IBS - Institut de Biologie Structurale - Grenoble / France

Marjolaine Noirclerc-Savoye

CARON Pierre — 2025-09-12T09:05:55Z

Marjolaine Noirclerc-Savoye, Ph.D. - HDR
Directeur de recherche (E5) CEA
Tel : +33 (0)4 57 42 86 38
Email : marjolaine.noirclerc[at]ibs.fr

Je suis chercheuse au CEA et j'ai intégré l'équipe de Joanna Timmins en novembre 2024. Mes travaux s'inscrivent dans le champ de la biologie structurale intégrative et visent à élucider des mécanismes fondamentaux. Je mène actuellement deux projets centrés sur l'identification et la caractérisation du rôle régulateur de la protéine humaine Nucléophosmine 1 (NPM1) dans :
(i) la réparation de l'ADN par excision de base (BER), et
(ii) la réplication du VIH-1.
Pour répondre à ces questions, j'utilise un ensemble d'approches complémentaires – biochimiques, biophysiques, structurales et cellulaires – afin d'analyser des complexes protéiques clés, dont les interfaces pourraient constituer de nouvelles cibles thérapeutiques.

Durant mon parcours professionnel j'ai fait le choix d'évoluer dans des domaines et des thématiques très différents, allant scientifiquement du gène à la structure de la protéine. Ce parcours atypique a été pour moi extrêmement enrichissant, me permettant de travailler sur des sujets différents et d'avoir une vision élargie et complémentaire de ce qu'il est possible de faire de manière pluridisciplinaire en recherche fondamentale en biologie.

Loïc Grandvuillemin

CARON Pierre — 2025-09-12T08:27:17Z

Loïc Grandvuillemin
Ingénieur étude CEA
Tel : +33 (0)4 57 42 85 75
Email : Loic.Grandvuillemin[at]ibs.fr

Je suis ingénieur au CEA en CDD de 24 mois. Je suis arrivé dans l'équipe de Joanna Timmins le 1er septembre 2025. Lors de mes précédents contrats j'ai travaillé sur la fonction pionnière de la protéine LFY, ainsi que sur la conservation de l'interaction entre les protéines LFY et UFO et l'ADN au cours de l'évolution, au LPCV avec François Parcy. J'ai également travaillé sur la détermination de la structure du complexe AHR avec différents ligands au CBS avec Jakub Gruszczyk. Actuellement je travaille sur les interactions entre la protéine humaine Nucléophosmine 1 (NPM1) et la protéine du VIH-1 REV.

Elise Pouponnot

CARON Pierre — 2025-09-12T07:29:56Z

Elise Pouponnot
PhD student

Je m'appelle Élise Pouponnot et je suis doctorante dans l'équipe GenOM (groupe I2SR) à l'Institut de Biologie Structurale (IBS) de Grenoble. Ma thèse porte sur la réparation des dommages de l'ADN par la voie BER (Base Excision Repair). Mon objectif est de mieux comprendre les interactions entre les protéines impliquées dans cette voie et d'identifier de potentiels régulateurs, le tout dans un contexte cellulaire dynamique.
Pour cela, j'utilise des modèles cellulaires qui me permettent (i) de réaliser des pulldowns suivis d'analyses par spectrométrie de masse afin d'identifier les interactants et les modifications post-traductionnelles des protéines d'intérêt, et (ii) de caractériser leur localisation cellulaire par microscopie confocale et super-résolutive.
Ces approches visent à identifier de nouveaux facteurs de la voie BER et à mettre en évidence des mécanismes de régulation d'enzymes clés de cette voie.

Depuis le collège, je suis passionnée par la génétique et l'ADN, avec le désir constant d'en apprendre davantage sur les sciences de la vie. Pour parvenir jusqu'au doctorat à l'IBS, j'ai suivi une licence Sciences de la Vie et de la Terre à l'Université de Limoges, parcours Biochimie, Biologie Moléculaire et Cellulaire, et Génétique, puis un master Biologie-Santé, parcours Génomique et Biotechnologies, également à Limoges.
Ce parcours me permet aujourd'hui de me spécialiser en biologie cellulaire et structurale afin de mieux comprendre les mécanismes complexes de l'oncogénétique.

