https://www.ibs.fr/ L'Institut de Biologie Structurale a pour mission le développement de recherches en biologie structurale, comportant l'étude structurale et fonctionnelle des macromolécules biologiques, notamment des protéines. fr SPIP - www.spip.net https://www.ibs.fr/local/cache-vignettes/L144xH79/logoibs_quadri_filaire_cs3-2-54caf.svg?1688392249 https://www.ibs.fr/ 79 144 https://www.ibs.fr/fr/recherche/assemblage-dynamique-et-reactivite/groupe-microscopie-electronique-et-methodes-g-schoehn/equipe-schoehn/methodologie/tomography-cryo-fib-sem-fr/membres https://www.ibs.fr/fr/recherche/assemblage-dynamique-et-reactivite/groupe-microscopie-electronique-et-methodes-g-schoehn/equipe-schoehn/methodologie/tomography-cryo-fib-sem-fr/membres 2022-11-21T15:23:02Z text/html fr NEUMANN Emmanuelle <p>Membres de l'équipe impliqués : Elda Bauda, Alessio D'acapito, Leandro Estrozi, Benoit Gallet, Christine Moriscot, Emmanuelle Neumann</p> - <a href="https://www.ibs.fr/fr/recherche/assemblage-dynamique-et-reactivite/groupe-microscopie-electronique-et-methodes-g-schoehn/equipe-schoehn/methodologie/tomography-cryo-fib-sem-fr/" rel="directory">Tomographie / Cryo-FIB SEM</a> <img src='https://www.ibs.fr/local/cache-vignettes/L150xH147/tomo-team-49468.png?1688802051' class='spip_logo spip_logo_right' width='150' height='147' alt="" /> <div class='rss_texte'><p><strong>Membres de l'équipe impliqués</strong> : Elda Bauda, Alessio D'acapito, Leandro Estrozi, Benoit Gallet, Christine Moriscot, Emmanuelle Neumann</p></div> https://www.ibs.fr/fr/recherche/assemblage-dynamique-et-reactivite/groupe-microscopie-electronique-et-methodes-g-schoehn/equipe-schoehn/methodologie/tomography-cryo-fib-sem-fr/echantillons-biologiques https://www.ibs.fr/fr/recherche/assemblage-dynamique-et-reactivite/groupe-microscopie-electronique-et-methodes-g-schoehn/equipe-schoehn/methodologie/tomography-cryo-fib-sem-fr/echantillons-biologiques 2022-11-10T15:51:29Z text/html fr NEUMANN Emmanuelle <p>Plusieurs objets biologiques sont actuellement étudiés au sein de l'équipe par cryo-tomographie électronique et par cryo-FIB SEM. <br class='autobr' /> Bactériophage T5 /Protéo-liposome + FhuA <br class='autobr' /> L'infection d'E. coli par le bactériophage T5 est initiée par la liaison irréversible à son récepteur bactérien, le transporteur de la membrane externe FhuA. Cette interaction déclenche l'ouverture de la capside, la perforation de la paroi bactérienne et l'injection de l'ADN vers le cytoplasme de l'hôte. Lorsque cette (…)</p> - <a href="https://www.ibs.fr/fr/recherche/assemblage-dynamique-et-reactivite/groupe-microscopie-electronique-et-methodes-g-schoehn/equipe-schoehn/methodologie/tomography-cryo-fib-sem-fr/" rel="directory">Tomographie / Cryo-FIB SEM</a> <img src='https://www.ibs.fr/local/cache-vignettes/L150xH143/bb8-phaget5-49ee6.png?1688802051' class='spip_logo spip_logo_right' width='150' height='143' alt="" /> <div class='rss_texte'><p>Plusieurs objets biologiques sont actuellement étudiés au sein de l'équipe par cryo-tomographie électronique et par cryo-FIB SEM.</p> <p><strong>Bactériophage T5 /Protéo-liposome + FhuA</strong></p> <div class='spip_document_6377 spip_document spip_documents spip_document_image spip_documents_right spip_document_right spip_document_avec_legende' data-legende-len="79" data-legende-lenx="xx" > <figure class="spip_doc_inner"> <img src='https://www.ibs.fr/local/cache-vignettes/L500xH475/bb8-phaget5-3f200.png?1688802051' width='500' height='475' alt='' /> <figcaption class='spip_doc_legende'> <div class='spip_doc_titre crayon document-titre-6377 '><strong>Bacteriophage T5 / Protéo-liposome + FhuA </strong></div> <div class='spip_doc_descriptif crayon document-descriptif-6377 '>Collaboration C. Breyton </div> <div class='spip_doc_credits crayon document-credits-6377 '>E. Neumann </div> </figcaption></figure> </div> <p>L'infection d'E. coli par le bactériophage T5 est initiée par la liaison irréversible à son récepteur bactérien, le transporteur de la membrane externe <strong>FhuA</strong>. Cette interaction déclenche l'ouverture de la capside, la perforation de la paroi bactérienne et l'injection de l'ADN vers le cytoplasme de l'hôte. Lorsque cette interaction a lieu in vitro (lorsque FhuA est reconstitué en liposomes par exemple) tout l'ADN du phage est éjecté. <br class='autobr' /> Initialement des séries tiltées de FhuA-Liposomes + T5 ont été collectées sur le cryo-microscope GLACIOS (Thermo Scientific) de l'IBS. <br class='autobr' /> Par la suite, une nouvelle collecte a été réalisée au cryo-microscope Titan Krios G3 (EMBL Heidelberg, Allemagne) permettant la reconstruction de plus de 100 tomogrammes dans lesquels plusieurs sous-volumes correspondant à la perforation du liposome par T5 peuvent être extraits.