IBS - Institut de Biologie Structurale - Grenoble / France

Equipe Wild

2022-12-08T09:07:15Z

L'équipe Wild est hébergée par l'Institut de Biologie Structurale à Grenoble et fait partie du Groupe Structure et Activité des Glycosaminoglycanes (SAGAG).

L'équipe a un fort attrait pour la compréhension des glycosyltransférases et des enzymes de modification des glycans au niveau moléculaire. Un accent particulier est mis sur les enzymes de biosynthèse de l'héparane sulfate et du chondroitine sulfate, des polysaccharides complexes impliqués dans plusieurs fonctions biologiques importantes. Notre but est de déchiffrer l'architecture et le mécanisme catalytique de ces enzymes en combinant des approches de biologie structurale, en particulier la cryo-microscopie électronique avec des essais fonctionnels et biophysiques in vitro et des études in cellulo.

Biosynthèse de l'héparane sulfate
Les héparanes sulfate sont des polysaccharides linéaires extrêmement complexes retrouvés à la surface de toutes les cellules animales. La chaîne polysaccharidique est liée covalemment via un résidu de sérine au cœur protéique et médie les interactions avec d'autres facteurs cellulaires. Les héparanes sulfate sont impliqués dans un grand nombre de processus biologiques, notamment le développement cellulaire, le métabolisme lipidique, la réparation des tissus, l'inflammation, les réponses immunitaires et les interactions hôtes-pathogènes. Le dysfonctionnement de la biosynthèse de l'héparane sulfate a été associé à la maladie d'Alzheimer, aux inflammations aigues et chroniques, à la tumorigenèse et au diabète.

La biosynthèse de l'héparane sulfate prend place dans la lumière de l'appareil de Golgi et implique l'interaction finement régulée de plus d'une douzaine de glycosyltransférases et d'enzymes de modification des sucres ancrées à la membrane. Plusieurs études ont montré que la séquence des chaînes d'héparane sulfate est spécifique d'un type cellulaire et d'un tissu donné et qu'elle peut changer au cours du développement embryonnaire, des maladies et du vieillissement. Leurs mécanismes de régulation restent quant à eux mal connus. Certaines enzymes de la voie de biosynthèse de l'héparane sulfate ont été montrées comme interagissant les unes avec les autres et il a été proposé qu'elles puissent s'assembler dans un large complexe nommé ‘GAGosome' et dont la composition définirait la séquence polysaccharidique générée.

Aperçu de la biosynthèse de l'héparane sulfate. (A) Représentation schématique d'un protéoglycane porteur de chaîne d'héparane sulfate avec les enzymes impliquées dans la polymérisation et de modification de la chaîne indiquées sur le côté. (B) Le modèle du GAGosome décrit la formation hypothétique d'un complexe d'enzymes impliquées dans la biosynthèse de l'héparane sulfate.

La cryo-microscopie électronique apporte des informations moléculaires sur le mécanisme des glycosyltransférases.
La cryo-microscopie électronique à particule unique est la méthode de pointe pour déterminer la structure de protéines membranaires et de larges complexes. Nous avons récemment résolu la structure du complexe humain EXT1-EXT2, qui est responsable d'une étape clé dans la biosynthèse de l'héparane sulfate : la polymérisation du long squelette glycanique. Dans une étude précédente, nous avons déterminé la structure de l'oligosaccharyltansférase de la levure, un complexe enzymatique central dans la N-glycosylation des protéines qui catalyse le transfert d'un précurseur glycanique depuis un porteur lipidique vers les substrats protéiques.

Détermination structurale par cryo-microscopie électronique du complexe de la polymérase humaine et de l'oligosaccharyltansférase de la levure. Micrographie représentative de cryo-microscopie électronique (A) et classes 2D sélectionnées (B). (C) Reconstruction 3D et structure du complexe EXT1-EXT2. Source : Leisico et al., Nature communications 2022. (D) Structure obtenue par cryo-microscopie électronique de l'oligosaccharyltansférase de la levure. Source : Wild et al., Science 2018.

Si vous désirez en savoir plus sur les activités de l'équipe Wild, jetez un coup d'œil à ces vidéos YouTube :

L'établissement hôte possède une excellente infrastructure pour la poursuite de projets de biologie structurale complexes, incluant une plateforme ME qui offre un accès direct à un micoscope Glacios équipé d'une caméra K2. De plus, nous avons accès aux microscopes Titan Krios CM01 et CM02 de l'ESRF, localisé sur le même campus.

Si vous voulez rejoindre l'équipe pour un stage, une thèse ou un postdoctorat, écrivez à l'adresse suivante : Rebekka Wild.

Membres d'équipe :

Wild Team October 2025

Les membres actuels de l'équipe, de gauche à droite, au front : Rosa Lorizolla Cordeiro (postdoctorante), Thomas Passel (ingénieur d'étude), Sarah LeHir (ingénieure de recherche), Anthony Usclat (ingénieur d'étude). À l'arrière : Margot Weber (étudiante en thèse), Rebekka Wild (responsable d'équipe), Margaux Molinas (postdoctorante) et Clémentine Bouchikri (étudiante en thèse).

Anciens membres de l'équipe :
Rebecca-Joe Boustany (Étudiante en thèse)
Poushalee Dutta (Étudiante en thèse)
Marie Bourgeais (ingénieure d'étude)
Tristan Morvan (tudiant en Master, M1)
Tyee Gregg (tudiant en Master, M1)
Mélanie Friedel (Assistante d'ingénieur)
Francisco Leisico (postdoctorant)
Manal Hal Majed (Étudiante en Licence)
Farah Fouladkar (Étudiante en Licence et Master, L3 et M1)
Juneina Omeiri (Étudiante en Master, M2)
Borys Pedenko (Étudiant en Master, M1)

Sources de financement :

Publications récentes :

Dutta, P, Cordeiro, RL, Friedel-Arboleas, M, Bourgeais M, Vallet SD, Weber M, Molinas M, Shu H, Grønset MNN, Miller RL, Boeri Erba E, Wild R (2025). Structural basis for human chondroitin sulfate chain polymerization. Nature Communications. doi : 10.1038/s41467-025-66787-5.

Bourgeais M, Fouladkar F, Weber M, Boeri-Erba E, Wild R (2024). Chemo-enzymatic synthesis of tetrasaccharide linker peptides to study the divergent step in glycosaminoglycan biosynthesis. Glycobiology doi : 10.1093/glycob/cwae016.

Vallet SD, Annaval T, Vivès RR, Richard E, Hénault J, Le Narvor C, Bonnaffé D, Priem B, Wild R#, Lortat-Jacob H# (2023). Functional and structural insights into human N-deacetylase/N-sulfotransferase activities. Proteoglycan Research doi.org/10.1002/pgr2.8.

Leisico F*, Omeiri J*, Le Narvor C, Beaudouin J, Hons M, Fenel D, Schoehn G, Couté Y, Bonnaffé D, Sadir R, Lortat-Jacob H#, Wild R# (2022). Structure of the human heparan sulfate polymerase complex EXT1-EXT2. Nature Communications doi : 10.1038/s41467-022-34882-6.

Neuhaus JD*, Wild R*,#, Eyring J, Irobalieva RN, Kowal J, Lin C-W, Locher KP, Aebi M# (2021). Functional analysis of Ost3p and Ost6p containing yeast oligosaccharyltransferases. Glycobiology doi : 10.1093/glycob/cwab084.

