IBS - Institut de Biologie Structurale - Grenoble / France

16/12/2024 : Virus de la grippe : son génome enfin découvert de son manteau

2024-12-17T13:00:06Z

Pour combattre le virus à l'origine de la grippe, une des pistes envisagées par les scientifiques est de développer des médicaments capables de déstabiliser son génome, composé de huit molécules d'ARN.

Un premier article publié en 2023 avait permis de proposer un premier modèle d'encapsidation du génome du virus de la grippe.

Dans une nouvelle publication parue dans la revue Nucleic Acids Research le 16 décembre 2024, les mêmes scientifiques ont maintenant obtenu une structure à haute résolution de la nucléoprotéine grippale en hélice antiparallèle, permettant de détailler l'ensemble des interactions protéine-protéine et protéine-ARN au sein d'une nucléocapside.

Ce résultat a fait l'objet d'une information presse du CNRS.

Influenza A virus antiparallel helical nucleocapsid-like pseudo-atomic structure. Florian Chenavier, Eleftherios Zarkadas, Lily-Lorette Freslon, Alice J. Stelfox, Guy Schoehn, Rob W.H. Ruigrok, Allison Ballandras-Colas, Thibaut Crépin. Nucleic Acids Research 2024 Dec 14:gkae1211. doi : 10.1093/nar/gkae1211.

Contact : Thibaut Crepin, Directeur de recherche CNRS dans le groupe Machines de Réplication Virale (IBS/VRM)

08/11/2024 : Inauguration d'un cryo-microscope électronique de dernière génération

2024-11-13T07:05:10Z

Titan Krios G4

Financé dans le cadre de l'initiative nationale « Equipex+ France Cryo-EM » du Programme d'Investissement d'Avenir 3 (PIA3), ce cryo-microscope électronique Titan Krios est spécialement conçu pour la cryo-microscopie électronique (Cryo-EM) en biologie. Localisé à l'ESRF, il est mis à la disposition de la communauté scientifique française et européenne et co-géré par l'IBS et l'ISBG.

Grâce à ses performances exceptionnelles, le Titan Krios G4 constitue une avancée technologique majeure pour la recherche en biologie structurale. Il permettra de résoudre les structures de complexes macromoléculaires biologiques à l'échelle atomique et ouvrira de nouvelles perspectives pour le développement de thérapies médicales, ainsi que pour la compréhension des mécanismes biologiques fondamentaux.

Pour plus de détails sur le cryo-microscope et son inauguration, consultez le communiqué de presse.

15/04/2024 : Signature d'un accord exclusif de collaboration et d'option de licence pour des anticorps monoclonaux puissants ciblant le virus BK, fruits d'une collaboration entre l'IBS et l'Institut de Virologie de Strasbourg

2024-04-23T13:14:56Z

SpikImm, société de biotechnologie au stade clinique dédiée au développement d'anticorps monoclonaux pour prévenir les infections virales chez les patients immunodéprimés, annonce la signature avec la SATT Conectus d'un accord exclusif de collaboration et d'option de licence pour des anticorps monoclonaux puissants ciblant le virus BK.

Ces anticorps monoclonaux ont été développés dans le cadre du projet HuMABK mené par le Pr. Pascal POIGNARD, Responsable de l'équipe de recherche "Anticorps et Maladies Infectieuses" à l'Institut de Biologie Structurale et le Pr. Samira FAFI-KREMER, Directrice de l'Institut de Virologie de Strasbourg.

Pour plus de détails, consultez le communiqué de presse.

03/02/2023 - Deux protéines s'unissent pour faire des fleurs

2023-02-03T08:59:00Z

Quels mécanismes se cachent derrière l'apparition des fleurs ? Pour y répondre, une énigme de 25 ans vient d'être résolue : le rôle de la protéine UFO dans ce processus de formation.

