IBS - Institut de Biologie Structurale - Grenoble / France

Chercheur/se en biophysique (CDD 12 mois - groupe FDP)

2026-06-08T15:45:16Z

L'IBS recrute une chercheuse ou un chercheur en biophysique au sein du groupe FDP, pour une durée initiale de 12 mois.

L'étude menée par le/la chercheur/se visera à comprendre le comportement des protéines à l'intérieur et à la surface des condensats biomoléculaires.

Missions :
1. Réalisation de travaux de recherche, de la mise en place de l'expérience à la rédaction des résultats :
Au moins deux des activités suivantes :
– Développement de méthodes smFRET innovantes pour mesurer la dynamique des protéines à la surface des condensats biomoléculaires.
– Analyse des données smFRET pour étudier la conformation et la dynamique des protéines désordonnées dans les condensats.
– Expression, purification et marquage de protéines intrinsèquement désordonnées.
– Développer des mesures électrophysiologiques pour mesurer la tension au sein des condensats biomoléculaires.

2. Participer à la vie du laboratoire :
– Participer à la vie du groupe de recherche (logistique, gestion des stocks de réactifs, rangement, etc.)
– Aider à l'encadrement des stagiaires
– Participer aux événements scientifiques de l'Institut

Profil du candidat :
– Expérience souhaitée : 1 à 4 ans
– Une expertise dans les méthodes de l'échelle de la molécule unique est un atout.
– Une expertise dans l'utilisation de microscopes optiques sur mesure est un atout.
– Une expertise en analyse de données et en programmation est fortement appréciée.
– Une expertise dans l'expression, la purification et le marquage des protéines est un atout.
– Connaissance d'autres méthodes biophysiques pour la caractérisation des protéines.

Date limite de candidature : 26 juin 2026
Date de prise de fonction souhaitée : 1er novembre 2026

En savoir plus et postuler

Activation et modulation du complément par le cœur Fc d'IgM

2026-05-12T15:02:13Z

Les immunoglobulines M (IgM) sont des anticorps oligomériques constituant la première ligne de défense immunitaire et assurant le lien entre reconnaissance antigénique et activation de l'inflammation. Dans leur forme entière, l'activation du complément via la fixation de la molécule initiatrice C1q requiert la liaison préalable à l'antigène par les domaines Fab. En revanche, la contribution de leur cœur, le fragment constant (Fc) restait peu défini.

Dans une étude publiée dans FEBS Journal, des chercheurs de l'IBS ont évalué la capacité du cœur Fc d'IgM à interagir avec C1q et à moduler son activité. Des constructions recombinantes oligomériques mimant l'organisation native ont été produites, et leur caractérisation biophysique (plateformes ISBG) a permis d'isoler les assemblages homogènes de pentamères et hexamères. Les analyses fonctionnelles par BLI et ELISA ont montré une activation inattendue du complément in vitro via l'interaction avec C1q. Cependant, en conditions proches du contexte cellulaire, ces fragments n'induisent pas de cytotoxicité du complément et exercent un effet inhibiteur sur la lyse cellulaire médiée par les anticorps, compatible avec un mécanisme de compétition pour C1q en solution.

Ces résultats révèlent un rôle dual du cœur IgM, activateur ou modulateur selon le contexte moléculaire, et ouvrent des perspectives pour développer des biomolécules antivirale ou antibactérienne, ou dans la lutte contre des pathologies auto-immunes ou cancéreuses impliquant le complément.

