Le TMV et les dommages dus à la radiation SAXS

2018-08-23T08:54:11Z

Qualification des dommages radiatifs liés aux expériences SAXS sur des particules de virus

L'image représente du TMV déposé sur du graphique (ligne du haut) ou sur du mica pré-traité au NiCl2 (ligne du bas). La colonne de gauche montre du TMV natif alors que la colonne du milieu montre du TMV après une irradiation de 10 sec (temps d'exposition standard en SAXS) et la colonne de droite montre le TMV après 30 min d'irradiation. Alors que la dégradation après 30 min est clairement visible, on note également une dégradation des particules virales après seulement une exposition de 10 sec. Les images AFM ont été réalisées par Alexander Andriatis sous la supervision de Luca Costa et avec l'aide de Martha Brennich pour l'acquisition des données SAXS.

L'étude des dommages radiatifs a également été suivie sur un enzyme globulaire : la β-amylase.

Costa L, Andriatis A, Brennich M, Teulon J-M, Chen SWW, Pellequer J-L and Round A (2016) Combined small angle X-ray solution scattering with atomic force microscopy for characterizing radiation damage on biological macromolecules. BMC Struct. Biol. 16 : 18.

Imagerie AFM du TMV

PELLEQUER Jean-Luc — 2018-08-23T08:18:05Z

Peut-on estimer la perturbation des molécules imagées par une pointe AFM ?

Représentation schématique d'une coupe transversale d'un TMV. La diffraction par rayons X indique que le TMV a un diamètre de 19 nm. En variant les supports de dépôt du TMV (mica à gauche et monocouche auto-assemblée à droite) ainsi que les paramètres d'imagerie par AFM (Liq pour liquide, PFT pour PeakForce Tapping, TAP pour Tapping), on note des changements notables de la hauteur (diamètre) du TMV. On montre ainsi que le support a une part prépondérante dans la variation de hauteur. Cette étude montre aussi qu'il est tout à fait possible d'imager des particules de virus à l'air, à condition d'utiliser un mode d'imagerie "doux" et de déposer le virus sur un tapis de type mono-couche. Les mesures AFM ont été effectuées durant plusieurs années par Christian Godon, Jean-Marie Teulon, et Michael Odorico. La purification du TMV a été réalisée par Christian Basset. Les surfaces SAM ont été réalisées par Matthieu Meillan sous la supervision de Luc Vellutini. Le traitement analytique des images et le calcul des hauteurs ont été développés par Wendy Chen.

Godon C, Teulon J-M, Odorico M, Basset C, Meillan M, Vellutini L, Chen S-wW and Pellequer J-L (2017) Conditions to minimize soft single biomolecule deformation when imaging with atomic force microscopy. J. Struct. Biol. 197 : 322-329.

IBS - Institut de Biologie Structurale - Grenoble / France

Le TMV et les dommages dus à la radiation SAXS

Imagerie AFM du TMV