriam Guissouma (AI)

Photos de groupe

2025

2020

2017

2016

2012

ALUMNI

Nom	Période	Position dans le groupe	Position actuelle
BOISBOUVIER Jérôme	-2023	Chercheur CNRS	Chercheur CNRS
IMBERT Lionel	-2023	Ingénieur CNRS	Ingénieur CNRS
LAGURI Cédric	-2023	Chercheur CNRS	Chercheur CNRS
GANS Pierre	-2023	Chercheur CEA	Retraite
GIRAUD Arthur	2020-2023	Doctorant	Chercheur permanent chez Promise (Grenoble, FR)
RIOUAL Elisa	2020-2023	Doctorante	Post-doctorante chez Riken (Wako, JP)
ABBAS Massilia	2021-2023	Doctorante	Doctorante
BOYAT Célia	2022-2023	Ingénieure de recherche
HENOT Faustine	2018-2022	Doctorante	Post-doctorante chez Sanofi (Vitry-sur-Seine, FR)
SUCEC Iva	2018-2022	Doctorante	Post-doctorante au MIT (Cambridge, USA)
SCHANDA Paul	2010-2021	Chercheur CEA	Professeur à l'IST Autriche
TROUSSICOT Laura	2020-2021	Post-doctorante	Post-doctorante à l'IBCP (Lyon)
CHRISTOU Nina Eleni	2017-2021	Doctorante	Post-doctorante chez DESY (Hambourg, DE)
MAALEJ Meriem	2017-2021	Doctorante	SME chez Solvias (Hombourg-Haut, FR)	MAITY Arijit	2021-2024	Post-doctorand
	TÖRNER Ricarda	2018-2021	Doctorante	Post-doctorante au Dana-Farber Cancer Institute (Boston, USA)
GIANDOREGGIO Karine	2017-2020	Assistante ingénieure	Assistante ingénieure à l'IBS
BAETA Tiago	2017-2020	Doctorant	Professeur à l'Escola Secundária de Pedro Nunes
HESSEL Audrey	2013-2018	Ingénieure	Ingénieure de recherche à l'Institut Pasteur (Paris, FR)
HOSEK Tomas	2015-2018	Doctorant	Scientifique II DSPD chez KBI Biopharma (Saint-Julien-en-Genevois, FR)
COLAS DEBLED Elisa	2015-2018	Doctorante	Ingénieure chez Elicityl (Crolles, FR)
WEINHÄUPL Katharina	2014-2018	Doctorante
FRAGA Hugo	2016-2018 & 2014-2015	Post-doctorant	Chercheur à l'école de médecine de Harvard (Boston, USA)
GAUTO Diego	2015-2018	Post-doctorant	Chercheur au CNRS (Gif-sur-Yvette, FR)
MAYA-MARTINEZ Roberto	2015-2017		Scientifique chez Peak Proteins (Macclesfield, UK)
JEAN Nicolas	2012-2015	Doctorant	Scientifique chez Evotec (Abingdon, UK)
CRUBLET Elodie	2011-2015	Doctorante	PDG de NMR-Bio (Grenoble, FR)
KERFAH Rime	2010-2014	Doctorante	Chercheuse chez NMR-Bio (Grenoble, FR)
MACEK Pavel	2011-2014	Post-doctorant	Chercheur chez KBI Biopharma (Genève, CH)
PEGEOT Mathieu	2010-2014	Doctorant
MA Peixiang	2011-2014	Post-doctorant	Chercheur à l'université ShanghaiTech (Shanghai, CN)
RENNELLA Enrico	2011-2014	Post-doctorant	Post-doctorant à l'université de Toronto (Toronto, CA)
PLEVIN Michael	2008-2012	Post-Doc	Chercheur à l'université de York (York, UK)
QUINTERO Maria-Rosa	2009-2011	Post-Doc	Service Culturel, Mairie de Voiron (Voiron, FR)
PESSEY Ombeline	2008-2011	Technicienne	Technicienne de recherche au CEA (Saclay, FR)
GANSMULLER Axel	2009-2011	Post-doctorant	Maître de conférences / chercheur à l'Université de Lorraine