Alors que sa nature laissait supposer que la protéine UFO détruisait ses partenaires, cette protéine est en réalité une aide à la naissance d'une fleur lorsqu'elle est couplée à la protéine LEAFY. C'est ce que révèle des chercheurs de plusieurs instituts grenoblois*, incluant l'IBS, dans une nouvelle étude parue dans Nature Plants. Les scientifiques du LPCV, porteurs du projet, savaient déjà que LEAFY, en se fixant à des régions précises des chromosomes, activait les gènes responsables de la formation des bourgeons floraux. Ils savaient également que LEAFY n'agit pas seule, mais avec l'aide de la protéine UFO. Par ces nouveaux travaux, les scientifiques révèlent désormais que le rôle d'UFO est de permettre à LEAFY d'accéder à des nouvelles régions des chromosomes, auxquelles aucune des deux protéines n'accède toute seule. Ainsi couplées, elles peuvent activer des gènes essentiels à la formation des bourgeons, des pétales ou des étamines. Pour parvenir à ces résultats, les scientifiques ont combiné des expériences de génétique végétale, des analyses bio-informatiques. Le complexe impliqué dans ce processus a pu être visualisé, puis sa structure tridimensionnelle obtenue, grâce à l'utilisation du cryo-microscopie électronique le plus moderne de la plateforme de microscopie électronique de l'IBS/ISBG : le microscope Glacios. Cela a permis d'obtenir une structure tridimensionnelle de ce complexe de moins de 150 kDa à environ 4 Å de résolution et de visualiser non seulement les interactions entre ces deux protéines mais également avec l'ADN. Comment le couple LEAFY-UFO agit de façon différente chez le pétunia, le gerbera, le riz ou la gueule de loup reste à découvrir.

Ce résultat a fait l'objet d'une information presse du CNRS.

The F-box protein UFO controls flower development by redirecting the master transcription factor LEAFY to new cis-elements. Rieu P, Turchi L, Thévenon E, Zarkadas E, Nanao M, Chahtane H, Tichtinsky G, Lucas J, Blanc-Mathieu R, Zubieta C, Schoehn G, Parcy F. Nature Plants, 2023, https://doi.org/10.1038/s41477-022-01336-2.

*Collaboration : Ces recherches ont impliqué des scientifiques du Laboratoire de Physiologie Cellulaire & Végétale, du Laboratoire translational innovation in medicine and complexity, l'Institut de Biologie Structurale (groupe Microscopie Electronique et Méthodes), Integrated Structural Biology Grenoble.

Contacts pour l'imagerie des protéines par cryo-microscopie électronique : Guy Schoehn, chercheur CNRS de l'IBS (Groupe Microscopie Electronique et Méthodes) & Eleftherios Zarkadas (ISBG)

05/01/2023 - Un nouveau mécanisme d'activation d'un promédicament

2023-01-05T08:31:00Z

Les promédicaments ont peu ou pas d'activité pharmacologique et nécessitent des modifications pour devenir actifs. La plupart des promédicaments contiennent un groupe chimique qui est éliminé ou modifié par les enzymes de l'organisme pour conduire au médicament actif, bien que quelques-uns peuvent être intentionnellement activés par des radiations, des stimuli électriques ou des ultrasons. Cependant, jusqu'à ce jour, des promédicaments capables d'auto-activation sans enzymes ni intervention humaine, restent inconnus.
Les chercheurs de l'IBS (Groupe Flexbilité et Dynamique des Proteines) en collaboration avec des chercheurs de l'IAB (Groupe Palencia), de l'EMBL (Groupe Cusack) et de l'ENS Lyon (Groupe Salmon) ont découvert un mécanisme d'activation de promédicaments indépendant des enzymes. Ils ont étudié des composés à base de bore (benzoxaboroles) ciblant la leucyl-ARNt synthétase (LeuRS), dont notamment un antibiotique actuellement testé pour le traitement de la tuberculose. Les chercheurs ont découvert que ces benzoxaboroles ne se lient pas directement à leur cible LeuRS mais se transforment tout d'abord en réagissant spontanément avec des biomolécules à base d'adénosine (e.g. ATP). La cristallographie aux rayons X et la spectroscopie par résonance magnétique nucléaire montrent que ces composés forment un cycle avec l'adénosine ribose à des concentrations physiologiques, pouvant se lier puissamment à la cible LeuRS de Mycobacterium tuberculosis.
Ce mécanisme d'activation des promédicaments représente un nouveau concept pour la chimie des molécules thérapeutiques qui pourrait être appliqué pour améliorer la solubilité, la perméabilité et la stabilité métabolique d'autres médicaments difficiles à concevoir.
Information presse

Adenosine-Dependent Activation Mechanism of Prodrugs Targeting an Aminoacyl-tRNA Synthetase. Hoffmann G, Le Gorrec M, Mestdach E, Cusack S, Salmon L, Jensen MR*, Palencia A*. J .Am. Chem. Soc. (2023)
doi : 10.1021/jacs.2c04808

Contact : Malene R. Jensen, chercheuse CNRS de l'IBS (groupe Groupe Flexibilité et Dynamique des Protéines par RMN)

19/01/2022 - Description d'une interaction essentielle entre deux protéines du SARS-CoV-2

