Les facteurs de virulence de P. aeruginosa
* Système de sécrétion de Type III – structure, fonction et inhibition
* Mécanismes d’action de la toxine ExoU – traffic intracellulaire
* Protéines de sécrétion à deux partenaires – ExlA et PdtA
Les réseaux de régulation de P. aeruginosa
* systèmes à deux composants impliqués dans la virulence et la formation des biofilms
Résistance bactérienne vis-à-vis du système immunitaire – mécanismes de persistance (Pseudomonas et Klebsiella)
L’enveloppe de P. aeruginosa
TECHNIQUES SPECIFIQUES
Génétique bactérienne (production de mutants KO)
Bactériologie cellulaire
Cribles à l’échelle génomique (CRISPR-Cas et Transposons)
NGS (Tn-Seq, WGS, DAP-Seq, CHIP-Seq, RNA-Seq...)
Microscopie (Fluorescence, IF, 3D Vidéo, microscopie confocale à disque tournant, microscopie automatique et analyse d’image)
Microscopy (Fluorescence microscopy, IF, 3D video, confocal spinning-disk microscopy, automated microscopy and image analysis)
Host-pathogen interaction (infection models eg : Galleria mellonella, macrophages, epithelial cells and human blood)
Intra-bacterial competition assay (E. coli, Pseudomonas sp, Acinetobacter, Bacillus sp…)
FACS (cytokines measurements, detection and quantification of surface proteins, T3SS toxins injection test using beta-lactamase reporter system, tri de cellules et de bactéries)
Expression et purification de protéines (chez E. coli, P. aeruginosa et en cellules eucaryotes)
Protéine-protéine et protéine-lipides interactions, purification de radeaux lipidiques
COLLABORATIONS
Harvard Medical School, Boston, US (Steve Lory)
Department of Medical Microbiology, Ultrecht, NE (Susan H.M. Rooijakkers)
