Membres du groupe

GABEL Frank — 2022-11-30T14:06:30Z

Sommaire

Equipe Franzetti

Personnel permanent :

Bruno Franzetti (CNRS - DR1, chef de groupe, chef d'équipe)
Dominique Madern (CNRS - IR HC)
Eric Girard (CEA - DR)
Mylène Ferruit (CEA - Technicienne supérieure)
Giuseppe Zaccaï (CNRS - DR1 émérite)
Frank Gabel (CEA - DR)

Personnel non-permanent :

Cécile Cadoux (Postdoc)
Charlotte Raybaud (Ingénieure)

Etudiants en thèse :

Anna Bonnardel
Federico Musso
Joaquín Atalah

Equipe Wagner

Personnel permanent :

Tristan Wagner (CEA - chercheur, chef d'équipe)
Olivier Lemaire (CNRS - CR/CN)

Personnel non-permanent :

Mélissa Belhamri (Ingénieure)
André Grangeia Gouveia (Postdoc)

Alumni

Sandrine Coquille (Postdoc 2022-2025).
Viviam Moura da Silva (Postdoc 2022-2025).
Zaynab Alsalman (PhD 2018-2023) : ALPX (Grenoble, France).
Jacques Covès (CNRS DR2 2016-2022) : Retraité, auteur (Grenoble & Sète, France).
Laura Mariño Puertas (Postdoc 2020-2022) : IBMB (Barcelona, Espagne).
Adeline Robin (Postdoc 2020-2021) : Ad lijn upcycling
Lorenzo Carré (PhD 2018-2021) : Inrae (France).
Quentin Bertrand (Postdoc 2019-2020) : PSI (Villigen, Suisse).
Alexandra Crété (CNRS technician 2017-2019) : ExcellGene (Valois, Suisse).
Jennifer Roche (Postdoc 2017-2019) : Pattes de chat (Marseille, France).
Emilie Mahieu (PhD 2016-2019) : AstraZeneca (Munich, Allemagne).
Gaëlle Hogrel (Postdoc 2016-2018) : Perha Pharma (Roscoff, France).
Pierre Vauclare (CNRS 2011-2018) : IBS I2SR.
Sylvain Engilberge (PhD 2013-2017) : IBS Groupe Synchrotron.
Ziad Ibrahim (PhD 2012-2016) : Panne groupe (Leicester, Royaume-Uni).
Fred Vellieux (CEA CR 2011-2016).
Henry Kim (Postdoc 2012-2015) : Novalix (Strasbourg, France).
Hind Basbous (PhD 2012-2016) : CNRS (Grenoble, France).
Matteo Colombo (Postdoc 2013-2015) : ESRF (Grenoble, France).
Louise Lassalle (PhD 2011-2014) : Université Paris Diderot (Paris, France).
Alexandre Appolaire (PhD 2010-2014) : DEEP BLUE (Grenoble, France).
Romain Talon (PhD 2009-2012) : ESRF (Grenoble, France).
Richard Kahn (CNRS DR2 2011-2012).
Elisa Fabiani (ATER 2010-2011) : IPSA Ecole d'ingénerie (Toulouse, France).
Eva Rosenbaum (PhD 2005-2008, Postdoc 2009-2011) : 3con-consultants (Bonn, Allemagne).
Vincent Marty (PhD 2008-2011) : Lycée Simone Weil (Le-Puy-en-Velay, France).
Maria Asunción Durá (Postdoc 2003-2005, 2007-2010) : (Valencia, Espagne).

Présentation générale du groupe

GABEL Frank — 2022-11-30T10:04:53Z

Sommaire

Responsable de groupe : Bruno Franzetti

ACTIVITES DE RECHERCHE

Le groupe ELMA cherche à comprendre comment les microbes présents dans les environnements les plus extrêmes ont développé des métabolismes uniques à la limite thermodynamique de la vie et comment ils parviennent à maintenir un protéome sain dans des conditions de température, de pression ou de salinité élevées. Cette recherche repousse les limites de notre compréhension de la résilience des organismes vivants, en termes de sources d'énergie, de stabilité des biomolécules, d'évolution moléculaire et même de nouvelles machineries cellulaires.

