IBS - Institut de Biologie Structurale - Grenoble / France

Présentation du groupe

THEPAUT Michel — 2022-11-16T08:44:15Z

Responsable du groupe : Franck FIESCHI

Composition du groupe :
– Équipe Membrane et Immunité (F. Fieschi)
– Structure et Stabilité des Protéines Membranaires Intégrales et des Assemblages de Phages (C. Breyton)

Thèmes de recherche :
– Complexe de la NADPH oxydase des neutrophiles.
– Récepteur lectine de type C des cellules dendritiques.
– Mécanisme de l'infection phagique.
– Nouveaux surfactants pour les études in vitro des protéines membranaires.
– Étude structurale de protéines membranaires liées à la virulence et la pathogénicité.

Techniques utilisées :
– Biochimie des protéines membranaires et solubles.
– Renaturation de protéines.
– Purification automatisée de protéines.
– Interactions moléculaires (SPR, BLI, ITC).
– Fluorescence.
– Ultracentrifugation analytique.
– Chromatographie d'exclusion/diffusion de la lumière.
– Diffusion aux petits angles des rayons-X et des neutrons.
– Cristallographie.
– Résonnance Magnétique Nucléaire
– Cryo-Microscopie Électronique.
– NanoDSF.

Services disponibles :
– Centre de Diagnostique Clinique CHU Grenoble Alpes :
Centre de Diagnostic de la Granulomatose Septique (CDiReC).

– Platformes ISBG :
Ultracentrifugation analytique (plateforme AUC).
SECMALLS (plateforme PAOL).

– Instrument IBS :
Système Multi-étapes de Purification de Protéines (MP3).
Prometheus (NanoDSF).

Publications

2022-10-20T13:57:40Z

Sommaire

Publications depuis 2014

La liste des publications du groupe Membrane et pathogènes, parues dans des revues à comité de lecture depuis 2014, ainsi que les ouvrages et chapitres d'ouvrage, est consultable ci-dessous (données issues de HAL-IBS).
L'affichage peut prendre quelques secondes. Pour consulter les diverses années, utiliser la barre de défilement intérieure.

Publications jusqu'à 2013

La liste des publications du groupe de 2000 à 2013 est visible ci-dessous (données saisies de façon manuelle).
Liste à venir

Thèses

2022-10-20T13:57:38Z

Sommaire

Toutes nos thèses

La liste des thèses soutenues dans le groupe Membrane et Pathogènes depuis sa création est disponible année par année ci-dessous.

2024

Massilia Abbas
Etude de la reconnaissance du LPS par les récepteurs immunitaires Lectines de type C dans un environnement imitant la surface cellulaire.
Thèse de doctorat de l'Université Grenoble Alpes, soutenue le 09 septembre 2024

Perrine Rochas
Développement d'une thérapie à base de protéoliposomes pour lutter contre les infections pulmonaires aiguës - application à la maladie granulomatose septique chronique.
Thèse de doctorat de l'Université Grenoble Alpes, soutenue le 23 octobre 2024

2023

Clara Delaunay
Caractérisations du rôle des récepteurs lectines de type-C dans la reconnaissance de la protéine Spike du virus SARS-CoV-2 et développements glycomimétiques antagonistes de l'infection.
Thèse de doctorat de l'Université Grenoble Alpes, soutenue le 09 novembre 2023

2022

Séraphine Degroux
Etude fonctionelle et structurale de la protéine d'immunité Llp du phage T5.
Thèse de doctorat de l'Université Grenoble Alpes, soutenue le 29 novembre 2022

2020

Waqas Javed
Etude des états conformationnels d'un transporteur ABC bactérien de drogues multiples, BmrA/Study of the conformational states of a bacterial multidrug ABC transporter BmrA
Thèse de doctorat de la Communauté Université Grenoble Alpes, soutenue le 17 décembre 2020

François Bulteau
Ciblage in vivo des tumeurs via l'antigène Tn : Développement d'un cluster de Macrophage Galactose Lectine
Thèse de doctorat de la Communauté Université Grenoble Alpes, soutenue le 10 décembre 2020

Annelise Vermot
Etude structurale et fonctionnelle de SpNox, une NADPH oxydase bactérienne
Thèse de doctorat de la Communauté Université Grenoble Alpes, soutenue le 31 janvier 2020

2018

Silvia Achilli
Recombinant C-type Lectin Receptors production and selective ligand identification : new tools towards immune system tailoring
Thèse de doctorat de l'Université de Grenoble, soutenue le 26 juin 2018

2017

Charles-Adrien Arnaud
Structure de la queue du phage T5 et mécanisme de perforation de l'enveloppe bactérienne par les Siphoviridae
Thèse de doctorat de l'Université de Grenoble, soutenue le 19 octobre 2017

2016

Porkolab Vanessa

Développement de ligands multivalents de type glycomimétiques dirigés contre les récepteurs-lectines de type-C. Thèse de doctorat de l'Université de Grenoble, soutenue le 11 Octobre 2016.

2014

Hajjar Christine

Étude fonctionnelle du cœur catalytique membranaire d'enzymes de la famille NOX : Identification de la première NADPH oxydase procaryote. Thèse de doctorat de l'Université de Grenoble, soutenue le 21 Novembre 2014.