Jason Vanstaevel

VAUCLARE Pierre — 2025-09-08T12:20:14Z

Je suis doctorant dans l'équipe GenOM et travaillant sur la voie de réparation de l'ADN par excision de base. Pour ma thèse, j'étudie l'interaction entre APE1, une protéine de réparation de l'ADN et NPM1, la nucléophosmine 1, dans le but de comprendre ce mécanisme aidant à la préservation de l'intégrité du génome humain. Cependant, cette interaction est détournée par certains types de cancers afin de résister aux traitements anti-cancéreux et d'assurer leur prolifération. Lors de mon doctorat, j'ai pour objectif de décrire la structure du complexe formé lors de l'interaction entre APE1 et NPM1 en utilisant plusieurs techniques comme la microscopie électronique à température cryogénique (Cryo-EM) et la résonance magnétique nucléaire (RMN) mais aussi de réaliser la caractérisation biophysique de l'interaction.

Durant ma licence de biochimie, j'ai découvert la biologie structurale et j'ai cherché un master dans ce domaine où j'y ai développé un intérêt pour les protéines comme NPM1.

Harald Bernhard

VAUCLARE Pierre — 2024-09-05T07:18:49Z

Harald Bernhard
Post-doctorant, CNRS
Tél : +33 (0)4 57 42 87 37
Email : harald.bernhard@ibs.fr

Au cours de mes études en biologie moléculaire et biochimie à l'Université de Graz, j'ai développé un fort intérêt pour la biologie structurale, ce qui m'a amené à participer à plusieurs projets axés sur la cristallographie aux rayons X. Mon travail de doctorat (effectué à l'EMBL Grenoble) s'est appuyé sur cet intérêt, où j'ai utilisé la cryo-EM à particule unique combinée à des méthodes biochimiques pour caractériser les protéines du parasite Trypanosoma brucei.
À l'IBS, j'utilise actuellement la cryo-EM à particule unique et la tomographie cryo-électronique pour étudier l'organisation du nucléoïde et la division cellulaire chez Deinococcus radiodurans. Les bactéries sont fréquemment soumises à des stress environnementaux tels que le rayonnement UV, les fluctuations de température et les changements de pH, ce qui nécessite des mécanismes de réponse rapides et adaptatifs pour survivre. L'une des stratégies les plus efficaces consiste à réorganiser l'ensemble du génome, où les protéines associées aux nucléoïdes (NAP), régulières et induites par le stress, jouent un rôle essentiel dans l'organisation et l'empaquetage de l'ADN génomique. Nous utilisons Deinococcus radiodurans comme organisme modèle et explorons sa remarquable résistance aux radiations ionisantes et étudions sa réponse cellulaire au stress.

Pierre Caron

VAUCLARE Pierre — 2024-09-05T07:12:40Z

Pierre Caron
Chercheur CNRS, CRCN
Tel : +33 (0)4 57 42 85 66
email : pierre.caron@ibs.fr

Mes recherches portent sur l'étude des mécanismes de réparation de l'ADN en réponse à des agents génotoxiques et à des molécules thérapeutiques anticancéreuses. Au cours de mon doctorat et de mes travaux post-doctoraux, j'ai utilisé des modèles cellulaires innovants combinés à un large éventail de techniques pour induire des dommages à l'ADN. J'ai pu ainsi décrypter des mécanismes clés impliqués dans la maintenance de la chromatine et dans la régulation des événements de réparation de l'ADN dans le contexte de la chromatine.
En 2024, j'ai rejoint le laboratoire de Joanna Timmins à l'Institut de biologie structurale (IBS) pour continuer à explorer la réparation de l'ADN au sein de l'espace nucléaire. Grâce à l'expertise du laboratoire et à l'environnement unique offert par l'IBS et le campus de l'IRIG, je développe et utilise des approches avancées en protéomique et en microscopie pour caractériser et cartographier les mécanismes de réparation de l'ADN dans différentes régions du génome en réponse à divers agents génotoxiques et composés anticancéreux. Ce travail permettra de mieux comprendre les mécanismes qui régulent la stabilité de notre génome ; et, nous l'espérons, d'identifier de nouvelles cibles thérapeutiques anticancéreuses et de développer une médecine personnalisée en aidant à prédire la réponse des patients aux thérapies en fonction de leurs caractéristiques génétiques.