The Fc fragment of IgMs binds C1q to activate the first step of the classical complement pathway, while inhibiting complement-dependent cytotoxicity. Pinto AJ, Chouquet A, Bally I, Rossi V, Thielens NM, Dumestre-Perard C, Kunert R, Gaboriaud C, Ling WL, Reiser JB. FEBS J. (2025) http://doi.org/10.1111/febs.70309

Contact : Jean-Baptiste Reiser, chercheur CNRS du Groupe Complement, anticorps et maladies infectieuses de l'IBS (IBS/CAID)

Facteurs de virulence bactérienne comme cibles prometteuses pour les anticorps monoclonaux humains

2026-04-10T13:57:14Z

Les superbactéries (superbugs) sont des micro-organismes résistants aux antibiotiques et responsables d'environ 700 000 décès par an, atteignant potentiellement 10 millions par an en 2050. Pseudomonas aeruginosa est un pathogène majeur des infections nosocomiales, souvent multirésistant, et particulièrement dangereux pour les patients sous ventilation mécanique. Il provoque aussi des infections pulmonaires chez les patients atteints de mucoviscidose. L'Organisation Mondiale de la Santé considère que les souches résistantes aux carbapénèmes sont hautement prioritaires pour la recherche de nouvelles thérapies.

En raison de son rôle clé dans les infections, le Système de Sécrétion de Type 3 (SST3) représente une cible thérapeutique majeure de P. aeruginosa. En particulier, cibler la protéine qui forme la pointe de l'injectisome, PcrV, peut bloquer le SST3 et réduire la virulence dans des modèles in vitro et in vivo.

Trois groupes de l'IBS (PatBac, PB&RC et CAID) ont réuni leurs efforts pour explorer le répertoire en anticorps humain (humAb) de patients du CHU de Grenoble atteints de mucoviscidose et infectés de manière chronique par P. aeruginosa. L'objectif de ce projet soutenu par l'ANR est de générer des humAb capable de bloquer la pathogénicité de cette bactérie, en se basant sur le tri par FACS des cellules B mémoires. Suite au criblage, production des humAb recombinants et caractérisation, deux humAb reconnaissant PcrV et bloquant l'injection de toxines dans les cellules hôtes ont été identifiés.

En combinant des approches de microbiologie cellulaire, génétique, immunologie et biologie structurale, le consortium a découvert que les humAb bloquant l'action du SST3, issus de cette étude ou de travaux d'autres laboratoires, agissent suivant trois mécanismes distincts. Ceci permet d'alimenter les stratégies visant à développer de nouvelles thérapies efficaces dans le contexte de l'antibiorésistance.

Neutralizing human monoclonal antibodies that target the PcrV component of the type III secretion system of Pseudomonas aeruginosa act through distinct mechanism. Desveaux JM, Faudry E, Carlos Contreras-Martel C, Cretin F, Dergan-Dylon LS, Amen A, Bally I, Tardivy-Casemajor V, Chenavier F, Fouquenet D, Caspar Y, Attree I*, Dessen A*, Poignard P*. Elife 2026, 14:RP105195. doi : 10.7554/eLife.105195.
*co-corresponding

Contacts :

Ina Attree (IBS/Groupe Pathogenèse bactérienne et Réponses Cellulaires)
Pascal Poignard (IBS/Groupe Complement, anticorps et maladies infectieuses)

A la découverte des métiers de la Recherche en visioconférence

2026-03-25T14:40:29Z

Nos scientifiques ont à coeur de partager la passion qui les anime avec les lycées de la région qui n'ont pas la possibilité de venir à Grenoble participer à des ateliers dans nos labos. Ils souhaitent donc aider les lycéens dans leur orientation en échangeant avec eux autour des carrières scientifiques dans la recherche.
A travers leur parcours et leurs recherches, vous découvrirez notamment comment l'on devient chercheur (mais également d'autres métiers de la recherche), comment nos scientifiques communiquent sur leurs résultats, et les valorisent. Ils répondront bien sûr aux questions des élèves.

Lieu : Cette intervention se déroulera en visioconférence (un créneau de test sera proposé à l'enseignant avant le jour J).

Durée : 1h

Public : classes de lycée

Thèmes abordés : Biologie, Chimie, Médecine, Physique

Dates : 4 créneaux seront proposés entre vendredi 3 et lundi 13 octobre 2025. Plusieurs classes pourront se connecter simultanément.