</p> <p><strong>Extraits d'un tomogramme</strong> :</p> <ul class="spip_documents_ligne"> <li class="spip_documents_ligne__doc" style="flex: 1.0033"> <div class="spip_document_6379 spip_document spip_documents spip_document_image spip_documents_center spip_document_center spip_lien_ok"> <figure class="spip_doc_inner"> <a href='https://www.ibs.fr/IMG/png/101.png' class="spip_doc_lien mediabox" type="image/png"> <img src='https://www.ibs.fr/local/cache-vignettes/L500xH498/101-d9526.png?1688802051' width='500' height='498' alt='' /></a> </figure> </div> </li> <li class="spip_documents_ligne__doc" style="flex: 1.0054"> <div class="spip_document_6380 spip_document spip_documents spip_document_image spip_documents_center spip_document_center spip_lien_ok"> <figure class="spip_doc_inner"> <a href='https://www.ibs.fr/IMG/png/102.png' class="spip_doc_lien mediabox" type="image/png"> <img src='https://www.ibs.fr/local/cache-vignettes/L500xH497/102-e30c6.png?1688802052' width='500' height='497' alt='' /></a> </figure> </div> </li> <li class="spip_documents_ligne__doc" style="flex: 1.0065"> <div class="spip_document_6381 spip_document spip_documents spip_document_image spip_documents_center spip_document_center spip_lien_ok"> <figure class="spip_doc_inner"> <a href='https://www.ibs.fr/IMG/png/103.png' class="spip_doc_lien mediabox" type="image/png"> <img src='https://www.ibs.fr/local/cache-vignettes/L500xH497/103-d91bd.png?1688802052' width='500' height='497' alt='' /></a> </figure> </div> </li> <li class="spip_documents_ligne__doc" style="flex: 1.0076"> <div class="spip_document_6382 spip_document spip_documents spip_document_image spip_documents_center spip_document_center spip_lien_ok"> <figure class="spip_doc_inner"> <a href='https://www.ibs.fr/IMG/png/104.png' class="spip_doc_lien mediabox" type="image/png"> <img src='https://www.ibs.fr/local/cache-vignettes/L500xH496/104-c7d66.png?1688802052' width='500' height='496' alt='' /></a> </figure> </div> </li> <li class="spip_documents_ligne__doc" style="flex: 1.0044"> <div class="spip_document_6383 spip_document spip_documents spip_document_image spip_documents_center spip_document_center spip_lien_ok"> <figure class="spip_doc_inner"> <a href='https://www.ibs.fr/IMG/png/105.png' class="spip_doc_lien mediabox" type="image/png"> <img src='https://www.ibs.fr/local/cache-vignettes/L500xH498/105-7b0fa.png?1688802052' width='500' height='498' alt='' /></a> </figure> </div> </li> </ul> <p></br ></p> <ul class="spip_documents_ligne"> <li class="spip_documents_ligne__doc" style="flex: 1.0033"> <div class="spip_document_6384 spip_document spip_documents spip_document_image spip_documents_center spip_document_center spip_lien_ok"> <figure class="spip_doc_inner"> <a href='https://www.ibs.fr/IMG/png/106.png' class="spip_doc_lien mediabox" type="image/png"> <img src='https://www.ibs.fr/local/cache-vignettes/L500xH498/106-6dcac.png?1688802053' width='500' height='498' alt='' /></a> </figure> </div> </li> <li class="spip_documents_ligne__doc" style="flex: 1.0033"> <div class="spip_document_6385 spip_document spip_documents spip_document_image spip_documents_center spip_document_center spip_lien_ok"> <figure class="spip_doc_inner"> <a href='https://www.ibs.fr/IMG/png/107.png' class="spip_doc_lien mediabox" type="image/png"> <img src='https://www.ibs.fr/local/cache-vignettes/L500xH498/107-011f2.png?1688802053' width='500' height='498' alt='' /></a> </figure> </div> </li> <li class="spip_documents_ligne__doc" style="flex: 1.0011"> <div class="spip_document_6386 spip_document spip_documents spip_document_image spip_documents_center spip_document_center spip_lien_ok"> <figure class="spip_doc_inner"> <a href='https://www.ibs.fr/IMG/png/108.png' class="spip_doc_lien mediabox" type="image/png"> <img src='https://www.ibs.fr/local/cache-vignettes/L500xH499/108-970a3.png?1688802053' width='500' height='499' alt='' /></a> </figure> </div> </li> <li class="spip_documents_ligne__doc" style="flex: 1.0022"> <div class="spip_document_6387 spip_document spip_documents spip_document_image spip_documents_center spip_document_center spip_lien_ok"> <figure class="spip_doc_inner"> <a href='https://www.ibs.fr/IMG/png/109.png' class="spip_doc_lien mediabox" type="image/png"> <img src='https://www.ibs.fr/local/cache-vignettes/L500xH499/109-50088.png?1688802053' width='500' height='499' alt='' /></a> </figure> </div> </li> <li class="spip_documents_ligne__doc" style="flex: 1.0022"> <div class="spip_document_6388 spip_document spip_documents spip_document_image spip_documents_center spip_document_center spip_lien_ok"> <figure class="spip_doc_inner"> <a href='https://www.ibs.fr/IMG/png/110.png' class="spip_doc_lien mediabox" type="image/png"> <img src='https://www.ibs.fr/local/cache-vignettes/L500xH499/110-0f3b3.png?1688802054' width='500' height='499' alt='' /></a> </figure> </div> </li> </ul> <p><strong>Plusieurs logiciels de reconstruction sont utilisés</strong> :<br class='autobr' /> ETomo, EMAN2, Warp/M, AreTomo</p> <p><strong>Pour le "sub-tomogram averaging", plusieurs logiciels sont en cours de test</strong> :<br class='autobr' /> PEET, EMAN2, RELION 4</p></div>