Ahmad Hammoud

HANS Fabienne — 2022-12-06T14:05:11Z

Ahmad.Hammoud[at]ibs.fr

En tant que doctorant, je fais partie de l'équipe GenOM du groupe I2SR depuis la fin de l'année 2022. Mon projet de thèse porte sur la réparation de l'ADN et l'oncologie et il vise à étudier le rôle de la protéine YBX-1 sur la réparation par excision de base (BER), dans le contexte de cancer chimiorésistant. Nous souhaitons déterminer si YBX1 pourrait être considérée comme un biomarqueur universel de diagnostic et de pronostic du cancer. Cette étude est menée sous la supervision de Fabienne Hans, et en collaboration avec certains membres de l'équipe, comme Joanna Timmins, la responsable de l'équipe, et Mrinalini Lianne RAO, ma partenaire doctorante, ainsi qu'avec d'autres laboratoires en France. Des techniques de bio-informatique et de biologie moléculaire et cellulaire, comme le Western Blot, la RTqPCR, l'immunofluorescence et le High Content Screening, sont utilisées pour atteindre les objectifs du projet.

Mrinalini Lianne Rao

HANS Fabienne — 2022-12-06T14:01:37Z

mrinalini.rao[at]ibs.fr

Bonjour ! Je m'appelle Mrinalini Lianne Rao, doctorante de l'équipe GenOM, groupe I2SR, à l'Institut de Structurale Biologie. Ma thèse de doctorat porte sur la compréhension de la dynamique cellulaire de l'ADN glycosylase humaine (NTH1) et son partenaire YB1 pendant la réparation de l'ADN dans les lignées cellulaires cancéreuses eucaryotes. Pour étudier une telle dynamique, des techniques de microscopie à super-résolution seront utilisées, accompagnées d'une combinaison de méthodes de biologie moléculaire et structurelle.

Mon parcours universitaire comprend une licence en biotechnologie, biochimie et génétique, suivi d'un master en biologie moléculaire, génétique humaine et ingénierie de la biosanté. Ce parcours académique très riche en sciences de la vie m'a donné l'envie de me spécialiser dans les domaines de la biologie structurale afin de découvrir de nouveaux mécanismes moléculaires et cellulaires qui pourraient révolutionner le domaine de l'oncologie.

Salvatore De Bonis

HANS Fabienne — 2022-12-06T13:58:07Z

Salvatore De Bonis
Technicien de Laboratoire CEA
Email : salvatore.debonis[at]ibs.fr

Après avoir travaillé 20 ans sur différentes protéines du cytosquelette, notamment par des approches biochimiques, j'ai rejoint l'équipe GenOM en 2014.

Je purifie et effectue des caractérisations biochimiques et biophysiques de différentes protéines impliquées dans les voies de réparation de l'ADN ou l'organisation de la chromatine chez D. radiodurans et chez l'homme.

Jean-Philippe Kleman

HANS Fabienne — 2022-12-06T13:53:59Z

Jean-Philippe Kleman, Ph.D. - HDR

Responsable de la plateforme M4D (imagerie cellulaire)
Directeur de recherche (E6) CEA
Tel : +33 (0)4 57 42 85 31
Email : jean-philippe.kleman[at]ibs.fr

Responsable de la plateforme d'imagerie cellulaire (M4D) de l'ISBG, j'ai rejoint le groupe I2SR lors de sa création, pour intégrer aux bénéfices de tous, les outils d'imagerie cellulaire et d'analyse aux thèmes de recherches développés au sein du groupe. Mon activité de recherche, initialement portée par l'étude des voies de signalisation lors de l'efferocytose (phagocytose des corps apoptotiques), se tourne depuis quelques années vers l'analyse de la dynamique des bactéries radiorésistantes Deinococcus radiodurans lors de la division cellulaire ou en réponse aux stress.