Réservation (obligatoire) et informations : dominique.marion.ibs@sfr.fr

Le Vivant à la loupe

2026-03-25T14:18:33Z

Les scientifiques de l'IBS proposent une approche ludique et pratique pour faire découvrir aux enfants de CM2 le fonctionnement du vivant et l'infiniment petit.

Des ateliers adaptés au niveau des élèves leur permettront de découvrir les molécules qui composent le vivant (les enfants participeront un atelier sur les deux ou trois disponibles).

L'inscription est obligatoire et il doit y avoir un adulte pour 10 élèves

Public : classes de CM2

Durée de l'atelier : 1h30

Thèmes abordés : Biologie, Chimie, Médecine

Dates et horaires : Entre le 06 et le 10 octobre 2026 (un créneau le matin et un l'après-midi dans la même école, 30 élèves max dans chaque créneau)

Lieu : Ces ateliers auront lieu dans les écoles.

Réservation obligatoire : Contact

Fête de la Science 2025 à l'IBS

2026-03-25T13:47:46Z

Lors de l'édition 2025 de la Fête de la Science, l'IBS a mis les sciences à portée des jeunes. Au programme : des ateliers ludiques en CM2, des expériences en direct dans ses laboratoires, et des visioconférences interactives pour les lycéens – de quoi éveiller les curiosités et susciter des vocations dès le plus jeune âge.

Les 6 et 7 octobre 2025, l'IBS a plongé 95 lycéens de Grenoble (lycées Mounier et CLEPT) et de La Côte-Saint-André (lycée Berlioz) au cœur du monde fascinant des protéines ! Au programme : des ateliers pratiques en RMN, microscopie électronique, microbiologie et cristallographie, pour manipuler, observer et comprendre la matière à l'échelle atomique. Une occasion unique de toucher du doigt les outils et technologies de pointe de la recherche.

L'IBS a également organisé des visioconférences interactives pour faire découvrir les métiers de la recherche à 120 lycéens de Première et Terminale, issus de Grenoble, Valence, L'Isle-d'Abeau, Saint-Julien-en-Genevois et Annecy. Animées par un chercheur et une doctorante, ces sessions ont permis d'échanger sur les parcours, le quotidien en labo et les débouchés scientifiques, pour éclairer les choix d'orientation post-bac.

L'action « Le Vivant à la loupe » s'est déroulée, quant à elle, les 7, 9 et 10 octobre 2025 directement dans les écoles, permettant de sensibiliser 137 élèves de CM2 grâce à des ateliers pratiques autour du vivant, avec une introduction suivie d'une activité expérimentale (protéines fluorescentes ou ADN de banane).

Enfin de 4 doctorants ont participé à titre individuel à l'animation des stands ARCANE & GRAL au Parvis des Sciences.

Depuis plus de 20 ans, l'IBS contribue à la diffusion et vulgarisation scientifique auprès des jeunes, et organise des évènements favorisant les échanges entre scientifiques et public scolaire. Un grand merci aux plus de 35 volontaires pour leur investissement, leur motivation et l'inspiration dont ils ont fait preuve encore une fois cette année !

Miner des rubis de protéines venant d'un bioréacteur dégradant le méthane

2026-03-23T08:37:39Z

Les microbes sont d'incroyables chimistes : ils produisent des réactions qui permettent de recycler la matière biologique, de dépolluer les environnements et de contribuer aux cycles biogéochimiques de la Terre. Parmi eux figurent les méthanotrophes anaérobies, des microbes qui consomment le méthane dans des environnements dépourvus d'oxygène. En empêchant le rejet de ce puissant gaz à effet de serre dans l'atmosphère, ils contribuent à atténuer le changement climatique. Cependant, l'étude des réactions chimiques que ces microbes effectuent est difficile, car ces derniers ne peuvent pas être isolés et ne se développent que dans des communautés microbiennes complexes. Deux équipes de l'IBS (dirigées par Tristan Wagner et Antoine Royant), en collaboration avec des scientifiques des Pays-Bas et d'Allemagne, ont maintenant découvert et caractérisé, de manière inattendue, un nouveau type de protéine qui encapsule le fer à partir de ces communautés microbiennes complexes.