Ried MK*, Wild R*, Zhu J, Pipercevic J, Sturm K, Broger L, Harmel RK, Abriata LA, Hothorn LA, Fiedler D, Hiller S, Hothorn M (2021). Inositol pyrophosphates promote the interaction of SPX domains with the coiled-coil motif of PHR transcription factors to regulate plant phosphate homeostasis. Nature communications doi : 10.1038/s41467-020-20681-4

Annaval T, Wild R, Crétinon Y, Sadir R, Vivès RR, Lortat-Jacob H (2020). Heparan Sulfate Proteoglycans Biosynthesis and Post Synthesis Mechanisms Combine Few Enzymes and Few Core Proteins to Generate Extensive Structural and Functional Diversity. Molecules doi : 10.3390/molecules25184215

Wild R*, Kowal J*, Eyring J*, Ngwa EM, Aebi M, Locher KP (2018). Structure of the yeast oligosaccharyltransferase complex gives insight into eukaryotic N-glycosylation. Science doi : 10.1126/science.aar5140

Wild R*, Gerasimaite R*, Jung JY*, Truffault V, Pavlovic I, Schmidt A, Saiardi A, Jessen HJ, Proirier Y, Hothorn M, Mayer A (2016). Control of eukaryotic phosphate homeostasis by inositol polyphosphate sensor domains. Science doi : 10.1126/science.aad9858

Wild R, Hothorn M (2016). The macro domain as fusion tag for carrier-driven crystallization. Protein Science doi:10.1002/pro.3073

Equipe Vivès

Vivès Romain, WILD Rebekka — 2022-11-25T10:54:21Z

Activité scientifique de l'équipe SAGAG-Vivès

Les héparanes sulfate (HS) sont des polysaccharides sulfatés qui sont un des constituants majeurs du glycocalyx, l'épaisse couche de glycoconjugués que l'on trouve à la surface de la plupart des cellules animales (1). Grâce à ce positionnement stratégique à l'interface de la cellule et de son environnement extérieur, les HS rencontrent, fixent et modulent l'activité d'une multitude de ligands protéiques, et participent ainsi à la plupart des grands processus cellulaires (2). Ces vastes propriétés biologiques s'expliquent par la présence au sein du polysaccharide de motifs saccharidiques spécifiques (3), dont la structure et la sulfatation définit un « glycocode » rassemblant les informations de reconnaissance et d'interaction avec les différents partenaires protéiques. La structure des HS doit dont être très finement régulée, afin de permettre à la cellule d'adapter sa réponse à tout stimuli extérieur. Récemment, il a été montré qu'une famille de sulfatases, les Sulfs jouaient un rôle majeur de régulateurs glycobiologiques, en modifiant la sulfatation des HS et leurs capacités d'interaction (4).

SAGAG Vivès : les HS

Notre équipe s'intéresse tout particulièrement à ce mécanisme enzymatique qui représente la seule machine moléculaire post-synthétique capable de réguler et modifier le glycocode des HS. Dans ce cadre, nos travaux portent sur l'étude des caractéristiques structurales de l'enzymes (5), son organisation moléculaire, ses spécificités de substrat, et les modifications post-traductionnelles essentielles pour son activité. Nous étudions également son activité enzymatique et sa fonction (6), au moyen de tests biologiques in vitro, cellulaires et in vivo disponibles au laboratoire ou par le biais des nombreuses collaborations nationales et internationales établies sur le sujet. Enfin, nous cherchons à développer des inhibiteurs basés sur des mimétiques d'HS pour le développement de nouvelles approches thérapeutiques anti-cancéreuses ciblant les Sulfs (7).

SAGAG Vivès : Etude des Sulfs

L'équipe
Actualités
Financements
Réseaux scientifiques
Glyco@Alps
Publications de l'équipe

L'équipe

Equipe SAGAG-Vivès

– Yara AWAD, doctorante
– Rebecca-Joe Boustany, doctorante
– Alima Chali (co-direction IRIG/Biosanté), doctorante
– Evelyne Gout, IE CNRS
– Gabriela Rosca, étudiante M2
– Romain Vivès (chef d'équipe), DR CNRS

Anciens membres de l'équipe

Actualités

Visite à l'Université de Leeds...

Archives d'actualités

Financements

ANR, UGA, Glyco@Alps...

Réseaux scientifiques

Collaborations scientifiques nationales

Dr. D. Bonnaffé/C. le Narvor, ICMMO, Orsay
Dr. R. Daniel, LAMBE, Evry
Dr. O. Filhol-Cochet, CEA/Biosanté, Grenoble
Dr. F. Lecaille, CEPR, Tours
Dr. B. Marteyn IBMC, Strasbourg

Collaborations scientifiques internationales

Dr. S. Grazioli/ N. Veraldi, HUG, Genève, Suisse
Dr. C. Reis/ A. Magalhaes, I3S, Porto, Portugal
Dr. A. Russel, Oxford univ., Oxford, UK
Dr. J. van den Born, Groningen univ., Groningen, The Netherlands
Dr. E. Schmidt, Colorado univ., Denver, USA
Dr. X. Yue, Louisiana univ., New Orleans, USA

Le GDR « Gagosciences »

Romain Vivès a été le coordinateur du GDR CNRS3739 « Gagosciences » (2016-2020). Ce GDR a été créé afin de fédérer des équipes de recherche françaises étudiant les GAGs au sein d'un réseau structuré, bâti autour de compétences diversifiées et d'approches complémentaires, et promouvant une démarche pluridisciplinaire pour la progression des connaissances en glycosciences. Les recherches conduites par les équipes membres s'articulent autour de 3 grands pôles de compétence (Biologie, Chimie et Développements méthodologiques), et l'ambition du GDR est de favoriser les échanges entre ces différentes disciplines.

Glyco@Alps

Glyc@Alps

Romain Vivès est coordinateur du programme IDEX-UGA Glyco@Alps. Le réseau Glyco@Alps explore la complexité et la diversité structurale fascinante des sucres, dont ceux issus de la biodiversité alpine, et se concentre sur leur exploitation dans les produits biopharmaceutiques, le diagnostic médical, la médecine personnalisée, les matériaux, la durabilité environnementale et les bio-industries innovantes. Il rassemble une centaine de chercheurs de la région grenobloise, issus de 21 laboratoires différents.

Glyco@Alps

Publications de l'équipe

2025

The Pathophysiological Functions of Heparanases : From Evolution, Structural and Tissue-Specific Perspectives.
Vahdatahar E, Daviaud C, Main H, Havret R, Debarnot C, Favot-Laforge L, Jégou JF, Fruitier-Arnaudin I, Dufour A, Vivès R, Morel F, Bourne Y, Baranger K.
FASEB J. 2025 Sep 15 ;39(17):e70976. ⟨10.1096/fj.202501859R⟩

The inflammatory APRIL (a proliferation-inducing ligand) antagonizes chondroitin sulphate proteoglycans to promote axonal growth and myelination.
Ahmed MC, Kakunuri T, Peris L, Meffre D, Yilmaz EN, Grewing L, Guerrero González R, Manfroi B, Gout E, Vivès RR, Fitzgerald U, Schneider P, Jafarian-Tehrani M, Kuhlmann T, Huard B.
Brain Commun. 2025 Feb 7 ;7(1):fcae473. ⟨10.1093/braincomms/fcae473⟩

Tumor suppressive role of the antimicrobial lectin REG3A targeting the O -GlcNAc glycosylation pathway.
Moniaux N, Geoffre N, Deshayes A, Dos Santos A, Job S, Lacoste C, Nguyen TS, Darnaud M, Friedel-Arboleas M, Guettier C, Purhonen J, Kallijärvi J, Amouyal G, Amouyal P, Bréchot C, Vivès RR, Buendia MA, Issad T, Faivre J.
Hepatology. 2025 May 1 ;81(5):1416-1432 ⟨10.1097/HEP.0000000000000993⟩

2024

Myeloid deficiency of heparan sulfate 6-O-endosulfatases impairs bone marrow hematopoiesis.
Whitehead AK, Wang Z, Boustany RJ, Vivès RR, Lazartigues E, Liu J, Siggins RW, Yue X.
Matrix Biol. 2024 134:107-118. ⟨10.1016/j.matbio.2024.10.002⟩

A biological guide to glycosaminoglycans : current perspectives and pending questions.
Ricard-Blum S, Vivès RR, Schaefer L, Götte M, Merline R, Passi A, Heldin P, Magalhães A, Reis CA, Skandalis SS, Karamanos NK, Perez S, Nikitovic D.
FEBS J. 2024 291:3331-3366 ⟨10.1111/febs.17107⟩

BMP2 binds non-specifically to PEG-passivated biomaterials and induces substantial signaling
Jean Le Pennec , Amaury Guibert , Romain R. Vivès, Elisa Migliorini
Macromol Biosci. 2024 4:e2400169. ⟨10.1002/mabi.202400169⟩

2023

Functional and structural insights into human N‐deacetylase/N‐sulfotransferase activities
Sylvain D Vallet, Thibault Annaval, Romain R Vives, Emeline Richard, Jerome Hénault, Christine Le Narvor, David Bonnaffé, Bernard Priem, Rebekka Wild, Hugues Lortat‐jacob
Proteoglycan Research, 2023, 1 (3), pp.e8. ⟨10.1002/pgr2.8⟩

Glycosaminoglycans : what remains to be deciphered ?
Serge Perez, Olga Makshakova, Jesus Angulo, Emiliano Bedini, Antonella Bisio, Jose Luis de Paz, Elisa Fadda, Marco Guerrini, Michal Hricovini, Milos Hricovini, Frederique Lisacek, Pedro M. Nieto, Kevin Pagel, Giulia Pairardi, Ralf Richter, Sergey A. Samsonov, Romain A. Vivès, Dragana Nikitovic, Sylvie Ricard Blum
JACS Au, 2023, ⟨10.1021/jacsau.2c00569⟩

