Présentation

MOTS-CLES

Pseudomonas aeruginosa,Francisella tularensis, Klebsiella pneumoniae, résistance aux antibiotic , toxines, interaction hôte - pathogène, régulation, signalisation, infection nosocomiale, anti-virulence

SUJETS DE RECHERCHE

• Les facteurs de virulence de P. aeruginosa
  * Système de sécrétion de Type III – structure, fonction et inhibition
  * Mécanismes d’action de la toxine ExoU – trafic intracellulaire
  * Protéines de sécrétion à deux partenaires – ExlA et PdtA
• Les réseaux de régulation de P. aeruginosa
  * systèmes à deux composants impliqués dans la virulence et la formation des biofilms
• Résistance bactérienne vis-à-vis du système immunitaire – mécanismes de persistance (Pseudomonas et Klebsiella)
• L’enveloppe de P. aeruginosa
  * Résistance aux peptides antimicrobiens (AMP)
  * Etude de l’élongasome / divisome
• Mécanismes de virulence de Francisella tularensis
  * Mécanismes d’échappement au système immunitaire inné
  * Facteur de virulence : système de sécrétion de type VI

TECHNIQUES SPECIFIQUES

• Génétique bactérienne (production de mutants KO)
• Bactériologie cellulaire
• Cribles à l’échelle génomique (CRISPR-Cas et Transposons)
• NGS (Tn-Seq, WGS, DAP-Seq, CHIP-Seq, RNA-Seq...)
• Microscopie (Microscopie à fluorescence, IF, 3D vidéo, microscopie confocale spinning-disk, microscopie automatisée et analyse d’images (MicrobeJ))
• Interaction hôte - pathogène (modèles d’infection ex : Galleria mellonella, macrophages, cellules épithéliales et sang humain)
• Compétitions bactériennes (E. coli, Pseudomonas sp, Acinetobacter, Bacillus sp…)
• FACS (mesure des cytokines, détection et quantification des protéines de surface, test d’injection des toxines du T3SS en utilisant system rapporteur beta-lactamase, tri de cellules et de bactéries)
• Expression et purification de protéines (chez E. coli, P. aeruginosa et en cellules eucaryotes)
• Protéine-protéine et protéine-lipides interactions, purification de radeaux lipidiques

COLLABORATIONS

• Harvard Medical School, Boston, US (Steve Lory)
• Department of Medical Microbiology, Ultrecht, NE (Susan H.M. Rooijakkers)
• Institut Pasteur, Paris (Carmen Buchrieser)
• Équipe « Gen&Chem », Grenoble (Marie-Odile Fauvarque)
• EDyP-Service, Grenoble (Yohann Couté)
• Département de Pharmacochimie Moléculaire, Grenoble (Yung-Sing Wong)
• IBS, Grenoble (Andrea Dessen et Pascal Poignard)
• Equipe I2BA ’"Inflammation, infections bactériennes et auto-inflammation", CIRI, Lyon (Thomas Henry)
• TrEE Team, TIMC LAB, Grenoble (Audrey Le Gouellec)