Présentation

WEIK Martin — 2011-01-07T08:26:17Z

Sommaire

Responsable : Martin Weik

Les protéines sont les moteurs moléculaires de la vie. La diversité de leurs fonctions biologiques est bien reflétée par la grande variabilité de leurs caractéristiques structurales et dynamiques. Alors que notre connaissance de la structure des protéines n'a cessé de croître ces dernières décennies, notre compréhension de leur dynamique est beaucoup plus restreinte. Pourtant, seule la compréhension croisée de la « dynamique structurale », c'est-à-dire de l'interrelation entre structure et dynamique, nous permettra de comprendre la diversité des fonctions biologiques des macromolécules au sein de la cellule.

Dans le groupe DYNAMOP, deux équipes développent une large palette de méthodes expérimentales et computationnelles afin de mieux comprendre la relation structure-fonction des macromolécules biologiques, en introduisant une dimension dynamique, à la fois in vitro et dans le contexte cellulaire.

Deux équipes de recherche

– Equipe Dynamique structurale des protéines ; Chef d'équipe : Martin Weik
– Equipe SNAX ; chef d'équipe : Jacques-Philippe Colletier

Sujets de recherche

– Photophysique des protéines fluorescentes ; Dynamique des protéines photoactives
– Cristallographie ultrarésolue en temps des protéines fluorescentes par lasers X à électrons libres (XFEL).
– Modélisation de la structure et de la fonction des protéines ; Développement d'algorithme de simulation ; Simulations des mécanismes de réactions enzymatiques
– Influence de l'hydratation sur la dynamique de protéines
– Dynamique structurale de protéines d'intérêt médical solubles, membranaires ou intrinsèquement désordonnées : acétylcholinestérase, tau, porines

Mots-clés

Dynamique des protéines ; protéines fluorescentes ; photoactivation et photoblanchiment ; microspectrophotométrie ; cristallographie cinétique ; photophysique ; modélisation moléculaire ; simulations moléculaires ; mécanisme de réactions enzymatiques ; diffusion des neutrons ; acétylcholinestérase ; dynamique structurale des protéines ; maladies neurodégénératives ; protéine Tau ; médicaments anti Alzheimer ; réactivateurs des cholinestérase ; porines ; résistance aux antibiotiques ;

Techniques

– Cristallographie aux rayons X
– Cristallographie cinétique
– Lasers X à électrons libres (XFEL)
– Microspectrophotométrie
– Diffusion incohérente des neutrons
– Etudes haute pression
– Modélisation moléculaire
– Dynamique moléculaire
– Chimie quantique
– Biologie moléculaire et cellulaire : Fluorescent protein fusion constructs

Publications

La liste des publications du groupe est disponible ici.