Low-molecular weight sulfated marine polysaccharides : Promising molecules to prevent neurodegeneration in mucopolysaccharidosis IIIA ?
Noemi Veraldi, Isabelle Dentand Quadri, Yohan van de Looij, Laura Malaguti Modernell, Corinne Sinquin, Agata Zykwinska, Benjamin B. Tournier, Fabien Dalonneau, Honglian Li, Jin-Ping Li, Philippe Millet, Romain Vives, Sylvia Colliec Jouault, Ariane de Agostini, Eduardo Farias Sanches, Stéphane V. Sizonenko
Carbohydrate Polymers, 2023, 320, pp.121214. ⟨10.1016/j.carbpol.2023.121214⟩

Modified minimal-size fragments of Heparan Sulfate as inhibitors of endosulfatase-2 (Sulf-2)
Alice Kennett, Sven Epple, Gabriella van der Valk, Irene Georgiou, Evelyne Gout, Romain Vives, Angela Russell
Chemical Communications, In press, ⟨10.1039/D3CC02565A⟩

Structure and functional impact of glycosaminoglycan modification of HSulf-2 endosulfatase revealed by atomic force microscopy and mass spectrometry
Ilham Seffouh, Mélanie Bilong, Cédric Przybylski, Nesrine El Omrani, Salomé Poyer, Guillaume Lamour, Marie-Jeanne Clément, Rebecca-Joe Boustany, Evelyne Gout, Florence Gonnet, Romain R Vivès, Régis Daniel
Scientific Reports, 2023, 13 (1), ⟨10.1038/s41598-023-49147-5⟩

Sweet but Challenging : Tackling the Complexity of GAGs with Engineered Tailor‐Made Biomaterials
Jean Le Pennec, Catherine Picart, Romain R Vivès, Elisa Migliorini
Advanced Materials, 2023, ⟨10.1002/adma.202312154⟩

2022

Binding of heparan sulfate to human cystatin C modulates inhibition of cathepsin L : Putative consequences in mucopolysaccharidosis
Sophie Denamur, Thibault Chazeirat, Martyna Maszota-Zieleniak, Romain Vivès, Ahlame Saidi, Fuming Zhang, Robert J. Linhardt, François Labarthe, Sergey A. Samsonov, Gilles Lalmanach, Fabien Lecaille
Carbohydrate Polymers, 2022, 293, pp.119734. ⟨10.1016/j.carbpol.2022.119734⟩

Endothelial glycocalyx degradation in multisystem inflammatory syndrome in children related to COVID-19
Noemi Veraldi, Romain Vivès, Géraldine Blanchard-Rohner, Arna L'Huillier, Noemie Wagner, Marie Rohr, Maurice Beghetti, Ariane de Agostini, Serge Grazioli, Arnaud L'huillier
Journal of Molecular Medicine, In press, ⟨10.1007/s00109-022-02190-7⟩

Extracellular endosulfatase Sulf-2 harbors a chondroitin/dermatan sulfate chain that modulates its enzyme activity
Rana El Masri, Amal Seffouh, Caroline Roelants, Ilham Seffouh, Evelyne Gout, Julien Pérard, Fabien Dalonneau, Kazuchika Nishitsuji, Fredrik Noborn, Mahnaz Nikpour, Göran Larson, Yoann Crétinon, Mélanie Friedel-Arboleas, Kenji Uchimura, Régis Daniel, Hugues Lortat-Jacob, Odile Filhol, Romain R. Vivès
Cell Reports, 2022, 38 (11), pp.110516. ⟨10.1016/j.celrep.2022.110516⟩

Glycosyltransferases EXTL2 and EXTL3 cellular balance dictates Heparan Sulfate biosynthesis and shapes gastric cancer cell motility and invasion
Catarina Marques, Juliana Poças, Catarina Gomes, Isabel Faria-Ramos, Celso Reis, Romain Vivès, Ana Magalhães
Journal of Biological Chemistry, 2022, pp.102546. ⟨10.1016/j.jbc.2022.102546⟩

Preparation and Characterization of Heparan Sulfate-Derived Oligosaccharides to Investigate Protein–GAG Interaction and HS Biosynthesis Enzyme Activity
Cédric Laguri, Rabia Sadir, Evelyne Gout, Romain Vivès, Hugues Lortat-Jacob
Glycosaminoglycans, 2303, Springer US, pp.121-137, 2022, Methods in Molecular Biology, ⟨10.1007/978-1-0716-1398-6_11⟩

Neutrophils degranulate GAG-containing proteoglycofili, which block Shigella growth and degrade virulence factors
A.C. André, M. Valente Barroso, J. Skerniskyte, M. Siegwald, V. Paul, L. Debande, C. Ridley, I. Svahn, S. Rigaud, J.Y. Tinevez, R.R. Vivès, P.J. Sansonetti, D.J. Thornton and B.S. Marteyn.
BioRxiv 2022 ⟨10.1101/2022.02.08.479570⟩

2021

Heparan sulfate biosynthesis and sulfation profiles as modulators of cancer signalling and progression
Catarina Marques, Celso Reis, Romain Vivès, Ana Magalhães
Frontiers in Oncology, 2021, 11, pp.718752. ⟨10.3389/fonc.2021.778752⟩

Hypercholesterolemia in Progressive Renal Failure Is Associated with Changes in Hepatic Heparan Sulfate - PCSK9 Interaction
Pragyi Shrestha, Saritha Adepu, Romain R. Vivès, Rana El Masri, Astrid Klooster, Fleur Kaptein, Wendy Dam, Stephan J L Bakker, Harry Van Goor, Bart van de Sluis ; Jacob van Den Born
Journal of the American Society of Nephrology, 2021, 32 (6), pp.1371-1388. ⟨10.1681/ASN.2020091376⟩

Proteinuria converts hepatic heparan sulfate to an effective proprotein convertase subtilisin kexin type 9 enzyme binding partner
Pragyi Shrestha, Saleh Yazdani, Romain Vivès, Rana El Masri, Wendy Dam, Bart van de Sluis, Jacob van den Born
Kidney International, 2021, ⟨10.1016/j.kint.2021.01.023⟩

Regulation of fractone heparan sulfate composition in young and aged subventricular zone neurogenic niches
Aurelien Kerever, Fumina Nagahara, Kazuko Keino-Masu, Masayuki Masu, Toin van Kuppevelt, Romain Vivès, Eri Arikawa-Hirasawa
Glycobiology, 2021, ⟨10.1093/glycob/cwab081⟩

Role of the interactions of soft hyaluronan nanomaterials with CD44 and supported bilayer membranes in the cellular uptake
Raul Diaz-Salmeron, Jean-Philippe Michel, Hicheme Hadji, Evelyne Gout, Romain. Vivès, Gilles Ponchel, Kawthar Bouchemal
Colloids and Surfaces B : Biointerfaces, 2021, 205, pp.111916. ⟨10.1016/j.colsurfb.2021.111916⟩

2020

Heparan Sulfate Proteoglycans Biosynthesis and Post Synthesis Mechanisms Combine Few Enzymes and Few Core Proteins to Generate Extensive Structural and Functional Diversity
Thibault Annaval, Rebekka Wild, Yoann Crétinon, Rabia Sadir, Romain Vivès, Hugues Lortat-Jacob
Molecules, 2020, 25 (18), pp.4215. ⟨10.3390/molecules25184215⟩

HS and Inflammation : A Potential Playground for the Sulfs ?
Rana El Masri, Yoann Crétinon, Evelyne Gout, Romain R Vivès
Frontiers in Immunology, 2020, 11, ⟨10.3389/fimmu.2020.00570⟩

MASP-2 Is a Heparin-Binding Protease ; Identification of Blocking Oligosaccharides
Ditmer Talsma, Felix Poppelaars, Wendy Dam, Anita Meter-Arkema, Romain R Vivès, Peter Gál, Geert-Jan Boons, Pradeep Chopra, Annamaria Naggi, Marc Seelen, Stephan Berger, Mohamed Daha, Coen Stegeman, Jacob van den Born
Frontiers in Immunology, 2020, 11, ⟨10.3389/fimmu.2020.00732⟩