2012

Sutkeviciute Ieva
Development of the glycomimetic antagonists of the C-type lectin receptor DC-SIGN : a new strategy of HIV infection prevention. Thèse de doctorat de l'Université Joseph Fourier, Grenoble I, soutenue le 14 décembre 2012.

Chabrol Eric
Caractérisation fonctionnelle et structurale d'une lectine de type-C des cellules de Langerhans : la Langérine. Thèse de doctorat de l'Universié Joseph Fourier, Geenoble 1, soutenue le 29 mai 2012.

Flayhan Ali
Reconnaissance phage-bactérie dans le système phage T5-E.coli. Caractérisation biochimique et structurale du complexe FhuA-pb5 et de la protéine caudale pb9. Thèse de doctorat de l'Université Joseph Fourier, soutenue le 05 juin 2012.

Mehmood Shahid
Structural characterization of membrane proteins by hydrogen/deuterium exchange mass spectrometry. Thèse de doctorat de l'Université Joseph Fourier, soutenue le 28 février 2012.

Nguyễn Hiển Anh
Découverte d'une nouvelle famille de protéines kinases bactériennes : Mécanisme de fontionnement et rôle cellulaire de YdiB, un représentant chez B. subtilis. Thèse de doctorat de l'Université Joseph Fourier, Grenoble 1, soutenue le 23 mai 2012.

Siauciunaite Lina
Exploring new approaches for GPCR studies at the molecular level : application to chemokine receptors. Thèse de doctorat de l'Université Joseph fourier, Grenoble 1, soutenue le 15 mai 2012.

2010

Marcoux Julien.
Analyse structurale et fonctionnelle de la NADPH oxydase des neutrophiles : utilisation de la spectrométrie de masse pour caractériser les changements conformationnels de p47^phox lors de son activation. Thèse de doctorat de l'Université Joseph Fourier, Grenoble I, soutenue le 25 mars 2010.

2008

Galian Barrenco Carmen.
Caractérisation de 2 transporteurs ABC (“ATP-Binding Cassette”) bactériens de fonction inconnue : YheI/YheH de Bacillus subtilis et Rv1747 de Mycobacterium tuberculosis. Thèse de doctorat de l'Université Joseph Fourier, Grenoble I, soutenue le 19 décembre 2008.

Tabarani Georges.
DC-SIGN, un récepteur détourné par de nombreux pathogènes : caractérisation biochimique et structurale et développement d'inhibiteurs. Thèse de doctorat de l'Université Joseph Fourier, Grenoble I, soutenue le 04 septembre 2008.

2007

Karst Johanna.
Caractérisation d'une protéine de fonction inconnue, YdiB de Bacillus subtilis, membre d'une nouvelle famille d'ATPases exclusivement bactériennes. Thèse de doctorat de l'Université Joseph Fourier, Grenoble I, soutenue le 17 octobre 2007.

2005

Chenavas Sylvie.
Etude des interactions entre les facteurs cytosoliques du complexe de la NADPH Oxydase. Thèse de doctorat de l'Université Joseph Fourier, Grenoble I, soutenue le 10 février 2005.

2002

Massenet Claire
Étude des interactions entre les facteurs cytosoliques p40^phox et p47^phox du complexe de la NADPH oxydase. Thèse de doctorat de l'Université Joseph Fourier, Grenoble I, soutenue le 11 décembre 2002.

2001

Costenaro Lionel
Interactions faibles protéine-protéine en solution : la malate déshydrogénase halophile. Thèse de doctorat de l'Université Joseph Fourier, Grenoble I, soutenue le 05 octobre 2001.

Accéder au texte intégral de nos thèses

Merci de noter que seuls les PDF des thèses qui ne sont pas sous embargo ou sous une obligation contractuelle particulière et pour lesquelles les auteurs ont autorisé la publication figurent dans cette liste détaillée éditée par HAL.
Les thèses des 12 derniers mois ne sont pas encore toutes disponibles sur ce site. Par ailleurs les thèses antérieures à 2010 n'y figurent pas de façon exhaustive.
L'affichage peut prendre quelques secondes. Pour consulter les diverses années, utiliser la barre de défilement intérieure.

Système Multi-étapes de Purification de Protéines

THEPAUT Michel — 2022-10-20T09:32:21Z

Le Système Multi-étapes de Purification de Protéines est basé sur 4 appareils de type Aktä Xpress, permettant le développement et l'automatisation de la purification de protéines.

Mode d'accès

L'accès au Système Multi-étapes de Purification de Protéines est possible en contactant Michel Thépaut.

Prometheus

THEPAUT Michel — 2022-10-20T09:27:32Z

Le Prometheus NT.48 (Nanotemper) permet la stabilité thermique et chimique des protéines en déterminant le point de dénaturation thermique (Tm) et la température d'agrégation de la protéine. C'est fait en suivant les changements de fluorescence intrinsèque des Trp (par fluorimétrie différentielle à balayage : DSF) et par détection de la diffusion de lumière.