Nos travaux portent principalement sur les systèmes biologiques dérivés des archées. Ces organismes procaryotes diffèrent des bactéries. Ils représentent une part importante du microbiote terrestre, jouent des rôles cruciaux dans les cycles géochimiques et restent la partie la plus inexplorée du monde vivant. Ils ont développé une plasticité métabolique qui leur permet de prospérer dans les environnements les plus hostiles.

En plus d'explorer l'adaptabilité, les processus cellulaires et les métabolismes uniques des archées, nos recherches offrent un cadre rationnel pour mieux comprendre les origines de la vie et orienter la recherche de la Vie dans l'Univers. Nos activités de recherche fondamentale axées sur les extrêmophiles visent également à proposer des solutions innovantes pour l'industrie comme des sources d'énergie alternatives, des biocatalyseurs robustes pour une industrie plus propre et des hydrolysats protéiques pour les secteurs de la nutrition, de la santé et de la cosmétique.

L'activité de recherche du groupe ELMA se structure autour de deux axes principaux :

Limites Moléculaires de la Vie
Nous cherchons à identifier, par une approche à l'échelle du protéome, les mécanismes moléculaires spécifiquement associés au maintien de l'intégrité et de l'activité des protéines dans des conditions extrêmes de température, de pression et de salinité. Le second projet sur l'adaptation cellulaire à l'environnement se concentre sur la régulation du protéasome des archées hyperthermophiles/des profondeurs et sur son rôle dans la réponse au stress. Ces connaissances sont utilisées pour développer des biotechnologies innovantes pour le secteur agroalimentaire, en particulier par la recherche et l'ingénierie de nouvelles peptidases extrêmophiles provenant d'environnements marins.

Métabolisme Microbien (Équipe ERC de T. Wagner)
Notre objectif est de dévoiler les voies cataboliques et assimilatrices des chimio-autotrophes anaérobies. Notre recherche se concentre principalement sur les microbes prospérant à la limite thermodynamique, tels que les méthanogènes, les acétogènes et les alcanotrophes. Nous nous appuyons sur une approche native intégrative combinant la physiologie microbienne, l'enzymologie, la biochimie et la biologie structurale, le plus souvent dans des conditions anaérobies afin de protéger les centres métalliques sensibles.

METHODES SPECIFIQUES

Pour relever ces défis passionnants, le groupe ELMA dispose d'équipements spécifiques pour les études enzymatiques, biophysiques et structurales dans des conditions extrêmes de température, de pression et d'anoxie. Nous possédons également des compétences pointues en microbiologie, biochimie et biologie structurale : purification de complexes natifs et méthodes avancées de cristallographie aux rayons X, en complément des approches par cryo-microscopie électronique (cryo-EM). Nous avons aussi un fort intérêt pour les approches natives permettant d'identifier les complexes supramoléculaires impliqués dans l'adaptation extrêmophile et le métabolisme des Archées, via l'interactomique cellulaire, la purification de complexes natifs, la protéomique et la biophysique appliquées aux protéomes archaeens.

MOTS CLES

Extrêmophiles, Archées, Adaptation environnementale, Évolution moléculaire, Exobiologie, Profondeurs marines, Halophiles, Thermophiles, Psychrophiles, Piézophiles, Protéasomes, Chaperonnes, Peptidases, TET, Malate déshydrogénase, Allostérie, Enzymes industrielles, Méthanogènes, Méthanotrophes anaérobiques, Cycle du carbone, Fixation N2, Mécanisme catalytique, Métabolisme.

IBS - Institut de Biologie Structurale - Grenoble / France

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ACTIVITES DE RECHERCHE

METHODES SPECIFIQUES

MOTS CLES

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