AMERO Carlos	2008-2010	Post-doctorant	Chercheur à l'Universidad Autónoma del Estado de Morelos
KERN Thomas	2006-2009	Doctorant	Responsable de flux chez Roche (Bâle, CH)
FARJON Jonathan	2008-2009	Post-doctorant	Chercheur CNRS à l'université de Nantes (Nantes, FR)
GIUSTINI Cécile	2006-2008	Technicienne	Technicienne au CEA (Grenoble, FR)
RASIA Rodolfo	2006-2008	Post-doctorant	Chercheur au CONICET, Institut de biologie de Rosario - Argentine
SOUNIER Rémy	2004-2008	Doctorant	Chercheur INSERM (Montpellier, FR)
BOUDET Julien	2004-2007	Doctorant	Chercheur à la CHDI Foundation (Princeton, USA)
LESCOP Ewen	2006-2007	Post-doctorant	Chercheur CNRS à l'ICSN (Gif-sur-Yvette, FR)
BLACKLEDGE Martin	1992-2007	Chercheur CEA	Chercheur CEA à l'IBS Grenoble
HOUBEN Klaartje	2004-2007	Post-doctorante	Chercheuse chez DSM-Firmenich (Delft, NL)
BLANCHARD Laurence	1998-2006	Chercheuse CNRS	Chercheuse CNRS à Cadarache (FR)
DEVANY Matthew	2004-2006	Post-doctorant	Responsable de spectromètre - Center University of New York - USA
VAN MELCKEBEKE Hélène	2002-2006	Doctorante	Professeure de physique au lycée (Vienne, AT)
PECQUEUR Ludovic	2002-2005	Doctorant	Ingénieur au Collège de France (Paris, FR)
FENG Jianghua	2003	Post-doctorant	Institut de physique et de mathématiques de Wuhan, Chine
SIBILE Nathalie	2000-2003	Doctorante	Chercheuse CNRS à Montpellier
BERAUD Sabine	1998-2002	Doctorante
DEPREZ Christophe	1998-2001	Doctorant	Ingénieur au Conseil national de recherches Canada (CA)
DOSSET Patrice	1994-2001	Ingénieur CNRS	Ingénieur CNRS au CBM (Montpellier)
HUS Jean-Christophe	1997-2000	Doctorant	Post-doctorant, école de médecine de Harvard, Boston (USA)
VANBELLE Christophe	1996-2000	Doctorant	Ingénieur de recherche INSERM à Lyon
GUILLAUDIS Laure	1996-1999	Doctorante	Maître de conférences à l'université de Rouen
TSAN Pascale	1995-1998	Doctorante	Maître de conférences à l'université de Nancy (Nancy, FR)
CORDIER Florence	1995-1998	Doctorante	Chercheuse CNRS à l'Institut Pasteur (Paris)
MUHLE-GOLL Claudia	1996-1998	Post-doctorante	Chercheuse à l'université de Karlsruhe, Allemagne
DÉMÈNE Hélène	1996-1998	Post-doctorante	Chercheuse CNRS au CBS Montpellier
ALBRAND Jean-Pierre	1991-1998	Chercheur CNRS	Décédé
MITTARD Virginie	1993-1996	Doctorante	Coordinatrice de projet UE à l'université de Bielefeld, Allemagne
LANCELIN Jean-Marc	1991-1995	Chercheur CNRS	Professeur à l'université de Lyon
MORELLE Nathalie	1992-1995	Doctorante	Coordinatrice Via Alpina International
BRUN Emmanuel	1992-1995	Doctorant	NMRtec, Illkirch-Graffenstaden, France
CAFFREY Michael	1991-1995	Post-doctorant	Professeur à l'université de Chicago
PONCIN Marc	1991-1994	Ingénieur CNRS	Personnel - Médecins sans Frontières
FORAY Marie-Françoise	1991-1994	Ingénieure CEA	Retraitée