2022-09-21T11:33:36Z

Alors que les vaccins ciblent les mécanismes moléculaires responsables de l'entrée du SARS-Cov-2 dans la cellule via la protéine Spike, il est tout aussi important de cibler la machinerie de réplication virale chez les patients déjà infectés par le virus. Des chercheurs de l'IBS (Groupe Flexibilité et Dynamique des Protéines par RMN) ont focalisé leur attention sur la nucléoprotéine (N), la protéine la plus abondante du virus, qui protège le génome du virus contre le système immunitaire de la cellule infectée. Ils ont utilisé la spectroscopie RMN pour déterminer la structure et la dynamique de (N), et décrit pour la première fois son interaction avec la protéine virale nsp3a. Leur étude permet de mieux comprendre le mécanisme de réplication du virus et ouvre la voie au développement de nouvelles stratégies contre la Covid-19. Communiqué de presse.

12/05/2021 - SARS-CoV-2 : un nouveau mode de transmission du virus qui implique les cellules immunitaires

2021-05-12T11:15:00Z

Des scientifiques du CNRS, du CEA et de l'Université Grenoble Alpes confirment dans PLOS Pathogens, que le virus de la Covid peut utiliser des cellules immunitaires pour augmenter sa transmission à d'autres cellules. Les chercheurs ont également montré qu'il est possible d'inhiber ce nouveau mode de transmission du virus par l'utilisation de glycomimétiques, précédemment développés. Ce travail est le résultat d'une collaboration internationale avec des équipes espagnoles (Hospital Universitario 12 de Octubre, Madrid) et italiennes (Universita degli Studi di Milano). Communiqué de presse

09/04/2021 - Chimie verte et biocarburant : le fonctionnement d'une photoenzyme clef décrypté

2021-04-09T11:17:00Z

Le fonctionnement de l'enzyme FAP, utile pour produire des biocarburants et de la chimie verte, a été décrypté. Ce résultat, publié dans Science, a mobilisé une équipe internationale de scientifiques, dont de nombreux chercheurs français du CEA, du CNRS, de l'Inserm, de l'École Polytechnique, des universités de Grenoble Alpes, Paris-Saclay et Aix-Marseille, ainsi que du Synchrotron Européen et du Synchrotron SOLEIL. Communiqué de presse

01/03/2019 - Les secrets intimes de la photosymbiose dans le plancton marin

2019-03-01T12:36:00Z

Grâce à une combinaison de techniques d'imagerie notamment développées à Grenoble, des chercheurs du LPCV, en collaboration notamment avec l'IBS, le Centre Helmhotz et l'ESRF, viennent de montrer que l'organisation structurelle, la physiologie et l'état trophique des microalgues (les haptophytes Phaeocystis) changent considérablement lorsqu´elles sont en symbiose dans un hôte (acanthaires), par rapport à leur état libre en culture. La plateforme de microscopie électronique de l'IBS-ISBG a été impliquée dans la préparation des échantillons de plancton et de cultures de microalgues pour l'imagerie en microscopie électronique et imagerie chimique. Ces résultats, publiés dans Current Biology, apportent un éclairage sur le fonctionnement de la photosymbiose et sur les mécanismes subcellulaires impliqués. Communiqué de presse

06/12/2018 - La cible majeure du VIH étudiée sous toutes ses coutures

2018-12-06T08:41:00Z

En étudiant de près CCR5, une des portes d'entrée du VIH dans les cellules, des chercheurs de l'IBS, en collaboration avec des chercheurs de l'Inserm, de l'Institut Pasteur, des universités Paris Diderot et Toulouse III–Paul Sabatier, du CHU de Toulouse et de l'Instituto de Salud Carlos III de Madrid, démontrent que sa morphologie détermine la propension du virus à infecter l'organisme. Ce travail soutenu par l'ANRS et publié dans la revue Plos Pathogens est un nouveau pas vers la compréhension du rôle de CCR5 dans l'infection VIH et en tant que cible pour bloquer l'entrée du virus dans les cellules. Information presse

CCR5 structural plasticity shapes HIV-1 phenotypic properties. Colin P, Zhou Z, Staropoli I, Garcia-Perez J, Gasser R, Armani-Tourret M, Benureau Y, Gonzalez N, Jin J, Connell BJ, Raymond S, Delobel P, Izopet J, Lortat-Jacob H, Alcami J, Arenzana-Seisdedos F, Brelot A, Lagane B. PLoS Pathog. 2018 Dec 6 ;14(12):e1007432. doi : 10.1371/journal.ppat.1007432. eCollection 2018 Dec.

Contact : Hugues Lortat-Jacob, chercheur CNRS de l'IBS (Groupe Structure et Activité des Glycosaminoglycanes)