2019

A microscale double labelling of GAG oligosaccharides compatible with enzymatic treatment and mass spectrometry
Cédric Przybylski, Véronique Bonnet, Romain R Vivès
Chemical Communications, 2019, 55, pp.4182-4185. ⟨10.1039/C9CC00254E⟩

A proliferation‐inducing ligand–mediated anti‐inflammatory response of astrocytes in multiple sclerosis
Laurie Baert, Mahdia Benkhoucha, Natalia Popa, Mashal C Ahmed, Benoit Manfroi, Jean Boutonnat, Nathalie Sturm, Gilda Raguenez, Marine Tessier, Olivier Casez, Romain Marignier, Mitra Ahmadi, Alexis Broisat, Catherine Ghezzi, Cyril Rivat, Corinne Sonrier, Michael Hahne, Dominique L. Baeten, Romain R Vivès, Hugues Lortat-Jacob, Patrice N. Marche, Pascal Schneider, Hans P Lassmann, José Boucraut, Patrice H Lalive, Bertrand Huard
Annals of Neurology, 2019, 85 (3), pp.406-420. ⟨10.1002/ana.25415⟩

Expression and purification of recombinant extracellular sulfatase HSulf-2 allows deciphering of enzyme sub-domain coordinated role for the binding and 6-O-desulfation of heparan sulfate
Amal Seffouh, Rana El Masri, Olga N Makshakova, Evelyne Gout, Zahra El Oula Hassoun, Jean-Pierre Andrieu, Hugues Lortat-Jacob, Romain R Vivès
Cellular and Molecular Life Sciences, 2019, 76 (9), pp.1807-1819. ⟨10.1007/s00018-019-03027-2⟩

Heparan sulfate in chronic kidney diseases : Exploring the role of 3-O-sulfation
Laura E Ferreras, Anna Moles, Gerhard Situmorang, Rana El Masri, Imogen Wilson, Katie Cooke, Emily Thompson, Marion Kusche-Gullberg, Romain R Vivès, Neil Sheerin, Simi Ali
Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - General Subjects, 2019, 1863 (5), pp.839-848

Loss of endothelial sulfatase-1 after experimental sepsis attenuates subsequent pulmonary inflammatory responses
Kaori Oshima, Xiaorui Han, Yilan Ouyang, Rana El Masri, Yimu Yang, Sarah Haeger, Sarah Mcmurtry, Trevor Lane, Pavel Davizon-Castillo, Fuming Zhang, Xinping Yue, Romain R Vivès, Robert Linhardt, Eric Schmidt
American Journal of Physiology - Lung Cellular and Molecular Physiology, 2019, ⟨10.1152/ajplung.00175.2019⟩

Mass spectrometry analysis of the human endosulfatase Hsulf-2
Ilham Seffouh, Cédric Przybylski, Amal Seffouh, Rana El Masri, Romain R Vivès, Florence Gonnet, Régis Daniel
Biochemistry and Biophysics Reports, 2019, 18, pp.100617. ⟨10.1016/j.bbrep.2019.01.010⟩

Substrate binding mode and catalytic mechanism of human heparan sulfate d-glucuronyl C5 epimerase
Claire Debarnot, Yoan Monneau, Veronique Roig-Zamboni, Vincent Delauzun, Christine Le Narvor, Emeline Richard, Jérôme Hénault, Adeline Goulet, Firas Fadel, Romain R Vivès, Bernard Priem, David Bonnaffé, Hugues Lortat-Jacob, Yves Bourne
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2019, 116 (14), pp.6760-6765. ⟨10.1073/pnas.1818333116⟩

2018

Genetic and enzymatic characterization of 3-O-sulfotransferase SNPs associated with Plasmodium falciparum parasitaemia
Ngoc Thy Nguyen, Romain R Vivès, Magali Iché-Torres, Vincent Delauzun, Els Saesen, Veronique Roig-Zamboni, Hugues Lortat-Jacob, Pascal Rihet, Yves Bourne
Glycobiology, 2018, 28 (7), pp.534-541. ⟨10.1093/glycob/cwy038⟩

2017

A jasmonic acid derivative improves skin healing and induces changes in proteoglycan expression and glycosaminoglycan structure
Elodie Henriet, Sibylle Jäger, Christian Tran, Philippe Bastien, Jean-François Michelet, Anne-Marie Minondo, Florian Formanek, Maria Dalko-Csiba, Hugues Lortat-Jacob, Lionel Breton, Romain R Vivès
Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - General Subjects, 2017, 1861 (9), pp.2250-2260. ⟨10.1016/j.bbagen.2017.06.006⟩

High sodium diet converts renal proteoglycans into pro-inflammatory mediators in rats
Ryanne S. Hijmans, Pragyi Shrestha, Sarpong Ka, Saleh Yazdani, Rana El Masri, Wilhelmina H. A. De Jong, Gerjan Navis, Romain R Vivès, Jacob van Den Born
PLoS ONE, 2017, 12 (6), pp.e0178940. ⟨10.1371/journal.pone.0178940.eCollection2017⟩

Solution structure of CXCL13 and heparan sulfate binding show that GAG binding site and cellular signalling rely on distinct domains
Yoan Monneau, Lingjie Luo, Nehru Viji Sankaranarayanan, Balaji Nagarajan, Romain R Vivès, Françoise Baleux, Umesh R. Desai, Fernando Arenzana-Seidedos, Hugues Lortat-Jacob
Open Biology, 2017, 7, pp.170133. ⟨10.1098/rsob.170133⟩

The "in and out" of glucosamine 6-O-sulfation : the 6th sense of heparan sulfate.
Rana El Masri, Amal Seffouh, Hugues Lortat-Jacob, Romain R Vivès
Glycoconjugate Journal, 2017, 34 (3), pp.285-298. ⟨10.1007/s10719-016-9736-5⟩

2015

Heparan sulfate-dependent enhancement of henipavirus infection.
Cyrille Mathieu, Kévin P Dhondt, Marie Châlons, Stéphane Mély, Hervé Raoul, Didier Negre, Cosset François-Loïc, Denis Gerlier, Romain R Vivès, Branka Horvat
mBio, 2015, 6 (2), pp.e02427. ⟨10.1128/mBio.02427-14⟩

Langerin–heparin interaction : two binding sites for small and large ligands as revealed by a combination of NMR spectroscopy and cross-linking mapping experiments
Juan Muñoz-García, Eric Chabrol, Romain Vivès, Aline Thomas, José de Paz, Javier Rojo, Anne Imberty, Franck Fieschi, Pedro Nieto, Jesus Angulo
Journal of the American Chemical Society, 2015, 137 (12), pp.4100-4110. ⟨10.1021/ja511529x⟩

Syndecan-1 alters heparan sulfate composition and signaling pathways in malignant mesothelioma
Ghazal Heidari-Hamedani, Romain R Vivès, Amal Seffouh, Nikolaos A Afratis, Arie Oosterhof, Toin H van Kuppevelt, Nikos K Karamanos, Muzaffer Metintas, Anders Hjerpe, Katalin Dobra, Tünde Szatmári
Cellular Signalling, 2015, 27 (10), pp.2054-67. ⟨10.1016/j.cellsig.2015.07.017⟩

2014

Post-Synthetic Regulation of HS Structure : The Yin and Yang of the Sulfs in Cancer.
Romain R Vivès, Amal Seffouh, Hugues Lortat-Jacob
Frontiers in Oncology, 2014, 3, pp.331. ⟨10.3389/fonc.2013.00331⟩

Actualités (archives)

2025

Inauguration de l'exposition Glyco@Alps TerCel à La Casemate

SAGAG Vivès

Avec les Doctorants de l'équipe, aux journées GLyco@Club days à Autrans ! :-)

Intéressé(e) par les sulfatases ciblant les GAG ? Nous recrutons !
Post-doctorant(e) recherché.

2024

Félicitations à Catarina Marques pour une magnifique soutenance de thèse ! Nous avons une nouvelle docteure UGA/Université de Porto ! :-)

Bravo Jean pour ce superbe travail : l'interaction BMP2/GAG comme on ne l'a jamais vu !