Les scientifiques ont directement utilisé une communauté microbienne issue d'un bioréacteur dégradant le méthane pour isoler une protéine de couleur rose vif, qu'ils ont ensuite cristallisée en l'absence d'oxygène afin d'en déterminer la structure tridimensionnelle. Ils ont découvert que cette protéine se présente sous la forme d'une cage, ressemblant à la protéine utilisée par notre organisme pour stocker le fer. Elle a cependant la particularité de contenir un hème, une caractéristique typique de la bactérioferritine. Contrairement aux bactérioferritines traditionnelles, qui s'assemblent en structures de 24 copies protéiques, cette protéine nouvellement découverte forme une cage compacte de seulement 12 copies, créant ainsi un assemblage entièrement nouveau qui pourrait être intéressant pour encapsuler d'autres molécules, comme des médicaments. Les auteurs ont baptisé cette protéine « mini-bactérioferritine » en raison de sa petite taille. L'analyse génomique a révélé que les mini-bactérioferritines ne sont pas propres aux méthanotrophes. Elles sont répandues chez les microbes, mais ont été négligées jusqu'à présent. Cette découverte, publiée dans Communications Biology, nous rappelle le vaste potentiel inexploré qui se cache au sein des communautés microbiennes — et l'importance de continuer à exploiter ces trésors biologiques pour l'innovation scientifique et industrielle.

Référence : Mini-bacterioferritins : structural insight into a ferritin-like protein from the anaerobic methane-oxidising archaeon Candidatus Methanoperedens carboxydivorans. Martijn Wissink, Sylvain Engilberge, Pedro Leão, Robert S. Jansen, Mike S.M. Jetten, Mélissa Belhamri, Olivier N. Lemaire, Antoine Royant, Cornelia U. Welte, and Tristan Wagner. Communications biology (2026) https://doi.org/10.1038/s42003-026-09796-4

Contact : Tristan Wagner, chercheur CEA dans le Groupe Extremophiles et grands assemblages moléculaires (IBS/ELMA)

Collaboration :

Max Planck Institute for Marine Microbiology, Celsiusstrasse 1, 28359, Bremen, Germany
Department of Microbiology, Radboud Institute for Biological and Environmental Sciences, Radboud University, Nijmegen, the Netherlands
Univ. Grenoble Alpes, CEA, CNRS, Institut de Biologie Structurale, 38000, Grenoble, France
European Synchrotron Radiation Facility, Grenoble, France

De la flexibilité à la structure : Repliement progressif d'une protéine au cœur de la communication cellulaire

2026-02-23T16:23:08Z

Les protéines intrinsèquement désordonnées (IDPs) jouent un rôle central dans la signalisation et la régulation cellulaires en médiant des interactions protéine-protéine dynamiques et dépendantes du contexte. Bien que les IDPs existent sous forme d'ensembles conformationnels à l'état libre, elles subissent souvent des transitions de repliement pour former des complexes structurés lors de la liaison à des protéines partenaires. Ce processus est souvent considéré comme impliquant de courts motifs linéaires qui se replient en une seule étape largement coopérative. Cependant, des preuves croissantes suggèrent que les IDPs peuvent suivre des voies plus complexes, impliquant des intermédiaires partiellement structurés.

Des chercheurs de l'IBS (groupes SIGNAL et EPIGEN), en collaboration avec des équipes de l'IAB à Grenoble (Palencia) et de l'ENS à Paris (Bouvignies), ont étudié l'interaction entre la protéine d'échafaudage intrinsèquement désordonnée POSH et la petite GTPase Rac1, une interaction qui déclenche l'apoptose via la voie de signalisation JNK. En combinant la spectroscopie RMN et la cristallographie aux rayons X, ils ont montré que POSH passe d'un ensemble désordonné à un état lié ordonné à travers des événements de repliement séquentiels. Un engagement partiel initial via un motif CRIB ancre le complexe et favorise le repliement d'un premier élément de reconnaissance (MRE1), qui permet à son tour le repliement d'un second élément (MRE2). Chaque étape dépend de la structuration réussie de l'élément précédent, révélant un mécanisme de repliement hiérarchique lors de la liaison. Ces résultats mettent en évidence les intermédiaires de repliement et les transitions conformationnelles comme des cibles prometteuses pour le développement de stratégies thérapeutiques impliquant les IDPs.