Il permet de cribler jusqu'à 48 conditions in parallèle, utilisant 12µL d'échantillon par capillaire avec une concentration entre 5 µg/mL et 250 mg/mL (l'optimum est autour du mg/mL). Une expérience classique dure environ 1h30.

Mode d'accès

L'accès au Prometheus est ouvert aux membres du PSB , les capillaires doivent être achetés par l'utilisateur.

Avant sa première utilisation, chaque nouvel utilisateur doit être formé à l'utilisation de l'appareil par Michel Thépaut. Toutes les expériences et analyses doivent être faites par les utilisateurs.

Plateforme Protein Analysis On Line

THEPAUT Michel — 2022-10-20T09:06:27Z

La plateforme est accessible depuis le site internet de l'ISBG.

Plateforme d'Ultracentrifugation Analytique

THEPAUT Michel — 2022-10-20T09:06:25Z

La plateforme est accessible depuis le site internet de l'ISBG.

Membres

THEPAUT Michel — 2022-10-20T08:55:58Z

De gauche à droite : Alessio Dacapito, Séraphine Degroux, Aline Le Roy, Cécile Beyton, Christine Ebel, Claudine Darnault, Romain Linarès (absent).

Membres de l'équipe

THEPAUT Michel — 2022-10-20T08:55:03Z

De gauche à droite : Perrine Rochas, Clara Delaunay, Marie-josé Stasia, Franck Fieschi, Michel Thépaut, Isabelle Petit-Hartlien.

Membres du groupe

THEPAUT Michel — 2022-10-20T07:43:53Z

Sommaire

A gauche, de devant à derrière : Cédric Laguri, Michel Thépaut, Isabelle Petit-Hartlien, Christine Ebel, Alessio Dacapito, Estelle Marchal, Perrine Rochas, Clara Delaunay. A droite, de derrière à devant : Claudine Darnault, Aline Le Roy, Marie-José Stasia, Cécile Breyton, Alice Decombe, Massilia Abbas, Maria Val-Pevida, Franck Fieschi

Alumni

(L1, L2, L3 and M1 students are not mentionned)
Clémentine Bouchikri (M2, 2025)
Rubén Perez-Bucio (M2, 2025)
Estelle Marchal (CDD, 2023-2024, ANR ProMeNix)
Andromachi Papagianoula (M2, 2022)
Poushalee Dutta (M2, 2022)
Clara Delaunay (PhD 2020-2023, Ecole doctorale UGA)
Séraphine Degroux (M2 – PhD, 2018-2022, UGA)
Eugénie Laigre (Post Doc, 2020-2022, ANR Lect Array)
Swetha Stanley (M2, 2020)
Quentin Durieux (M2, 2020)
Yasmina Grimoire (CDD IE, 2019-2021, ANR Lect Array)
Ilham Bouchemal (CDD, 2018-2020, ANR Fluor)
François Bulteau (PhD 2017-2020, GlycoALps - Idex UGA)
Nathan Epalle (M2, 2019)
Romain Linares (Post-doc, 2017-2022, ANR PerfoBac, ANR ImmunoPhage)
Annelise Vermot (PhD 2016-2020, Program Emergence - UGA)
Waqas Javed (PhD, 2016-2020)
Silvia Achilli (PhD 2015- 2018, ITN Marie curie "Immunoshape" - Horizon 2020)
Charles Arnaud (M2 – PhD, 2014-2017, Labex Gral)
Pascal Gabard (CDD, 2013-2015, Coll. Industriel)
Alice Tissot (M2, 2013)
Flavien Grégoire (M2, 2013)
Kai Wang (M2, 2013)
Vanessa Porkolab (M2-PhD, 2012-2016, Region Rhône-Alpes)
Cindy Pereira (M2, 2012)
Christine Hajjar (PhD 2011-2014, Ecole doctorale UGA)
Ziad Ibrahim (M2, 2011)
Antoine Picchiocci (Post doc 2009-2013)
Mathilde Lethier (CDD, 2010-201, )
Ieva Sutkeviciute (PhD 2009-2012 ; ITN Marie curie "Carmusys" - 7ème PCRD)
Lina Siauciunate (PhD 2009-2012, ITN SBMP - 7ème PCRD)
Sarah Saab (M2, 2009)
Ali Flayhan (M2 – PhD, 2008-2012, ITN SBMP)
Eric Chabrol (M2 - PhD, 2007-2012, Ecole doctorale UGA)
Nathalie Hauet (Post-doc, 2008-2010, ANR PCV-Fluorinated surfactants)
Julien Marcoux (PhD, 2006-2010, CFR CEA)
Georges Tabarani (PhD, 2004-2008, CFR CEA)
Sylvie Chenavas (PhD, 2001-2005, UGA)
Corinne Houlès (Post Doc, 2001-2003, Sidaction)
Corinne Vivès (2000-2021, Post Doc and IR CEA)
Claire Massenet (PhD 1998-2002, UGA)

Anciennes photos de groupe

March 2026

Janv 2025

Sept 2023

Sept 2022

Nov 2022

Sept 2019

Jan 2019

2018

May 2016

Jan 2016

July 2014

2011