Un nouvel état des lieux de la recherche en biologie sur les GAGs

2023

Un nouvel inhibiteur ciblant les Sulfs !
(collaboration Université d'Oxford)
En savoir plus

15 scientifiques donnent leur vision de la recherche sur les GAGs et les perspectives futures

2022
Nos derniers travaux sur Sulfs mis à la une !

CNRS INSB :
https://www.insb.cnrs.fr/fr/cnrsinfo/un-baillon-moleculaire-de-sucre-pour-reguler-lactivite-pro-tumorale-de-lendosulfatase

CEA IRIG :
https://www.cea.fr/drf/irig/Pages/Actualites/Resultats-scientifiques/2022/17_Vives+Filhol.aspx

CEA DRF :
https://www.cea.fr/drf/Pages/Actualites/En-direct-des-labos/2022/un-polysaccharide-baillonne-lenzyme-pro-tumorale-hsulf.aspx

Alumni

Doctorants :
Catarina Marques, PhD student (co-tutelle Université de Porto), 2021-2024
Jean Le pennec (co-direction IRIG/Biosanté), 2020-2023
Yoann Crétinon, 2018-2022
Rubal Ravinder (co-direction CERMAV), 2017-2021
Rana El Masri, 2016-2019
Amal Seffouh, 2013-2016

Post-docs, ingénieurs, techniciens :

Mélanie Friedel (CDD AI), 2021-2023
Fabien Dalonneau (CDD AI), 2019-2020
Elodie Henriet (CDD ingénieur), 2013-2014

Stages :
Palig Karaminassian (Master 2), 2023
Marina Callandret (Master 2), 2021
Gaël Méli-Duthoit (BTS), 2018-2020
Mayssa Ghaddar (Master 2), 2018
Zahra al Oula Hassoun (Master 2), 2017
Elisa Tournebize (Master 1), 2016
Hugo Fumat (Licence 3), 2015
Adrien Laroche (Licence 3), 2014

Equipe SAGAG-Vivès

Equipe Lortat-Jacob

WILD Rebekka — 2022-11-25T10:49:31Z

Thématique scientifique
L'équipe développe deux axes de recherches qui visent à : (1) analyser les relations structures-fonctions des interactions protéine-glycosaminoglycane, en utilisant principalement des cytokines ou des pathogènes comme modèles d'études et :(2) caractériser les mécanismes déterminant les séquences oligosaccharidiques des motifs fonctionnels des HS en étudiant la machinerie biosynthétique de ces molécules.

- Groupe Structure et Activité des Glycosaminoglycanes (Hugues Lortat-Jacob)

Thèses

WILD Rebekka — 2022-11-18T10:16:38Z

Sommaire

Toutes nos thèses

La liste des thèses soutenues dans le groupe Structure et Activité des Glycosaminoglycanes depuis sa création est disponible année par année ci-dessous (récapitulatif manuel).

Theses 2025

Rebecca-Joe Boustany

Bases structurales du remodelage des héparanes sulfate par les sulfatases extracellulaires Sulfs, soutenue le 5 décembre 2025.

Poushalee Dutta

Caractérisation moléculaire de la polymérisation de la chondroïtine sulfate chez l'homme, soutenue le 24 octobre 2025.

Theses 2024

Catarina Marques

Decoding Heparan Sulfate unique structural epitopes involved in cancer cell signaling, soutenue le 9 décembre 2024.

Theses 2022

Yohan Crétinon

Structural characterization of HSulf by electron microscopy, crystallography and NMR, soutenue le 23 novembre 2022.

Theses 2019

Rana el Masri

« Functional and structural characterization of human endosulfatase HSulf-2, soutenue le 20 septembre 2019.

Theses 2018

Lynda Djerbal

Characterisation of semaphorin 3A-chondroitin sulphate interaction in the central nervous system, soutenue le 30 novembre 2018.

Theses 2016

Amal Seffouh

Caractérisation biochimique et fonctionnelle de l'enzyme HSULF. Thèse de doctorat de l'Université Grenoble Alpes, soutenue le 17 novembre 2016.

Theses 2014

Mathieu Pegeot

Etudes structurales par RMN des profils saccharidiques d'héparanes sulfates et de leur régulation cellulaire. Thèse de doctorat de l'Université Grenoble Alpes, soutenue le 11 décembre 2014.

Theses 2013

Els Saesen

Bases structurales de la régulation des cytokines par les héparanes sulfates : Caractérisation de l'interaction Interféron-gamma - Héparane sulfate. Thèse de doctorat de l'Université Joseph Fourier, Grenoble I, soutenue le 29 janvier 2013.

Theses 2012

Bridgette Connell
Développement d'un test d'interaction entre la protéine d'enveloppe du VIH-1 (gp120) et les corécepteurs CCR5/CXCR4 par résonance plasmonique de surface : Criblage et optimisation d'inhibiteurs de l'entrée virale. Thèse de doctorat de l'Université Joseph Fourier, Grenoble I, soutenue le 16 mars 2012.

Theses 2008

Elodie Crublet
Caractérisation de l'intéraction entre la glycoprotéine d'enveloppe gp120 du VIH-1 et les héparanes sulfate : importance des changements conformationnels induits par la liaison à CD4. Thèse de doctorat de l'Université Joseph Fourier, Grenoble I, soutenue le 08 février 2008.

Theses 2007

Stéphane Sarrazin
Caractérisation des interactions glycosaminoglycannes/protéines dans le but de développer des molécules d'intérêt thérapeutique :
exemples de l'Endocan et de l'IFNg. Thèse de doctorat de l'Université Joseph Fourier, soutenue le 28 juin 2007.

Accéder au texte intégral de nos thèses

Merci de noter que seuls les PDF des thèses qui ne sont pas sous embargo ou sous une obligation contractuelle particulière et pour lesquelles les auteurs ont autorisé la publication figurent dans cette liste détaillée éditée par HAL.
Les thèses des 12 derniers mois ne sont pas encore toutes disponibles sur ce site. Par ailleurs les thèses antérieures à 2010 n'y figurent pas de façon exhaustive.
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Publications

WILD Rebekka — 2022-11-18T10:15:24Z

Sommaire

Publications depuis 2014

La liste des publications du groupe Structure et Activité des Glycosaminoglycanes, parues dans des revues à comité de lecture depuis 2014, ainsi que les ouvrages et chapitres d'ouvrage, est consultable ci-dessous (données issues de HAL-IBS).
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Publications jusqu'à 2013

La liste des publications du groupe de 2000 à 2013 est visible ci-dessous (données saisies de façon manuelle).

Publications 2013

Connell BJ and Lortat-Jacob H
Human Immunodeficiency Virus and Heparan Sulfate : from attachment to entry inhibition.
Frontiers in Immunology (2013) 4 : 385. doi : 10.3389/fimmu.2013.00385

Delehedde M, Devenyns L, Maurage CA and Vivès RR
Endocan in cancers : A Lesson from a circulating dermatan sulfate proteoglycan.
International Journal of Cell Biology (2013) : art.no. 705027

Despras G, Bernard C, Perrot A, Cattiaux L, Prochiantz A, Lortat-Jacob H and Mallet J-M
Toward libraries of biotinylated chondroitin sulfate analogs : from synthesis to in vivo studies.
Chemistry - A European Journal (2013) 19 : 531-540

Legendre B, Tokarski C, Chang Y, De Freitas Caires N, Lortat-Jacob H, De Nadaï P, Rolando C, Duez C, Tsicopoulos A and Lassalle P
The disulfide bond between cysteine 10 and cysteine 34 is required for CCL18 activity.
Cytokine (2013) 64 : 463-470

Saesen E, Sarrazin S, Laguri C, Sadir R, Maurin D, Thomas A, Imberty A and Lortat-Jacob H
Insights into the mechanism by which Interferon-gamma basic amino acid clusters mediate protein binding to heparan sulfate.
Journal of the American Chemical Society (2013) 135 : 9384−9390

Seffouh A, Milz F, Przybylski C, Laguri C, Oosterhof A, Bourcier S, Sadir R, Dutkowski E, Daniel R, van Kuppevelt TH, Dierks T, Lortat-Jacob H, and Vivès RR
HSulf sulfatases catalyse processive and orientated 6-O-desulfation of heparan sulfate that differentially regulate fibroblast growth factor activity.
Faseb Journal (2013) 27 : 2431-2439

Publications 2012

Bartoli J, Roget A and Livache T
Polypyrrole-oligosaccharide microarray for the measurement of biomolecular interactions by surface plasmon resonance imaging.
Methods in Molecular Biology (2012) 808 : 69-86

Carulli S, Beck K, Dayan G, Boulesteix S, Lortat-Jacob H and Rousselle P
The cell surface proteoglycans syndecan-1 and -4 bind overlapping but distinct sites in the laminin α3 LG45 domain.
Journal of Biological Chemistry (2012) 287 (15) : 12204-12216

Chabrol E, Nurisso A, Daina A, Vassal-Stermann E, Thepaut M, Girard E, Vives RR and Fieschi F
Glycosaminoglycans are interactants of langerin : Comparison with gp120 highlights an unexpected calcium-independent binding mode.
PLoS One (2012) 7 (10) : e50722