Hierarchical Folding-Upon-Binding of an Intrinsically Disordered Protein. LF Kjaer, FS Ielasi, T Winbolt, E Delaforge , M Tengo, LM Bessa, L Mariño Pérez, E Boeri Erba, G Bouvignies*, A Palencia*, MR Jensen*. Nature Commun. (2025), 16, 11346. https://doi.org/10.1038/s41467-025-66420-5

Contact : Malene R. Jensen, Directrice de Recherche CNRS dans le groupe Dynamique Structurelle des Complexes de Signalisation (IBS/SIGNAL)

Financements : Impulscience et ANR ScaffoldDisorder

Parasitologie structurale in situ

CHATELLARD Christine — 2026-02-20T09:09:59Z

Sommaire

Responsable de l'équipe : Thibault Legal

Thématique de recherche

Mon équipe s'intéresse à la leishmaniose, une maladie parasitaire grave qui touche des millions de personnes dans le monde et qui est également présente dans le sud de la France. Elle est causée par des parasites microscopiques appelés leishmanies, transmis par la piqûre d'un insecte, le phlébotome. Une fois dans l'organisme, les leishmanies infectent les cellules du système immunitaire. La maladie peut se manifester par des lésions cutanées, généralement non mortelles, mais aussi, dans certains cas, par une atteinte des organes internes qui peut être fatale en l'absence de traitement.
L'objectif principal de notre recherche est de comprendre, à l'échelle moléculaire, l'organisation interne de ces parasites et la manière dont leur architecture cellulaire leur permet de se déplacer, de survivre et d'infecter les cellules humaines. Nous nous intéressons en particulier au cytosquelette, principalement composé de microtubules, qui détermine la forme du parasite, sa polarité et ses capacités de mouvement.
Chez Leishmania, les microtubules forment à la fois le cil (ou flagelle), structure essentielle à la mobilité du parasite, et un réseau sous-jacent à la membrane qui confère au parasite sa forme caractéristique et sa résistance mécanique. La dynamique et l'organisation de ces microtubules sont régulées par des protéines spécialisées, dont les rôles restent encore largement méconnus.
En analysant la structure et le fonctionnement du cil et du cytosquelette du parasite, notre équipe vise à identifier les mécanismes moléculaires indispensables à la survie et à l'infectiosité des leishmanies. À terme, ces connaissances fondamentales contribueront au développement de nouvelles approches thérapeutiques contre la leishmaniose, une maladie pour laquelle les traitements actuels restent limités.

Approches méthodologiques
Pour répondre à ces questions, nous employons principalement des techniques de microscopie cryo-électronique, incluant la tomographie, l'analyse de particules isolées, le moyennage de sous-tomogrammes et le fraisage par faisceau d'ions focalisés. Les images obtenues sont traitées par des méthodes informatiques, incluant l'intelligence artificielle, afin de reconstruire des modèles tridimensionnels des structures internes du parasite.
Ces approches d'imagerie sont combinées à des outils de biologie cellulaire et génétique, permettant de modifier ou supprimer des protéines spécifiques du parasite et d'en analyser les effets par microscopie optique.

Mots-clés
Leishmania ; cryo-tomographie électronique ; cryo-microscopie électronique ; parasitologie ; cytosquelette ; microtubules ; kineotplastid ; intelligence artificielle

Nous rejoindre ?
Les candidat(e)s intéressé(e)s doivent contacter directement Thibault Legal (thibault.legal@gmail.com) pour discuter des opportunités disponibles.
Offre de thèse en cours : date limite de dépôt de dossier : jeudi 9 avril 2026 23h59.