Connell BJ, Baleux F, Coic YM, Clayette P, Bonnaffé D and Lortat-Jacob H
A synthetic heparan sulfate-mimetic peptide conjugated to a mini CD4 displays very high anti-HIV-1 activity independently of coreceptor usage.
Chemistry & Biology (2012) 19 (1) : 131-139

Hou Y, Genua M, Tada Batista D, Calemczuk R, Buhot A, Fornarelli P, Koubachi J, Bonnaffé D, Saesen E, Laguri C, Lortat-Jacob H and Livache T
Continuous Evolution Profiles for Electronic Tongue Based Analysis.
Angewandte Chemie International Edition (2012) 51 (41) : 10394-10398

Lortat-Jacob H, Burhan I, Scarpellini A, Thomas A, Imberty A, Johnson T, Gutierrez A and Verderio EAM
Transglutaminase-2 interaction with heparin : Identification of a heparin binding site that regulates cell adhesion to fibronectin-transglutaminase-2 matrix.
Journal of Biological Chemistry (2012) 287 (22) : 18005-18017

Rueda P, Richart A, Récalde A, Richart A, Gasse P, Vilar J, Guérin C, Lortat-Jacob H, Vieira P, Baleux F, Chretien F, Arenzana-Seisdedos F and Silvestre J-S
Homeostatic and tissue reparation default in mice carrying selective genetic invalidation of CXCL12/proteoglycan interactions.
Circulation (2012) 126 : 1882-1895

Sarris M, Masson JB, Maurin D, Van der Aa LM, Boudinot P, Lortat-Jacob H and Herbomel P
Chemokines guide neutrophil interstitial migration by imposing a haptotactic biased random walk.
Current Biology (2012) 22 : 2375-2382

Vassal-Stermann E, Duranton A, Black A.F, Azadiguian G, Demaude J, Lortat-Jacob H, Breton L, and Vivès R.R
A new C-Xyloside induces modifications of GAG expression, structure and functional properties.
PLoS ONE (2012) 7 (10) : e47933

Zaferani A, Vivès RR, van der Pol P, Navis GJ, Daha MR, van Kooten C, Lortat-Jacob H, Seelen MA and van den Born J
Factor H and properdin recognize different epitopes on renal tubular epithelial heparan sulphate.
Journal of Biological Chemistry (2012) 287 (37) : 31471-31481

Publications 2011

Boldajipour B, Doitsidou M, Tarbashevich K, Laguri C, Yu SR, Ries J, Dumstrei K, Thelen S, Dorries J, Messerschmidt EM, Thelen M, Schwille P, Brand M, Lortat-Jacob H and Raz E
Cxcl12 evolution - subfunctionalization of a ligand through altered interaction with the chemokine receptor.
Development (2011) 138 (14) : 2909-2914

Laguri C, Sapay N, Simorre J-P, Brutscher B, Imberty A, Gans P and Lortat-Jacob H
13C-labeled heparan sulfate analogue as a tool to study protein/heparan sulfate interaction by NMR spectroscopy. Application to the CXCL12α chemokine.
Journal of the American Chemical Society (2011) 133 : 9642-9645

Sabatte J, Faigle W, Ceballos A, Morelle W, Rodriguez Rodrigues C, Remes Lenicov F, Thepaut M, Fieschi F, Malchiodi E, Fernandez M, Arenzana-Seisdedos F, Lortat-Jacob H, Michalski JC, Geffner J and Amigorena S
Semen Clusterin Is a Novel DC-SIGN Ligand.
Journal of Immunology (2011) 187 (10) : 5299-5309

Zaferani A, Vivès RR, van der Pol P, Hakvoort JJ, Navis GJ, van Goor H, Daha MR, Lortat-Jacob H, Seelen MA and van den Born J
Identification of tubular heparan sulfate as a major docking platform for the alternative complement component properdin in proteinuric renal disease.
Journal of Biological Chemistry (2011) 286 (7) : 5359-5367

Publications 2010

Garlatti V, Chouquet A, Lunardi T, Vives R, Paidassi H, Lortat-Jacob H, Thielens NM, Arlaud GJ and Gaboriaud C
Cutting edge : C1q binds deoxyribose and heparan sulfate through neighboring sites of its recognition domain.
Journal of Immunology (2010) 185 (2) : 808-812

Gendrin C, Sarrazin S, Bonnaffe D, Jault JM, Lortat-Jacob H and Dessen A
Hijacking of the pleiotropic cytokine interferon-gamma by the type III secretion system of Yersinia pestis.
PLoS One (2010) 5 (12) : e15242

Gout E, Schoehn G, Fenel D, Lortat-Jacob H and Fender P
The adenovirus type 3 dodecahedron's RGD loop comprises an HSPG binding site that influences integrin binding.
Journal of Biomedicine and Biotechnology (2010) 10 : ID 541939

Jasnin M, van Eijck L, Koza MM, Peters J, Laguri C, Lortat-Jacob H and Zaccai G
Dynamics of heparan sulfate explored by neutron scattering.
Physical Chemistry Chemical Physics (2010) 12 (14) : 3360-3362

Przybylski C, Gonnet F, Bonnaffe D, Hersant Y, Lortat-Jacob H and Daniel R
HABA-based ionic liquid matrices for UV-MALDI-MS analysis of heparin and heparan sulfate oligosaccharides.
Glycobiology (2010) 20 (2) : 224-234

Przybylski C, Gonnet F, Hersant Y, Bonnaffe D, Lortat-Jacob H and Daniel R
Desorption electrospray ionization mass spectrometry of glycosaminoglycans and their protein noncovalent complex.
Analytical Chemistry (2010) 82 (22) : 9225-9233

Rossi V, Bally I, Ancelet S, Xu Y, Fremeaux-Bacchi V, Vives RR, Sadir R, Thielens N and Arlaud GJ
Functional characterization of the recombinant human C1 inhibitor serpin domain : insights into heparin binding.
Journal of Immunology (2010) 184 (9) : 4982-4989

Sarrazin S, Lyon M, Deakin JA, Guerrini M, Lassalle P, Delehedde M and Lortat-Jacob H
Characterization and binding activity of the chondroitin/dermatan sulfate chain from Endocan, a soluble endothelial proteoglycan.
Glycobiology (2010) 20 (11) : 1380-1388

Publications 2009

Baleux F, Loureiro-Morais L, Hersant Y, Clayette P, Arenzana-Seisdedos F, Bonnaffe D and Lortat-Jacob H
A synthetic CD4-heparan sulfate glycoconjugate inhibits CCR5 and CXCR4 HIV-1 attachment and entry.
Nature Chemical Biology (2009) 5 (10) : 743-748

Duchardt F, Ruttekolk IR, Verdurmen WP, Lortat-Jacob H, Burck J, Hufnagel H, Fischer R, van den Heuvel M, Lowik DW, Vuister GW, Ulrich A, de Waard M and Brock R
A cell-penetrating peptide derived from human lactoferrin with conformation-dependent uptake efficiency.
Journal of Biological Chemistry (2009) 284 (52) : 36099-36108

Lortat-Jacob H
The molecular basis and functional implications of chemokine interactions with heparan sulphate.
Current Opinion in Structural Biology (2009) 19 : 543-548

Scarpellini A, Germack R, Lortat-Jacob H, Muramatsu T, Billett E, Johnson T and Verderio EA
Heparan sulfate proteoglycans are receptors for the cell-surface trafficking and biological activity of transglutaminase-2.
Journal of the Biological Chemistry (2009) 284 (27) : 18411-18423

Seiradake E, Henaff D, Wodrich H, Billet O, Perreau M, Hippert C, Mennechet F, Schoehn G, Lortat-Jacob H, Dreja H, Ibanes S, Kalatzis V, Wang JP, Finberg RW, Cusack S and Kremer EJ
The cell adhesion molecule "CAR" and sialic acid on human erythrocytes influence adenovirus in vivo biodistribution.
PLoS Pathogens (2009) 5 (1) : e1000277

Seiradake E, Philipsborn ACV, Henry M, Lortat-Jacob H, Jamin M, Hemrika W, Bastmeyer M, Cusack S and McCarthy AA
Structure and functional relevance of the Slit2 homodimerization domain.
Embo Reports (2009) 10 (7) : 736-741

Siqueira-Silva J, Yeda FP, Favier AL, Mezin P, Silva ML, Barrella KM, Mehnert DU, Fender P and Harsi CM
Infection kinetics of human adenovirus serotype 41 in HEK 293 cells.
Memorias do Instituto Oswaldo Cruz (2009) 104 (5) : 736-744

Sulka B, Lortat-Jacob H, Terreux R, Letourneur F and Rousselle P
Tyrosine dephosphorylation of the syndecan-1 PDZ binding domain regulates syntenin-1 recruitment.
Journal of Biological Chemistry (2009) 284 (16) : 10659-10671

Tristan A, Benito Y, Montserret R, Boisset S, Dusserre E, Penin F, Ruggiero F, Etienne J, Lortat-Jacob H, Lina G, Bowden MG and Vandenesch F
The signal peptide of Staphylococcus aureus panton valentine leukocidin LukS component mediates increased adhesion to heparan sulfates.
PLoS ONE (2009) 4 (4) : e5042

Publications 2008

Adam E, Sarrazin S, Landolfi C, Motte V, Lortat-Jacob H, Lassalle P and Delehedde M
Efficient long-term and high-yielded production of a recombinant proteoglycan in eukaryotic HEK293 cells using a membrane-based bioreactor.
Biochemical and Biophysical Research Communications (2008) 369(2) : 297-302

Crublet E, Andrieu JP, Vives RR and Lortat-Jacob H
The HIV-1 envelope glycoprotein gp120 features four heparan sulfate binding domains, including the co-receptor binding site.
Journal of Biological Chemistry (2008) 283 (22) : 15193-15200

Fender P, Schoehn G, Perron-Sierra F, Tucker GC and Lortat-Jacob H
Adenovirus dodecahedron cell attachment and entry are mediated by heparan sulfate and integrins and vary along the cell cycle.
Virology (2008) 371 (1) : 155-164

Laguri C, Arenzana-Seisdedos F and Lortat-Jacob H
Relationships between glycosaminoglycan and receptor binding sites in chemokines-the CXCL12 example.
Carbohydrate research (2008) 343 (12) : 2018-2023

Mercey E, Sadir R, Maillart E, Roget A, Baleux F, Lortat-Jacob H and Livache T
Polypyrrole oligosaccharide array and surface plasmon resonance imaging for the measurement of glycosaminoglycan binding interactions.
Analytical Chemistry (2008) 80 (9) : 3476-3482

Ram N, Aroui S, Jaumain E, Bichraoui H, Mabrouk K, Ronjat M, Lortat-Jacob H and De Waard M
Direct peptide interaction with surface glycosaminoglycans contributes to the cell penetration of maurocalcine.
Journal of Biological Chemistry (2008) 283 (35) : 24274-24284

Rueda P, Balabanian K, Lagane B, Staropoli I, Chow K, Levoye A, Laguri C, Sadir R, Delaunay T, Izquierdo E, Pablos JL, Lendinez E, Caruz A, Franco D, Baleux F, Lortat-Jacob H and Arenzana-Seisdedos F
The CXCL12gamma chemokine displays unprecedented structural and functional properties that make it a paradigm of chemoattractant proteins.
PLoS ONE (2008) 3 (7) : e2543

Sorensen HP, Vives RR, Manetopoulos C, Albrechtsen R, Lydolph MC, Jacobsen J, Couchman JR and Wewer UM
Heparan sulfate regulates ADAM12 through a molecular switch mechanism.
Journal of the Biological Chemistry (2008) 283 (46) : 31920-31932

Publications 2007

Imberty A, Lortat-Jacob H and Perez S
Structural view of glycosaminoglycan-protein interactions.
Carbohydrate Research (2007) 342 (3-4) : 430-439

Laguri C, Sadir R, Rueda P, Baleux F, Gans P, Arenzana-Seisdedos F and Lortat-Jacob H
The novel CXCL12gamma isoform encodes an unstructured cationic domain which regulates bioactivity and interaction with both glycosaminoglycans and CXCR4.
PLoS ONE (2007) 2 (10) : e1110

Publications 2006

Fuschiotti P, Fender P, Schoehn G and Conway JF
Development of the dodecahedral penton particle from Adenovirus 3 for therapeutic application.
Journal of General Virology (2006) 87 (10) : 2901-2905

Fuschiotti P, Schoehn G, Fender P, Fabry CM, Hewat EA, Chroboczek J, Ruigrok RW and Conway JF
Structure of the dodecahedral penton particle from human adenovirus type 3.
Journal of Molecular Biology (2006) 356 (2) : 510-520

Garcel A, Gout E, Timmins J, Chroboczek J and Fender P
Protein transduction into human cells by adenovirus dodecahedron using WW domains as universal adaptors.
Journal of Gene Medicine (2006) 8 (4) : 524-531

Lortat-Jacob H
Interferon and heparan sulphate.
Biochemical Society Transactions (2006) 34 (Part 3) : 461-464

Perez Sanchez H, Tatarenko K, Nigen M, Pavlov G, Imberty A, Lortat-Jacob H, De La Torre JG and Ebel C
Organization of human interferon ?-heparin complexes from solution properties and hydrodynamics.
Biochemistry (2006) 45 (44) : 13227-13238

Sarrazin S, Adam E, Lyon M, Depontieu F, Motte V, Landolfi C, Lortat-Jacob H, Bechard D, Lassalle P and Delehedde M
Endocan or endothelial cell specific molecule-1 (ESM-1) : A potential novel endothelial cell marker and a new target for cancer therapy.
Biochim Biophys Acta-Reviews on cancer (2006) 1765 (1) : 25-37

Tabarani G, Reina JJ, Ebel C, Vives C, Lortat-Jacob H, Rojo J and Fieschi F
Mannose hyperbranched dendritic polymers interact with clustered organization of DC-SIGN and inhibit gp120 binding.
FEBS Letters (2006) 580 (10) : 2402-2408

Vives RR, Lortat-Jacob H and Fender P
Heparan sulphate proteoglycans and viral vectors : ally or foe ?
Current Gene Therapy (2006) 6 (1) : 35-44

Publications 2005

Barbouche R, Lortat-Jacob H, Jones IM and Fenouillet E
Glycosaminoglycans and protein disulfide isomerase-mediated reduction of HIV Env
Molecular Pharmacology (2005) 67 (4) : 1111-1118

Delehedde M, Lortat-Jacob H, Gallagher JB, D., Lequien S and Lassalle P
Proteoglycan involvement in inflammatory diseases. New developments in GAG-based therapies.
Medicinal Chemistry Reviews (2005) 2 (4) : 345-357

Fender P, Boussaid A, Mezin P and Chroboczek J
Synthesis, cellular localization, and quantification of penton-dodecahedron in serotype 3 adenovirus-infected cells.
Virology (2005) 340 (2) : 167-173

Kostlanova N, Mitchell EP, Lortat-Jacob H, Oscarson S, Lahmann M, Gilboa-Garber N, Chambat G, Wimmerova M and Imberty A
The fucose-binding lectin from Ralstonia solanacearum : new type of b-propeller architecture by oligomerisation and interaction with fucoside, fucosyllactose and plant xyloglucan.
Journal of Biological Chemistry (2005) 280 (30) : 27839-27849

Lortat-Jacob H, Fender P and Vives RR
Virus et héparane sulfate : des mécanismes d'adsorption cellulaire à l'entrée virale.
Virologie (2005) 9 : 315-325

Mahot S, Fender P, Vives RR, Caron C, Perrissin M, Gruffat H, Sergeant A and Drouet E
Cellular uptake of the EBV transcription factor EB1/Zta
Virus Research (2005) 110 (1-2) : 187-193

Sarrazin S, Bonnaffe D, Lubineau A and Lortat-Jacob H
Heparan sulfate mimicry : A synthetic glycoconjugate that recognizes the heparin-binding domain of IFNgamma inhibits the cytokine activity.
Journal of Biological Chemistry (2005) 208 (45) : 37558-37564