Publications

2025
Legal, T.*, Joachimiak, E.*, Parra, M., Peng, W., Tam, A., Black, C., Valente-Paterno, M., Brouhard, G., Gaertig, J., Wloga, D., Bui, K. H. Structure of the Ciliary Tip Central Pair Reveals the Unique Role of the Microtubule-Seam Binding Protein SPEF1. Current Biology. https://doi.org/10.1016/j.cub.2025.06.020 *Co-first authors

2024
Gao, J.*, Tong., M.*, Lee, C., Gaertig, J., Legal, T.#, Bui, K.H.# DomainFit : Identification of Protein Domains in cryo-EM Maps at Intermediate Resolution using AlphaFold2-predicted Models. Structure. https://doi.org/10.1016/j.str.2024.04.017 #Co-corresponding authors

Weber, J.*, Legal, T.*, Lezcano, A.P., Gluszek-Kustusz, A., Paterson, C., Eibes, S., Barisic, M., Davies, O.R., Welburn, J.P.I. (2024) A conserved CENP-E region mediates BubR1-independent recruitment to the outer corona at mitotic onset. Current Biology. https://doi.org/10.1016/j.cub.2024.01.042 *Co-first authors

2023
Legal, T., Parra, M., Tong, M., Black, C.S., Joachimiak, E., Valente-Paterno, M., Lechtreck, K., Gaertig, J., Bui, K.H. CEP104/FAP256 and associated cap complex maintain stability of the ciliary tip. Journal of Cell Biology. https://doi.org/10.1083/jcb.202301129

2020
Legal, T., Hayward, D., Gluszek-Kustusz, A., Blackburn, E.A., Spanos, C., Rappsilber, J., Gruneberg, U., Welburn, J.P.I. The C-terminal helix of BubR1 is essential for CENP-E-dependent chromosome alignment. Journal of Cell Science. https://doi.org/10.1242/jcs.246025

Membres de l'équipe

Thibault Legal

La structure fibrillaire de la protéine CAHS-8 des tardigrades : la clé de leur résistance au stress

2026-02-18T10:20:02Z

Les tardigrades sont des animaux aquatiques microscopiques qui présentent une résistance remarquable au stress environnemental, par exemple aux radiations, températures cryogéniques ou la dessiccation. Bien que les origines de cette extrême tolérance restent peu comprises, on sait que les protéines intrinsèquement désordonnées jouent un rôle crucial, permettant aux tardigrades de survivre dans un état dormant pendant de longues périodes et de fonctionner normalement lorsqu'ils reviennent dans des conditions ambiantes. Les chercheurs du groupe FDP de l'IBS ont déjà démontré que ces protéines subissent une transition conformationnelle réversible en réponse aux changements environnementaux, s'auto-assemblant pour former un hydrogel fibreux, une transition considérée comme essentielle à la résistance au stress des tardigrades.

Grâce à une collaboration entre les groupes FDP et MEM de l'IBS et l'ESRF (Max Nanao), les chercheurs ont pu combiner la cristallographie aux rayons X, la RMN et les microscopies à force atomique et électronique, afin de déterminer la structure de ces fibrilles, qui sont formées à partir d'une hélice étendue qui se dimérise via deux interfaces situées sur des faces alternées de l'hélice, permettant un mode unique d'assemblage de la fibrille.

Cette structure permettra de mieux comprendre les bases moléculaires de la résistance au stress chez les tardigrades, tout en ouvrant de nouvelles perspectives pour la conservation de la biomasse ou la conception de protéines tolérantes au stress.

Fibril Structure of Desiccation-Protective Tardigrade Protein CAHS-8. Malki A, Teulon JM, Mikkola EA, Maurin D, Pellequer JL, Nanao MH, Blackledge M. Angewandte Chemie International Edition 2025 ; e19912.

Contact : Martin Blackledge, chercheur CEA du Groupe Flexibilité et Dynamique des Protéines par RMN (IBS/FDP)