Vives RR, Imberty A, Sattentau QJ and Lortat-Jacob H
Heparan sulfate targets the HIV-1 envelope glycoprotein gp120 coreceptor binding site
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Characterization of endostatin binding to heparin and heparan sulfate by surface plasmon resonance and molecular modeling : role of divalent cations.
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Heparan sulfate / heparin oligosaccharides protect stromal cell-derived factor-1 (SDF-1)/CXCL12 against proteolysis induced by CD26/dipeptidyl peptidase IV
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Vanhaverbeke C, Simorre J P, Sadir S, Gans P and Lortat Jacob H
NMR characterisation of the interaction between the C-terminal domain of Interferon-g and heparin-derived oligosaccharides
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Vives R R, Crublet E, Andrieu J P, Gagnon J, Rousselle P and Lortat-Jacob H
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Lozach P Y, Lortat Jacob H, de Lacroix de Lavalette A, Staropoli I, Foung S, Amara A, Houles C, Fieschi F, Schwartz O, Virelizier J L, Arenzana Seisdedos F and Altmeyer R
DC-SIGN and L-SIGN are high affinity binding receptors for hepatitis C virus glycoprotein E2
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Okamoto O, Bachy S, Odenthal U, Bernaud J, Rigal D, Lortat Jacob H, Smyth N and Rousselle P
Normal human keratinocytes bind to the alpha3LG4/5 domain of unprocessed laminin-5 through the receptor syndecan-1
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Ricard Blum S
Implication des matricryptines issues des collagenes non fibrillaires, de MMP-2 et de SPARC dans le controle de l'angiogenese
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Timmins J, Schoehn G, Ricard Blum S, Scianimanico S, Vernet T, Ruigrok R W and Weissenhorn W
Ebola virus matrix protein VP40 interaction with human cellular factors Tsg101 and Nedd4
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Adenovirus protein involved in virus internalization recruits ubiquitin- protein ligases
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Cellular glycosaminoglycans and low density lipoprotein receptor are involved in hepatitis C virus adsorption.
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Heparan sulfate-mediated binding of infectious dengue virus type 2 and yellow fever virus
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Halary F, Amara A, Lortat-Jacob H, Messerle M, Delaunay T, Houles C, Fieschi F, Arenzana-Seisdedos F, Moreau JF and Dechanet-Merville J
Human cytomegalovirus binding to DC-SIGN is required for dendritic cell infection and target cell trans-infection
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Lortat Jacob H
Des radicaux oxygénés, des ions potassiums, le cytosquelette, des protéases et des protéoglycanes : un cocktail microbicide bie organisé
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Lortat Jacob H, Grosdidier A and Imberty A
Structural diversity of heparan sulfate binding domains in chemokines
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Reeves EP, Lu H, Lortat Jacob H, Messina CGM, Bolsover S, Gabella G, Potma EO, Warley A, Roes J and Segal AW
Killing activity of neutrophils is mediated through activation of proteases by K+ flux
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Rusnati M, Urbinati C, Tanghetti E, Dell'Era P, Lortat-Jacob H and Presta M
Cell membrane GM1 ganglioside is a functional coreceptor for fibroblast growth factor 2
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Stura EA, Martin L, Lortat-Jacob H, Vives R and Vita C
Heparin-aggregated RANTES can be crystallised
Acta Crystallographica D Biological Crystallography (2002) 58 (Pt 10 Pt 1) : 1670-3

Sweeney EA, Lortat-Jacob H, Priestley GV, Nakamoto B and Papayannopoulou T
Sulfated polysaccharides increase plasma levels of SDF-1 in monkeys and mice : involvement in mobilization of stem/progenitor cells
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Vives RR, Sadir R, Imberty A, Rencurosi A and Lortat-Jacob H
A Kinetics and Modeling Study of RANTES(9-68) Binding to Heparin Reveals a Mechanism of Cooperative Oligomerization
Biochemistry (2002) 41 (50) : 14779-89

Publications 2001

Ben Khalifa M, Choulier L, Lortat-Jacob H, Altschuh D and Vernet T
BIACORE Data Processing : An Evaluation of the Global Fitting Procedure.
Analytical Biochemistry (2001) 293 (2) : 194-203

Lortat Jacob H, Chouin E, Cusack S and van Raaij MJ
Kinetic analysis of adenovirus fiber binding to its receptor reveals an avidity mechanism for trimeric receptor-ligand interactions.
Journal of Biological Chemistry (2001) 276 (12) : 9009-9015

Rusnati M, Urbinati C, Caputo A, Possati L, Lortat-Jacob H, Giacca M, Ribatti D and Presta M
Pentosan polysulfate as an inhibitor of extracellular HIV-1 Tat.
Journal of Biological Chemistry (2001) 276 (25) : 22420-22425

Sadir R, Lambert A, Lortat-Jacob H and Morel G
Caveolae and clathrin-coated vesicles : two possible internalization pathways for IFN-gamma and IFN-gamma receptor.
Cytokine (2001) 14 (1) : 19-26

Sadir R, Baleux F, Grosdidier A, Imberty A and Lortat-Jacob H
Characterization of the stromal cell-derived factor-1alpha-heparin complex.
Journal of Biological Chemistry (2001) 276 (11) : 8288-8296

Publications 2000

Moulard M, Lortat-Jacob H, Mondor I, Roca G, Wyatt R, Sodroski J, Zhao L, Olson W, Kwong PD and Sattentau QJ
Selective interactions of polyanions with basic surfaces on human immunodeficiency virus type 1 gp120.
Journal of Virology (2000) 74 (4) : 1948-1960

Sadir R, Lortat-Jacob H and Morel G
Internalization and nuclear translocation of IFN-gamma and IFN-gammaR : an ultrastructural approach.
Cytokine (2000) 12 (6) : 711-714
Our list of publications from 2000 to 2013 is displayed below.

Membres du groupe

WILD Rebekka — 2022-11-18T10:14:01Z

Personnel permanent
Hugues Lortat-Jacob (DRCE1 CNRS)
Romain Vivès (DR2 CNRS)
Rebekka Wild (CRCN CNRS)
Rabia Sadir (Ingénieur CEA)
Evelyne Gout (IE CNRS)
Sarah Le Hir (Ingénieur CEA)

Personnel contractuel
Sylvain Vallet (Postdoctorant)
Margaux Molinas (Postdoctorante)
Rosa Lorizolla Cordeiro (Postdoctorante)
Poushalee Dutta (Thesarde)
Rebecca-Joe Boustany (Thesarde)
Espérance Aho (Thesarde)
Yara Awas (Thesarde)
Margot Weber (Thesarde)
Clémentine Bouchikri (Thesarde)
Nosylys Gelas (Thesarde)
Thomas Passel (Ingénieur d'études)
Anthony Usclat (Ingénieur d'études)

Membres anciens
Marie Bourgeais (Ingénieure d'études ; 2022-2025)
Mélanie Friedel (Assistante ingénieure ; 2021 - 2024)
Francisco Leisico (Postdoctorant 2021-2023)
Thibault Annaval (Postdoctorant 2019-2021)
Linda Djerbal (Etudiante en thèse ; 2015- 2018)
Yoan Monneau (Post doctorant ; 2017- 2018)
Amal Seffouh (Etudiant en thèse ; 2013 - 2016)
Elodie Henriet (Ingénieur ; 2013 - 2014)
Cédric Laguri (CR1 CNRS ; 2005-2013)
Els Saesen (Etudiant en thèse ; 2009 - 2013)
Bridgette Connell (Etudiante en thèse ; 2008 - 2012)
Mark Nitz (Professeur invité ; Mars 2011 - Juin 2011)
Julia Bartoli (Ingénieur ; 2008 - 2011)
Pascal Fender (CR1 CNRS ; 2004 - 2009)
Stéphane Sarrazin (Etudiant en thèse ; 2003 - 2008)
Elodie Crublet (Etudiante en thèse ; 2003 - 2007)
Sylvie Ricard-Blum (Ingénieur CEA ; 2002 - 2004)

Présentation

WILD Rebekka — 2022-11-18T10:10:58Z

Responsable : Hugues Lortat-Jacob

Nos travaux visent en particulier à :

Identifier les déterminants structuraux mis en jeu dans la formation de complexes entre GAGs et protéines.
Comprendre les mécanismes cellulaires conduisant à l'expression de structures oligosaccharidiques définies.
Decrire les mécanismes par lesquels les GAGs contrôlent l'activité biologique des protéines auxquelles ils s'associent.

Les modèles expérimentaux majoritairement utilisés sont (1) les processus d'attachement et d'entrée des pathogènes, et (2) les mécanismes de défenses immunitaires. La caractérisation de complexes GAGs/protéines virales ou bactériennes et GAGs/cytokines débouchent sur l'ingénierie d'oligosaccharides à visée anti infectieuse ou anti inflammatoire.

Par ailleurs, le laboratoire développe différentes approches méthodologiques pour l'étude des interactions GAG/protéine (puce à sucres ; séquençage à l'interface protéine-glycane ; RMN).

Les structures à haute résolution des enzymes de biosynthèse des GAG et des complexes protéine-GAG sont étudiées par microscopie cryo-électronique à particule unique et cristallographie aux rayons X.